Microarray Probes on PGSC0003DMT400001137
Probe ID | Chip | Probe Sequence |
---|
CUST_18847_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
GTCCTAGTTCCACATATGGTATACTCATGTAGTGGTTAAATTTCTTGTGAAGTAGATTTC |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400001137
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Source Transcript PGSC0003DMT400001137 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
---|
Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
TAIR PP10 |
AT5G22850.1 |
+3 |
0.0 |
662 |
327/474 (69%) |
Eukaryotic aspartyl protease family protein | chr5:7633717-7636298 REVERSE LENGTH=493 |
Transcript Sequence (1907 bp)
>PGSC0003DMT400001137 1907 pgsc_dm_v3.4
TTCATACAAAAATATTTTTTTTTAAATAAAAATCATTCTTTATGTATAATACATAAAAAA
AATATTATTTTTTTCCTGTTGATATGTTCTTGAACAATTTATAGATAAAATTTTAGCTGT
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TCTTTCATAGTAGTAGCCTTAGGTTCTGTTGTTTGTTCAGATATGTCCTAGTTCCACATA
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