Contig Sequence (1699 bp)
>U35_997 1699 Hv_44K_v2
GAGAACACGTTATGGCATCCAATTTCTGTCCTGCTCATGTTTTTTCAGTTCCTATGCTCT
GTTCCGCAGAGGCTCTAATTGACTTAAGGTTACTGAGTGAGGGCAACCAGTTGTGTCCTA
CTAAAATTATGCTTTGATATAAATTTTAACGCAGAGTGCAATTTGTTTACTAATCAGCTA
TTTTAATTTCTCGATTACACAACTACCATGCTCGATTCAAGCCTCAAATTTTGTTTTTTG
GACTTCCCTTTTATCAGATAAAATCAGGAGGTCTAGTTGTTTGGACAAAAGGAGACGTTC
ATTTTGTTTACAGATGAAGTAGTTATCTAGAAAACATAAAACATCGTCAGAAGTCCATAG
CTGATATTCAGAGAGTTCCCCTTGAAAAATGCACTGCGCCTGAACCCCAGTGGAAACACG
AAAGCAACGCCGAGCCTTCAACAAATCATAATGATGATGCTCATGGTGTTTTCTGAGGGA
TTGATCCAAGCCTTGCTGTTCACGCATATGAAGAACCTGTCGAAGGAACAGTCTATGAGA
GAGAAGTCAACAGACTGTTGGACAGCTTGGGCCCTCGGTTTGTAGATTGGTGGTGGAACA
CGCCATTGCCTGTGGATGCTGATCTCCTTCCAGAAGTTGTTCCAGGATTCAAAACTCCAT
TTAGACAGTGCCCTCCTGGTGTGAGACCAACACTAGCAGATGAGGAGCTGACATACCTGC
GCAAGCTTGCACGTCCTTTGCCAACACATTTTGCTCTAGGATGATTAAGTATTAACTGCT
TCCGGCACCCTTACCTTCTTATGCATACATCACCTTAATGTTCCACACAAAATAATGTAG
AAGCACAAGAAAGCTGGTTCTTCAGATTCCTCGGTCCTCTGCAATTTCTTTGCTACAAAA
AATACGGCAGCTAGGAGGCATTGCCATTATGCATACATTGGTGGCCTGCCTCCATCAAAC
TGAACCTGAGCAACGGGTTTTAGCGGCTAAGCTTTTCCTTCAATTGGATATGCTGCAACA
ACAGATAAAATCAAAAATTGGGCCAAGAGCTGCTGTTGTTGTGAGCGCGCGACAGGAAAG
GAACGATGCCATAGTTGAGCTAAGAGAAAAACAGGGCAAAAAATTGGTGAACGACGCCAT
AGTTATAAAATAAAGAATGCATTCACCTAACCCTTTAAAACATTTTTAAAAGGAGGCTGC
ATGATATGAACAAAGGAATTTGGACACATTCATGTAGGTATACTGGTCTGATTATTAATT
TTATGTTAAATTTTCTCCACGTACTTGTACAGTCAAGCAAGATTGAAGTTCCAATTGGGC
CTCTTCCCTGGGCGCCACTCTCCCTCTGCTCCTTCATGGACGAGGAGGACCACCCACGAC
GATGAACATGTGTGACCTCACCCCCGAGCCTGACGAGCTCGACAACAACAACATCGTCAA
CCTTGATCTCGATGACAAGGTTGATCTCTAGCTTAGTGCCGACACCGAAGAGCAAGCCCG
CCTTCTCCAGAGTTTGCAAAGGAGCTTTACGTTCAGGGCATGGTTGTTTGCACAGAGTGG
CGGAAACTACTTTGATCCTTTGGAAGATAGTTCTTCATAATGTGATAGTGTATAGGCCTT
CTTTCTGAGGACCTACTGCTCAACTACTGCACTCCTTGGCTGCTATCGACCAAAAATTTT
ACAAAAAAAAAAAAAAAAG
Homology of Contig U35_997 to Model Species (E-value threshold 1e-50)
Pseudo-peptide dataset | Hit | Hit length | E-value | Description |
---|
Rice v7 | LOC_Os08g27150.1 | 742 | 3e-60 | protein|chloroplastic group IIA intron splicing facilitator CRS1, chloroplast precursor, putative, expressed |
Brachypodium v1_2 | Bradi3g21852.1 | 731 | 4e-72 | |
Arabidopsis v10 | None | | | |