- Probe ABC07126
- Source Contig ABC07126
Affymetrix Source Sequence (2359 bp)
>ABC07126 2359 TCTGCTCCCCCACAACAGCGCGCTTCTCGCCACCACCACCCTAACCCTAGTTCCCCCGCC GCCATGGCCGACGACCACTACTCCTCCAAGCGCAAGTACGACGACTCCCCGCCGCCGCGC CGCACGGGATTCTCCTCCGGCCCACCGCCTGCCTCGCCGCCGGTTGCCGGTGGCCCGGTG CCATCTTCGTACAATACTGTGCCGCCGCCTCCCGACGAGATCCAGCTCGCGAAGCAACGC GCGCAGGAGATCGCAGCTAGGCTCTTCAGCGCCGCTGAGGCGAAGCGTCCCCGTATAGAC AACGGCGACGACGACGTTGGCACCGGTGGCGGAGGAGGTTCCCTGGGGGGCGGTGGCCGT ATCGGTGGCGGCGGCCTCGGATTCTCGTCCTCAGCCGGTGGTGGCCATGGTTCTTCCCTC CCTCCCTTATCTTCTCAAGGAAACTCGCATCAGTATTCTTCATATGGTGGTGGATACCAG AGTGGTAGTACAACAAAAAAGATTGATATCCCAAATGGAAGGGTTGGTGTTATCATTGGC AAAGCTGGAGAAACTATAAAGCATCTCCAAGCTCAGTCAGGGGCAAAGATCCAAGTAACA AGGGACATGGATGTTCAACCTGGCTCACAGACAAGATCGGTTGATATTTCGGGCACTCCT GACCAGATAAGCAGAGCTGAGCAGTTGATAATTGATGTTCTTGCAGAGGCTGATGCTGGA TCATCTGGCACTATCTCTAATCGGAAGTACAACGCACCTCAACCTGGTGCTGAGCAATTC CAAATGCAAATTGCTAACAACAAGGTCGGTCTGGTTATTGGTAAGGGTGGTGAGACTATA AAATCCATGCAGGCCAAATCTCAAGCTCGTATACAGGTCATTCCTTTACATTTGCCTCCT GGTGATACTTCAACTGAAAGAACACTGTATATTGATGGTACTGCAGAGCAAATTGAAATA GCAAAGCAGCTTGTGAGTGAGGTTACCAGTGAGAATCGTGCCAGAAATCAAATGTCAGGT GGCTATTCTCAGCAGGGCTACCGCCCTCCTCGTCCTCAGGCCAACTGGGGCGCGCCTGGT GCACCAACAACACAACAGCCTGGTTACGGTTACATGCAGCCTGGAGCTTATCCTGGTGCA CCACCACAGTATGGCCAGCAACCTTATGGCAGCTACCCTCCAGCATCTGGAGGGTATCAG ACAGGGTGGGATCAGTCTTCAAACCAGCAATCACAGCAGCCCCCCCCTGGCACTGGCTAT GACTACTATAACCAACAACAGCAACCACAACAGCAACAATCTGCCACTGGAACTGCTGCA CCTGCTGATGCTAACAACTACAATTACAGCCATCCTCCTGCTAGTTATGCTTCACAAGGG TATGGTGATTCTACCTACTCCCAGCAGAGTGGCGGGCAGCAAGCTTATGACTACTCTGGT TACCAGACCCAAGGGCAGCAGCAGTCTTACTCACAGCAGCCTGGATATGATCAGCAGAGC TATGGGGCATCTGGCTATGGATCAGCTGCTAACTCAACTCAGGATGGCACTGCACCGAGC TATGGTGGTCCAGGTGGCGCTGGTCAAGCATCTCCAGGGCAGCAAGCTTCAACTCCTTCC ACCGGAGGCCAACCGGGTTATCCTAGCCAACCACCTGCTAGTGCTGCTGCATCAAGCTAC CCGGCGCAAGGTTCTGCCCCTCCATCTGGATACGTTGCTCCACAGACACAGCCTGGCTAT GGTCCGCAGCCACCACAACAGGGCACGTATGGTCAGGGTGGTTATGGGCAGCCGCCTCTA CAGGCTCAGAAGCTGCCTTCATCTGCTCCTACTTATGGACAGGCACCGCCTGCTCAGGCT GGATATGGGCAGTATGGATACAGTCAGCCAGGCTATGGTGCTCCACCGCCTTACCCTGGT GCACCTACTGCTAGCCAGCCAGGCTATGGCCAGCAGCAGTCATACGGTGATCCTTATGCT ACTGGTAGCTATGGGCAGCCTACTGCTTATTCTACTGAAGCCACAGCACCTGCTGCGTCC CAGGATCAATCTGCCGCCGCACCTGCGCCTACCACAGCAGCTGCCGCTCCTGCTACTGCC AACAGTGGTGCCCCCCAAACTTCTCCGAGTTGAGCTACCTGCCTCAGCTGCATCTGAAAT CTGGTTTCCTTGGCTCTGCTGCTTGAAGTATAATCCTCAGTTTACCCATGTTATCTTACT GATTGCTTTATTGTGAACTTTATATATTGCTATATTATTATCCTTGTTTTGCTGCTCTCG AACTCGAACTGCTTGTGATCTCTGGTGCAACCTATACTAGGTTTGGATAATCTGAAATGC AACTGTATTCAATTTTGCT
