Microarray Probes on PGSC0003DMT400034022
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_51424_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
GATTACATTGGGTATGTTGTTGTTGTTGTTGTAATACTTTGTAGGTCTATCGGAAACAAC |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400034022
Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)
Source Transcript PGSC0003DMT400034022 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT5G12890.1 |
+2 |
5e-100 |
317 |
193/495 (39%) |
UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | chr5:4069658-4071124 REVERSE LENGTH=488 |
Transcript Sequence (1898 bp)
>PGSC0003DMT400034022 1898 pgsc_dm_v3.4
ATCTCTTTCTACCAAAAAAAAAAACCATAATTTTCTCAAAAAAAATAAAATGAGTGACCA
TCAAGAACATATAGTAATCCTTCCATATCTAGCACTTGGCCATATGATACCTTTCATAGC
CTTAGCCAAAAAAATTCAAGAAAGAACTAACTACAAAATCACTATTGTTAGTACCCCTTT
AAATGTCAAATATCTTAATTCCACTATAGCCAAAGATTCAACTAATTCAAATAACATTTC
ATTAGTTTCACTTCCTTATAATAGTAGTGAACATGGTTTACCACCAAATACAGAGAACAC
AGAGGCCTTACCATTAAAACACATGGTAACAATTTTCAACTCAACATTATCTCTTAAAGA
ACCACTCCAAAAATTGATTCTTGAAATTATTGAAAAAGATGGTAAGCCCCCTCTTTGTAT
AGTTTCTGATACATTTATGGGATTTGCTAGTGAAGTTGCAAGATCTTGTGGAACTTTTAA
TGTGAGTTTTACTACTGCTGGTGCTTATGGAACAGCAGCTTATGTGTCACTATGGTTAAA
TCTTCCTCATTTGTTAGCTATTGATGGGGTTTTCAAAATGCCTGGTTTTGATGATTCTTG
TTGTTTTTTCTCTGTTGATCAACTTCATCCATTTATGAAATTAGCTAATGGGGATGACCC
TTGGTCTAAAGTGGTGAAATCTTTGTTATTACCTTCTTTTGATTCTATAGGGTTTTTGTG
TAATAGTGTTGAGGATATTGAACCTATGGGGGTTAAAGCTATCGAGAATCTTACTAAACT
TCCTGTTTGGTGTATTGGACCTTTGCTTCCTCAATGTATGCTCAAGAAAAGTGAAAAAGA
TTCAATCTTTGAATCAAGAATAGGTAAAGAACATGGATTGTCGCCAGAAGAATGTATTTC
TTGGTTGAATGAACATCCTGAAAGATCTGTTCTTTACATATCTTTTGGTTCACAAAACAC
AATTAGTACATCACAAATGATGGCATTGGCTATGGGGTTGGAAGAAAGTGAAAGGCCATT
TATTTGGGTGGTTAGGCCACCTATTGGTTTTGACATAAAAGGTGAGTTTAGATCTGAATG
GTTACCAAAAGGATTTCAAGAAAGAGTGTCAAAGAGTAAAAAAGGTCTACTAGTGAAATC
TTGGGCACCCCAATTGCAAATCTTGAGTCATAGTTCAACGGGTGCGTTCTTGACTCATTG
TGGATGGAATTCAGTATTGGAGAGTTTGAGTCAAGGGGTGCCTATCATTAGTTGGCCTTT
GGCTGGTGAACAAGCATTTAATTCAAAGTTGTTGATGGAGGAAATGGGGGTTTGTGTTGA
GTTAACTAAATGGTATTCAAGTGATGTTGATAAAGAGGATGTGAAGAAAGTGGTGGAAAC
TGTTTTGGGAGAAAGTGGAAAAGGGAAAGAAATGAAGGAAAAAGCTAATAAAATTGGGAT
GTGTATTAGAGATGCTGTTAAAGAAGGGGATTTTAAAGGTTCTTCTGCTAAATCATTGGA
TGATTTCATATCTACATTACTTTGTAGAAGAAATATGTCATCTTAAGAAGGAATTTGGAA
GAGTCGAGGATCTTTCTGAAATAGTCGTTCTACCTCCACGAGGTTAAGGGTAAGCATGTA
TACACTATACCCCTCAACCTCACATGTAGGATTACATTGGGTATGTTGTTGTTGTTGTTG
TAATACTTTGTAGGTCTATCGGAAACAACATTTTTATCTTCTCAAGATAGTGGTAAAGGT
TGTGCACATATCGCCATTCTCAGAACTCACTTATGGAATTATACTGGATTTATTATTGTT
ATTGCTGTTGTTGTACTACTTAGTAGAATAAATATGTCATCTTAAGGAGTTTGGAACATT
CTAAGACCTTTTGAATATATATTAAATGCAGTTGATTG
