Microarray Probes on PGSC0003DMT400007974
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_30592_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
TATATCTGGTTCATATTGCTCTTGGCAGGGGGACAAAGGAAGGTGTCATTCTTTCCTTGG |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400007974
Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)
Source Transcript PGSC0003DMT400007974 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT1G29395.1 |
+1 |
5e-16 |
80 |
51/107 (48%) |
COLD REGULATED 314 INNER MEMBRANE 1 | chr1:10288345-10289539 REVERSE LENGTH=225 |
Transcript Sequence (4621 bp)
>PGSC0003DMT400007974 4621 pgsc_dm_v3.4
TTTCTTTCTTTTACAGAGTTCCAATTGATCTAAGTGGAGATAAGATGAAGAGACGTGGAG
GAGTGGTTTGTTCTGCTGCTGCTCTTGCTCCTAGAAATCTGCAGTGGGTCTGTACTATTT
CCTCTGTGTAAGTCTCCTTTACTTCATTGCGCTTACTGGAGTTGGTGCCAAGTTTGCTTT
ATCGTTTGCTGGTAAAATGGGCCATCTAAAGATCTGATTTTTCTTTTCCATTTTGACCAA
GTGAAATTAGGAGTGGTATAAATCTAGTAATTTACTCCCAATGGTGTGGTATGAAACTTT
TTTTAGCACAGTGGATTTTTATTTTTTTGGAACAAGATGGGAGTGACTTCGGTGGAAGAC
AAGATTTGGGAAGCAAAGTTGAGATAGTTTGGGCATGTGATGAATAGATGCGCGGATAGC
AAGTGTGGAGGTGTGAGCGGTTGTCTGGATGGGTTTATGAGAGGTAGAGGTAGACCAAAA
AAATATTGGAGAGATATGATTAGATAGGACATGATGAAGTTGGAGTTCACCGAGGACATG
AGATAGGAAGGTGTGGGGGACACGGTTAGGGTAGAAGGGTAGTAGGTAGGAGTGTATGGA
CTTGTTGTCCATTCTAGTAGTCGTAGTATTACTCTTGTTTCTTGTTCTTCAATTTCTGTT
ATTATATGTTGTTTCGTGTAGTTTGATTATAACATTATTTTGTTGTAGTAATGTTCTGCT
ACAATCTGTAGTTTCTTTTATTTCCATTACTTCTTTTTTCTAGACTGTTTTTATCTTGAC
ACGGGGTCTACCTCTGAGGTAGAGGTCAGGTCTGCTTACACTCTACCCTCCCCAGACTCT
AGTTTGTGAGACTACACTCGGTCTTGTTTTTTTTGAGAAAACTTTTTTTTTTATGACAAG
GGAAACCCGCAGCCGCTACCCTTTGGGTGCGCACAGGGTAAAGCCCCCGCTCCTATGCAA
TAGCTCGCAAACCACATAGGAGAGGTAACCCGCACTAGGCAAGCCCGGTGCGACGAGCTC
GACCCAGAAGGCAAACCCCTTGCTTTCGCTGGCAAGGGATTTCGAACTTGAGACCTCCAA
CATGGAAGTCCCAAGCCCAAACCACTGGGCCACCCCGAAGGGTACTACACTCGGTATTGT
TCAGACAGTTGAGTGGAACTCTAAGTTCACTTAGGTAAATGAAGCCTTTGTTTTTTGTAT
GAGCAAATACCTTATTAGAGTTCCAGCACCAATGAGAACCTTGTAGACAAAATAAATATA
CAAAGTTTAACTCTTATTTTAAAGTTGTTGGGAGCATATGAAGTCCATCAAAGCATTTAC
ATTATTCAAACTACACCAAACATCAAGATGTAAAATGTGATTAGCAAGAGAAACTCCCTT
AAAACACCTCCAGTTCCATTCCCTCAATAAGGGCCAATACAATGCATTATGGAATGTAAC
AAACCTTTCGCAGAGAGTTCTGTGGCTTTCTTCCCGTTCAACTACAATATGTATCTCTAA
AGAATTCGGCATTACCATTGGATCCCAGGTAAATTTACAAACATATTCTGTATGTCAGTA
GTCACCTCAGACTGTAGGAAAAGGAGATTCTGTCCTACATATCCTTCTCTCACATTTATC
ACCTATTTGACAAATCCGTTTCTCTCTTCTCAGGTGTGACACATGCATCATTTTGTGCTG
TCCAATTAAAACAAGATACTTTTAGAGGAACCTTATTTTTTCAAATTAATTGCCAAGACT
CATCCCTCTGGTTTATATATAGTAACACCTGTATATAGTAAACCTCTTTTGTGTGTCACT
AACTCTTCCTTTTCAATTATCCTGTTTTCTCAGTTCAGTTGTCAGCAACAAGGTAACCTC
TCCAATTTCCTGTCTTGAATCTCCTATGATGTTATCCCACCTATTATTTTCTCGACAATA
GGTAATTATGCATTAGGTCGTGATATGTAGCTGGATACGTTTGACATACCTCCTCACAAG
