Contig Sequence (2860 bp)
>U35_373 2860 Hv_44K_v2
ATTCTCTTCTTCCGGGAGCGCCGCCGCTTCCTCATCCCTCACCTCTCCGCTCGGTAGCCG
GAAGCGAAACCCCAAGAAAGTATAGTCCCAGCGTGACATTCAAAAGCAGTCAAGATGGTG
AAGTTTACAGCGGAGGAGCTCCGTGGAATTATGGATAAAAAGAACAATATCCGTAACATG
TCTGTTATTGCTCATGTTGACCATGGCAAGTCTACTCTTACGGATTCCCTTGTGGCAGCT
GCTGGGATCATTGCCCAGGAAGTAGCTGGTGATGTCCGCATGACTGATACCCGTGCAGAC
GAGGCAGAACGTGGTATTACAATCAAATCCACGGGTATCTCTCTTTTCTATCAGATGACT
CCTGAATCACTCGAGATGTACAAGGGCGACAGGGATGGTGATGAGTACCTGATCAACCTT
ATCGATTCACCTGGCCACGTTGACTTTTCTTCGGAAGTCACAGCTGCTCTTCGTATCACT
GATGGTGCTTTGGTGGTTGTCGACTGTATTGAGGGTGTGTGTGTGCAGACTGAAACTGTG
CTGCGCCAAGCTCTAGGTGAGAGGATTAGGCCTGTTCTTACTGTGAACAAGATGGACAGA
TGCTTCCTTGAGCTTCAAGTGGAAGGCGAGGAAGCATACCAGACTTTCTCCCGTGTCATT
GAAAATGCCAATGTCATCATGGCAACATATGAAGATGTTCTCCTTGGTGATGTCCAAGTG
TACCCAGAGAAGGGGACTGTTGCATTCTCTGCTGGTTTGCATGGGTGGGCTTTCACCCTT
ACAAACTTTGCTAAGATGTATGCCTCCAAGTTTGGAGTTGATGAGGCAAAGATGATGGAG
AGGCTGTGGGGTGAGAACTTCTTTGACCCAGCCACAAAGAAATGGACCTCCAAGAACACT
GGCACAGCTACCTGCAAGAGAGGTTTTGTTCAGTTCTGCTATGAGCCAATCAAGCAAATC
ATTGCCACCTGCATGAATGATCAGAAGGATAAGTTGTGGCCTATGTTGAAGAAGCTTGGT
GTGACCATGAAGAATGATGAGAAGGACTTGATGGGCAAGGCTCTCATGAAGCGTGTGATG
CAAACTTGGCTGCCTGCCAGTCGTGCTCTGCTTGAGATGATGATATTTCACCTCCCCTCT
CCTTCAAAGGCACAGAGGTATCGTGTGGAGAACTTATATGAGGGTCCCCTTGATGATGTA
TATGCAAACGCTATCAGAAACTGTGACCCAGATGGTCCTCTTATGTTGTATGTCTCCAAG
ATGATTCCAGCATCTGACAAGGGTAGATTCTTTGCCTTTGGACGTGTCTTTGCTGGGAGA
GTCGCAACTGGCATGAAGGTCCGGATCATGGGTCCCAACTTTGTTCCTGGCCAGAAGAAG
GATCTATATGTGAAGAGTGTCCAGCGTACTGTTATCTGGATGGGAAAGAAGCAAGAGTCT
GTTGAGGATGTTCCCTGTGGTAACACTGTTGCTTTGGTTGGTTTGGATCAGTTCATCACA
AAGAATGCAACCCTAACAAATGAGAAGGAAGTTGATGCCTGCCCAATCAGGGCCATGAAG
TTCTCTGTGTCCCCTGTTGTGCGTGTTGCTGTTCAGTGCAAGGTGGCATCTGATCTTCCT
AAGCTTGTTGAGGGTTTGAAGCGGCTGGCGAAGTCTGATCCTATGGTTCTCTGTAGCATT
GAAGAGTCTGGTGAGCATATTATTGCTGGAGCTGGAGAGCTTCACCTTGAAATCTGTTTG
AAGGATCTGCAGGAGGACTTCATGGGTGGTGCTGAAATTATTGTTTCCCCTCCTGTCGTC
TCCTTCCGTGAGACTGTTCTTGAGAAGTCCTGCCGCACTGTCATGAGCAAGTCCCCTAAC
AAGCATAACCGTCTTTACATGGAAGCTCGCCCATTGGAGGAGGGATTGGCTGAGGCTATT
GATGATGGCCGCATTGGCCCACGTGATGATCCCAAGGTGCGCTCCAAGATCCTCTCTGAG
GAGTTTGGCTGGGACAAGGATCTTGCCAAGAAGATTTGGTGCTTTGGACCTGAAACGACT
GGCCCGAACATGGTTGTTGACATGTGTAAGGGAGTGCAGTATCTCAATGAAATCAAGGAC
TCTGTTGTGGCTGGGTTCCAATGGGCATCAAAGGAAGGTGCATTGGCTGAGGAGAACATG
CGTGGCATTTGCTTTGAGGTCTGTGATGTTGTTCTGCACACTGATGCTATTCACAGGGGT
GGTGGCCAGGTCATCCCAACAGCCAGGAGGGTCATTTACGCTTCTCAGCTCACTGCTAAG
CCAAGGCTGCTGGAGCCTGTGTACCTGGTTGAGATCCAGGCCCCCGAGAATGCACTTGGT
GGTATCTATGGTGTTTTGAATCAGAAGAGAGGGCATGTGTTTGAGGAGATGCAGAGGCCT
GGTACCCCGCTGTACAACATCAAGGCTTACCTCCCGGTCATCGAGTCCTTCGGGTTCTCA
AGTACCCTCAGGGCAGCTACATCTGGCCAGGCTTTCCCCCAGTGTGTGTTTGACCACTGG
GACATCATGTCTTCTGATCCTCTGGAGGCCGGCTCCCAGTCTGCCACCCTTGTCACGGAG
ATCCGCAAGCGCAAGGGTCTCAAGGAACAGATGACCCCTCTATCTGATTTCGAGGACAAG
CTCTGAACTTTTGATTCTGTTACATGGTCTAGTTTGCTTTATGCTGCTAAGAGAGCTGCG
CTATTTTCTGTCTATTGAGTCCGTCGCTGTATTGCTATTGCAATGTCCTATCTGTCGTGG
TACTGGCACTTTGTTTTGATGTCTCTCGATGTTAAAACTTAGATTATATATCTGTTATGA
TACTGGCATTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
Homology of Contig U35_373 to Model Species (E-value threshold 1e-50)
Pseudo-peptide dataset | Hit | Hit length | E-value | Description |
---|
Rice v7 | LOC_Os02g32030.1 | 844 | 0.0 | protein|elongation factor, putative, expressed |
Brachypodium v1_2 | Bradi3g44160.1 | 844 | 0.0 | |
Arabidopsis v10 | AT1G56070.1 | 843 | 0.0 | | Symbols: LOS1 | Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein | chr1:20968245-20971077 REVERSE LENGTH=843 |