Microarray Probes on PGSC0003DMT400011013
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_37878_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
GAGCTCCTGACCACATGTCAATAAGTTGGGGGATTTTAGCTTAAAAGTTTAATCTTATAT |
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Source Transcript PGSC0003DMT400011013 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT3G63520.1 |
+3 |
1e-40 |
157 |
123/409 (30%) |
carotenoid cleavage dioxygenase 1 | chr3:23452940-23455896 FORWARD LENGTH=538 |
Transcript Sequence (2229 bp)
>PGSC0003DMT400011013 2229 pgsc_dm_v3.4
TGAATAATAATTTCTAGAGATGGCTGCTAATAGTTATTCACTACTTCAAGTGGTCACCAA
ATGCTCTTTGCAGAAGCCTTCACGTCCAACCAAACTTGAGCACTCCAGGAATCCACTCTC
ATCTACTTTCAAGCCAATATTACTGAGGGAGTTGGACCATTTTCCAAATATTTCATTAGA
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GAGCTTTCATGCCATTAACGTCTTAAAAGTATACTATGTGATTAGGAATTTTAATATAAG
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AAGATGCTATTGTTAAGGCTTGAACCGATGAGCTCCTGACCACATGTCAATAAGTTGGGG
GATTTTAGCTTAAAAGTTTAATCTTATATATGTTCTATGTTTATTTAATTACCTTGCATT
CAATACTCT
