- Probe ABC00270
- Source Contig ABC00270
Affymetrix Source Sequence (1788 bp)
>ABC00270 1788 TTGGTAGGGAATTGGTTGTTGGGGTTGGGGAAATGGTTGTTGTGGTTGCGAGGGGAATGG TTGTTGGGGCTGAGGAAAAGGTTGTTGTGGTTGCTGTGGGAATGGTTGTTGTGGTTGCTG GGGGAATGGTTGTTGTGGTTGCTGTGGGAATGGTTGTTGTGGTTGCTGGGGGAATGGTTG TTGTGGTTGCTGTGGGAATGGTTGTTGTGGTTGCTGGGGAATTGGTTCTTGGGGCTGGGG AAATGGTTGTTGTGGTTGCCTGGGGAATTGTTGTTGGGGCCGAGGAAGAGGTTGTTGTGG TTGATGGGGGAATGGTTGTTGTGGTTGTAGGGGGGTTGGTATTTGATATTGGGGAAACAA TTCCTCTGGTAGATAGGGGAAATATTGTTGGGGTGTGTGAAACGGTTGCTGCACTGGAAA TGGTTTTTGCGGTAGATATGGGTTTTGTGGATATGGCTGCTGCAGATATGATTGTTGTGG TGATTGCAACTCTTGGCTGCTAGGGTTTAGTTGCCTAGCGGTAGTGACGATGCTCATCAC CATGGCAAGGAGGACAAAGGTGAGGAAGGTCTTCATGTTGGATTTGTGGTTACTATTGCT TTCTTGGAATTGATGTTTCTGATCTTGGTGTGTGTGCCAATTGGTCTAAAGATGGTTTGT AGTATTGTCATTGAAATCCTCAAGTTGACCTCTGATGAAGCACCTAAGCATTGCGGCCTG TGTTGGATTGTTGTGGGTGACAGATTTGTTCTGGTTCACACGGATATATGGTGTTGGTAC ATTATTGTATAAAAGTCACGCTCTGTAAAAAAGGCGGAGAGTTTAAGCACCATCAATTCC ACATCCAGCAGTGATTGATACCCAGTTCAGTTCTGCAGCCCCTTCGACTTGTGTTAGTTG TAGATGTTGAGAGTGAAGCCTTGTGCAGTGTTCTTTGGATCTTGTCTAAGCCATGTGCTA CCTTTCTGTGGAGATCGACAATGTTGATGCCCAGTGTGGTCCGCACTGGTATTCAGGAAT CAGGGCGACGCTTTTATCTTGTTTTATACTGATGATGGTCTTGTTGATTTTGCAGATGTG AAGGATATTAAGTGCGTGATTAATTTTGATTTCCCGACAACTATCGAAGATTATATTCAC AGGATAGGTCGAACTGGCCGTGCTGGTGCTACTGGAATGGCCTTCACGTTCTTCACCCAT TCCAATTCAAAATATTCAAGGAATCTCGTTAAGATCTTGCGTGAAGCTGGACAGGTTGTG AATCCAGCGCTAGAAGCTATGTCCAAGTCAGCTGGTTCCATGGGAGGAGGAAGTAATTTC CGGTCAAGGGGCCGAGGTGGGTTTGGTGGTGGTGGGTATGGTGGTAACCGTTCTGGATCG AATTCCATTCCAGTACGTAGAAGATACTAAGAAAGAAGATCCATTCTCATGCTGGAGAAG ACAGAAAGATGAAGTTTTATCTGCATACATTTAGGCATTAAATTAAATACATTTTTTGGG GGAATTTCTTTGAAATCCTGCAACTGGTAGAAGATCGAAACAAAGTTCTTAATATTTTTG TACTGGGGCTCATATGAAAAGGAACTCATGTATCAGCGACTATAGATTACGATAGTCCAA TCGAAACAGTGAACTAAGCATGTATTTTGTGTCTAATTGTCGGAGATGCCCTTTGTGTTG CTTCTACATTAGTCGTCCCTGTGTTTGCTTCTGTATCTCTCTGTATCTGAAGGGCTCTCC CATATCCAACCGAAGTCGAGGTTCNNANNANAAAAAAAAAAAAAAAAA
Probe Sequence's BLAST hits in Barley MLOC transcripts
| Hit | Hit Length | E-value | Position on Hit | % Identity | Match | Agilent Probes on MLOCs | Affymetrix Probes on MLOCs |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLOC_58279.2 | 3860 | 0.0 | 1 - 1100 | 100 | 1100 / 1100 | CUST_36073_PI390587928 CUST_36075_PI390587928 | ABC00270 ABC00658 |
| MLOC_58279.1 | 2494 | 0.0 | 1 - 661 | 100 | 661 / 661 | None | ABC00270 ABC00658 |
| MLOC_58279.3 | 2350 | 0.0 | 1 - 660 | 100 | 660 / 660 | None | ABC00270 ABC00658 |
| MLOC_29227.1 | 492 | 6e-173 | 20 - 491 | 90 | 438 / 488 | None | ABC00270 ABC53003 |
| MLOC_71443.1 | 725 | 4e-165 | 60 - 683 | 84 | 529 / 629 | None | ABC00270 ABC49398 ABC53003 |
| MLOC_23452.1 | 436 | 1e-155 | 15 - 436 | 91 | 384 / 422 | None | ABC00270 ABC49398 ABC53003 |
| MLOC_46440.1 | 875 | 2e-132 | 613 - 875 | 99 | 261 / 263 | None | ABC00270 ABC49398 ABC53003 |
| MLOC_20043.1 | 597 | 8e-132 | 10 - 474 | 85 | 400 / 468 | None | ABC00270 ABC49398 ABC53003 |
| MLOC_32170.1 | 243 | 1e-124 | 1 - 243 | 100 | 243 / 243 | None | ABC00270 ABC53003 |