Contig Sequence (2975 bp)
>U35_483 2975 Hv_44K_v2
TCGAGCACTGTTGGCCTACTGCTAGGTGCTCACTTCCTTGAACCCTTTCCATTCTCACGG
ATCGGGAGCGCCGCCGCTTCCCCACCTCTCATCTCTCGCCTCGGGAGACGGAGGCCAGAC
CCCAAGGAACTATATTCCCAGCTTGACATTCAAAATCAGCCAAGATGGTGAAGTTTACCG
CGGAGGAGCTCCGCGGAATTATGGACAAGAAAAATAATATTCGTAACATGTCTGTTATTG
CTCATGTCGACCACGGCAAGTCTACGCTTACGGATTCCCTTGTGGCAGCTGCTGGGATTA
TCGCCCAGGAAGTTGCTGGGGATGTTCGCATGACTGATACCCGTGCAGATGAGGCAGAGC
GTGGTATTACAATCAAATCCACGGGTATCTCTCTTTTCTATCAGATGACTCCTGAATCAC
TTGAGATGTACAAGGGTGACAGGGATGGGGATGAATACCTGATCAACCTTATTGATTCAC
CTGGCCACGTTGACTTTTCTTCGGAAGTCACAGCTGCTCTTCGTATCACTGATGGTGCCT
TGGTTGTTGTTGACTGTATTGAGGGTGTCTGTGTGCAGACCGAAACTGTGCTGCGCCAAG
CTCTTGGTGAGAGGATTAGGCCTGTTCTTACTGTGAACAAGATGGACAGATGCTTTCTCG
AGCTTCAGTTTGAAGGTGAGGAAGCATACCAGACTTTCTCCCGTGTCATTGAAAATGCCA
ATGTCATCATGGCAACATATGAAGATGTGCTCCTTGGTGATGTCCAAGTGTACCCAGAGA
AGGGGACTGTTGCATTCTCTGCTGGTTTGCATGGGTGGGCTTTCACCCTTACAAACTTTG
CTAAGATGTATGCCTCCAAGTTTGGAGTTGATGAGGTGAAGATGATGGAGAGGCTGTGGG
GTGAGAACTTCTTTGACCCAGCCACAAAGAAATGGACCTCCAAGAACACTGGGACAGCTA
CCTGCAAGAGAGGATTCGTTCAGTTCTGCTACGAGCCAATCAAGCAAATCATAGCCACCT
GCATGAATGACCAGAAGGATAAGTTGTGGCCTATGTTGAAGAAGCTTGGTGTGACCATGA
AGAATGATGAGAAGGACTTGATGGGAAAGGCTCTCATGAAGCGTGTGATGCAAACTTGGC
TGCCTGCCAGTCGTGCTCTGCTTGAGATGATGATCTTTCACCTCCCCTCTCCTTCAAAGG
CACAGAGGTACCGTGTGGAGAACTTATACGAGGGTCCCCTTGATGACATATATGCAAATG
CTATCAGAAACTGTGACCCTGATGGTCCTCTTATGCTGTATGTCTCCAAGATGATTCCAG
CATCTGACAAGGGTAGATTCTTTGCCTTTGGACGTGTCTTTGCTGGGAGGGTCGCAACTG
GCATGAAGGTCCGTATCATGGGTCCCAACTTTGTTCCTGGCCAGAAGAAGGATCTATATG
TGAAGAGTGTCCAGCGGACTGTTATCTGGATGGGAAAGAAGCAAGAGTCTGTTGAGGATG
TTCCCTGTGGTAACACTGTTGCTTTGGTTGGTTTGGATCAGTTCATCACGAAGAATGCAA
CCCTGACAAACGAGAAGGAAGTTGATGCCTGCCCAATCAGGGCAATGAAGTTCTCCGTGT
CCCCTGTTGTGCGTGTTGCTGTCCAGTGCAAGACGGCTTCTGATCTTCCTAAGCTTGTGG
AGGGTTTGAAGCGTCTGGCAAAGTCTGATCCTATGGTTCTCTGTACCATTGAAGAGTCTG
GTGAGCATATCATTGCTGGAGCTGGAGAGCTTCACCTTGAAATTTGCTTGAAGGATCTGC
AGGATGACTTCATGGGTGGTGCTGAAATTATTGTTTCCCCTCCTGTCGTCTCCTTCCGTG
AGACTGTTCTTGAGAAGTCCTGCCGTACAGTTATGAGCAAGTCCCCCAACAAGCACAACC
GTCTTTACATGGAAGCTCGCCCATTGGAGGAGGGATTGGCTGAGGCTATCGATGATGGCC
GCATTGGCCCACGTGATGATCCCAAGGTCCGCTCCAAGATCCTATCTGAGGAGTTTGGTT
GGGACAAGGATCTCGCCAAGAAGATTTGGTGCTTTGGACCTGAGACGACTGGCCCGAACA
TGGTTGTTGACATGTGTAAGGGAGTGCAGTACCTGAATGAAATCAAGGACTCTGTTGTGG
CTGGGTTCCAGTGGGCGTCAAAGGAAGGAGCACTATGTGAGGAGAACATGCGTGGCATTT
GCTACGAGGTCTGCGATGTGGTTCTCCACACTGATGCTATTCACAGGGGTGGTGGTCAGG
TCATCCCAACGGCGAGGAGGGTCATTTACGCTTCTCAGCTCACTGCCAAGCCAAGGCTGC
TGGAGCCTGTGTACCTGGTTGAGATCCAGGCGCCGGAGAATGCGCTTGGTGGTATCTATG
GTGTGCTGAATCAGAAGAGAGGACACGTGTTTGAGGAGATGCAGAGGCAAGGTACCCCAC
TCTACAACATCAAGGCCTACCTGCCTGTCATCGAGTCCTTCGGGTTCTCGAGCACCCTCA
GGGCTGCGACGTCCGGCCAGGCCTTCCCCCAGTGTGTGTTTGATCACTGGGACATCATGG
CTTCTGATCCTTTGGACCCCGGCACCCAGTCTGCGACGCTTGTGACGGAGATCCGCAAGA
GGAAGGGTCTCAAGGAGCAGATGACTCCCCTATCCGATTTCGAGGACAAGCTCTAAATTT
TGGGTAATGTTTTGCTACTTGCCCTTGCTGTGAAGGGAGCCGCATTATTTTCTCCCGATG
TGTATCTTGCTGTTTGTATGTGGTGCTACCTGAGACTATGTTTTGATGATGGTTGTGGTG
ATGTAACAGATGTTAAACTTTAGATCATATATATATCTGTCATCAGATTGTGGATCTTTT
TTTAAAAAAAAAAAAAAAAACCCGTGCTTTGCTTTTGTGCTACATCTTGCTTTCGTTTAC
TGTATTTGACTGTATATTTATTGTTGTCTCTAGCA
Homology of Contig U35_483 to Model Species (E-value threshold 1e-50)
Pseudo-peptide dataset | Hit | Hit length | E-value | Description |
---|
Rice v7 | LOC_Os02g32030.1 | 844 | 0.0 | protein|elongation factor, putative, expressed |
Brachypodium v1_2 | Bradi3g44480.1 | 844 | 0.0 | |
Arabidopsis v10 | AT1G56070.1 | 843 | 0.0 | | Symbols: LOS1 | Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein | chr1:20968245-20971077 REVERSE LENGTH=843 |