Probe Sequence's BLAST hits in Barley MLOC transcripts
| Hit | Hit Length | E-value | Position on Hit | % Identity | Match | Agilent Probes on MLOCs | Affymetrix Probes on MLOCs |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLOC_60294.2 | 2465 | 0.0 | 22 - 2380 | 99 | 2357 / 2359 | CUST_20179_PI390587928 | ABC07126 ABC39121 ABC39251 ABC41063 |
| MLOC_60294.1 | 2032 | 0.0 | 221 - 1588 | 100 | 1368 / 1368 | CUST_20179_PI390587928 | ABC07126 ABC39251 |
| MLOC_60294.3 | 946 | 0.0 | 3 - 880 | 100 | 878 / 878 | None | ABC07126 ABC39121 ABC41063 |
| MLOC_1163.1 | 770 | 1e-151 | 80 - 482 | 91 | 368 / 405 | CUST_20963_PI390587928 | ABC07126 ABC39121 ABC41063 |
| AK354961 | 1959 | 4e-146 | 623 - 991 | 92 | 342 / 371 | CUST_34416_PI390587928 CUST_20963_PI390587928 CUST_26904_PI390587928 | ABC07126 ABC39121 ABC40829 ABC41063 ABC49808 |
| MLOC_39224.1 | 745 | 2e-114 | 2 - 289 | 93 | 269 / 290 | CUST_26904_PI390587928 CUST_34416_PI390587928 | ABC07126 ABC39121 ABC41063 |
| MLOC_31190.1 | 817 | 1e-110 | 166 - 516 | 87 | 312 / 357 | None | ABC07126 |
| MLOC_28883.1 | 790 | 5e-110 | 299 - 639 | 88 | 306 / 348 | None | ABC07126 |
| AK368102 | 2720 | 9e-108 | 1535 - 1883 | 87 | 309 / 355 | None | ABC07126 |
| MLOC_3080.1 | 1812 | 9e-108 | 795 - 1143 | 87 | 309 / 355 | None | ABC07126 |
| MLOC_3080.2 | 2851 | 9e-108 | 738 - 1086 | 87 | 309 / 355 | None | ABC07126 |
| MLOC_3080.4 | 1289 | 9e-108 | 235 - 583 | 87 | 309 / 355 | None | ABC07126 |
| MLOC_3080.3 | 3076 | 9e-108 | 841 - 1189 | 87 | 309 / 355 | None | ABC07126 |
| MLOC_3080.5 | 2244 | 9e-108 | 280 - 628 | 87 | 309 / 355 | None | ABC07126 |
| MLOC_76761.1 | 190 | 2e-75 | 3 - 190 | 94 | 178 / 189 | None | ABC07126 ABC39121 ABC41063 |
| MLOC_32089.1 | 1252 | 7e-64 | 205 - 562 | 80 | 289 / 361 | CUST_34279_PI390587928 | ABC07126 |
| MLOC_26524.1 | 350 | 9e-58 | 162 - 347 | 89 | 170 / 192 | None | ABC07126 |
| MLOC_42349.1 | 510 | 2e-54 | 382 - 509 | 97 | 126 / 130 | None | ABC07126 |
| MLOC_32089.2 | 1127 | 3e-52 | 223 - 404 | 87 | 159 / 182 | CUST_34279_PI390587928 | ABC07126 |