GGATGTGACTAAACCAGTATTCCTACCAAAAATTGATCTTCACACCATTTCCCAATTCAA
CTTAAACATGTTGACTCTGGATTCTTCTCACAGGTTTCTAATATGCACCAATGATCATGT
AGATAATATTTCCATCCATATGATTTTAGGTCTATTTGGTGTCCTTTTAACCCCTTCAAT
CATCACATGATGGCACATGTTGACCTGTGCAGGATGTGGCGAAACCATCTCATTTGACTT
TCTCTCATTTTATCCTTGTGTTCAACTTGGACTTCCAAAGTTTCCAGATTACTTGATGAT
TAAGGGCCACTTACAGGCTAATGTACAAGCTTGATCGTAAAGAGCTAATTTGTTTTAGAT
GTCCCTTCATATTTTTGATGTAACTACTTAGGAGCACACTATTGGTGTACTTCCTTTTGT
TTATAATACCAGTTAACAATCAAAAAAAAAAGAGCTAAGGTGTATAAGGAAAACAGGTTG
CTGGTAGCACCACTCGTTAGAATTTCGAAGCATCAACCAGGAGAGAGCATTGGCCCTTGG
CATTGACACATTAGTTTTGTTTGCCACACACTCTATCGTTAAGGCTTGAGTTAATCCAAC
ACTGTACAGATAGAAAAGATAAAAAGAGTGGGACATGTCCGGAAGTCTTTTTTTTATAGA
TTGTACACTTGTTCCCGTCATGTAACATTAGTTAATATCATTTTTAGGGATTTACTGTTT
GCTTTCTCTTTTTTCTTGTGTCTGACCACATTAATTTCTTTGTTACAAGTGTGTAGAATC
TCAGAAAGATTCAAAGTTTATGCCCTTGTTTTATAAGTCTTGTATAATTTCTGGTGAATA
AACTATCTTTTTTTTTCCTTCTAAAGTAAACCTTGTTCTGCATGCTGTACCATGCTTTGT
ATATTGCAATCTCACAGTCAAATGGTTATTTTTAGGGTTCTCATGCTTGCGAAGGGCACT
GCTATTCACAAGTCTTTTCTTGTTCCTTTATTTGCTTTACAAGCTCCTACGGCAGTTGTC
TCGTGGATCCAGTAAGTCTATTAGCATCTGTGAAGTAGCTTGTGCTTACTTCATTAAGCT
GAATGTTTTTGCAGTACAGCAAACTGACGATAAATGACTTTCAGGGGTGAATATGGCATT
TGGTCAGCATTTTTGGCACTTCTTGTTCGTCTCTTCTTCTCCTTTCCTGGTTGGTTCCTT
TATCACGTGTCTATGGTTTAAACCTCAAATCTTGAAAATTGACAACCTTGTCTTTTGCTT
TCTGTATTTTGTATGTTGTTGGATAGCATTATCCAGCCAATATTCCCTCAGGAAGCAGGC
TATTGAATTGTACCCAATAATTTCCTGGTTCTATTTTAAGGCGAAAATCTCAGCCAATGT
TTGGGTAGGAAGTAAGAAAATATGCCCAACTTTTGTATGTTTACAACCCTTAGTGAATTT
AACATTATAAAGTCATAGTGGGAAGCAGAATATGTATTCATGCTGCTTAGGAAAAAATTG
TGAATGGACATAATTGAAAGTTTGACCCTGTTCTATGTTATCAAAGATGATAAGGAGATC
ATTATCTAAGGTTGTAGTCAAGGGTTTAGCTACTCATTTTCTTTGGACGCTGTTATGTTT
TTAGCTACTACATTCAATCATTTAGATGATTTTCTTTGAAATATCTGACTTTGGTCTTGA
TCATTTGTAGGTGAACTTGAATTGCCATTTATAGCATTATTGATGGTAATTGTGGCTCCT
TATCAAGTTGCAAACCTAAGGTTGGTATATCCTTCTCTATAAATGTTACTTTCTTCTGAT
AGACTAGAGTTATATCTGGTTCATATTGCTCTTGGCAGGGGGACAAAGGAAGGTGTCATT
CTTTCCTTGGCAATAGCAGCTTATCTGGGTTTCCAGCATTTCACACGTGCTGGCAGCTTG
CAGAAGGCGTTTGATCAAGGTTCAATTATTGCCACCCTAGCCATCATTTGTATTATTGCT
GTGCCATGCTTGCTCTTGATTTGATGTTAAACTACAGTGATTTCTCAAAGGAGTCCTGTA
AATTATTTGAGTCATTTGAGGGTTGGAGATCACACAAATAAATATCTTTCTTTAAATCCC
TCGTGTAAATTTCTAGCTGTTTATCCAGTCAAGTTTTTGGGACAAATTAAGGTGAATGTA
TTTATACAGGAATAAATTAGATGAACAAGCTTCCATTAATATCTTATTAATTTCTATACT
TTGGGCAACATCTGGTGCTACTTATCAACGAAACAAAATGATTCTTATTTTGGGTTTTTC
CATTGATGTAAAGAAAGAAAAAGTGTTTCTTTGGGCTATCGCAAGGAATGAGTTTGCAAA
TTCCAGTGGTTCCTCCAAAAGATAAATAACCTCCTTCCAGATTCTACTTGAAATGTAAAA
GTGTAAAAATTTACAAAGGGAGTAACTGCTTTTTGCTTAAGCACAGGGTTGGCACCACTA
CCATGCAGGTCAGACCTGCACATATTTTTGTACGTTCATGTTTCTTGAAGAGTGAGTGGG
GCTTGCAGAGCATGTTTGCTCAATTGAAGTCTTCACATTTTTACAATTTTTTTATTTCTA
ACATGAGTTAACATTCTTCTGGAGTAGTTCAAATATTCTAATTCAATTATGTTATCTCTC
T
