Microarray Probes on PGSC0003DMT400020318
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_21131_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
ATGAACATTTCATGATGTTCCTGCTTAGAATCCCAGACCTACGAGATGTACAGCTGAGAG |
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Source Transcript PGSC0003DMT400020318 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT2G42620.1 |
+1 |
0.0 |
775 |
417/728 (57%) |
RNI-like superfamily protein | chr2:17756170-17758251 FORWARD LENGTH=693 |
Transcript Sequence (2172 bp)
>PGSC0003DMT400020318 2172 pgsc_dm_v3.4
ATGGCTGCTTTAGCTAGACCCACCATCATTAATGACCTTCCTGATGTAATCCTTTCTAAC
ATAATCGCCGCCGTCTCCGACGTCCGCAGCCGGAACGCCGCCGCACTCGTCTGCCGGAAA
TGGCTCGTCCTTGAACCCACGAGAACTTCCCTCACCCTCCGTGGTAACATCCGTGACCTT
TTCATGTTACCTACTTGCTTCCGATCTGTTACCCATCTCGACCTCTCACTCGTTTCTCCT
TGGGGACATCCCCTCCTATCTCCACGCGCCGCCTCTAGCGACGGTGGCGACGATGCTGAT
TCCATCCTCATCGCACACCTCCTCCGCCACGCGTTTCCTATAGTTACTTCGCTCATTGTC
TACGCACGTAGCCCACATACCCTCCAGTTTTTGCCAGTTCAGTGGCCTCACCTTAAGTAT
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CTGTTTCAAGGATGCCCGCAATTGGGTTCGCTTGATTTATCTACTTTTTACTGTTGGACT
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CTGGAAATACTGAACACGAAATGTCCCAAGTTGAGATCTTTGAAGTTGGGGCAATTTCAT
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TTAACTCCTTTAGCAGCTGCAGGTCTTGAACATTGTCCTAACTTGGAGGAGATCAAGATT
AGAGTGGAAGGAGATTGCAGGCTATGGTCAAAACCTTCAGAGAGGGCGTTTGGGTTGAGC
ACCCTTTTGCGGTACCATAAACTTGTGAAGATGCATTTGGATTGTGGAGATATCATAGGT
TACGCACACACTGCCCCGTCGGGGCAGATGGATTTGAGCTTGTGGGAACGGTTTTATCTC
TTTGGTATTGGAACTTTGAATCTCAAGGAGCTTGATTACTGGCCACCACAAGATAGGGAT
GTTAATCAAAGGAGTCTATCCCTGCCAGCAGCTGGGCTGCTCCAAGAATGCATCACACTC
AGAAAGTTGTTCATCCATGGAACGGCACATGAACATTTCATGATGTTCCTGCTTAGAATC
CCAGACCTACGAGATGTACAGCTGAGAGAAGATTACTATCCGGCACCAGAGAATGACATG
AGTACAGAAATGAGGTCGGACTCCTTGAGCCGCTTTGAAGCGGCTCTAAACAGACGACAG
ATTTGTGATTGA
