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Barley RTD
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Exon Structure of HORVU3Hr1G013780.1

ChromosomeExonStartStopDirection
chr3H13056579630564874+


grey: non-coding, green: Barley Morex IBSC 2017 Transcript CDS, red: Barley RTD exons



Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-30)

DatabaseHitFrameE-valueScore% IdentityDescription
Rice PP7None-----
TAIR PP10None-----
BRACH PP3None-----




Barley PseudoMolecules GBrowse

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grey: non-coding, green: Barley Morex IBSC 2017 Transcript CDS, red: Barley RTD exons



CDS Sequence (923 bp)

>HORVU3Hr1G013780.1 923 150831_barley_pseudomolecules
TTATAACTGAAATGCGGATTAATTAACGACATGGATTGGTCATGGTATGAAAAAATTAAA
TTGTGCGCTATTGGTTAAAATTACAGCATAAATAGAATTTTAAAATTATTAAATAGGTAA
AATAACATCATATTTAGATTGTACGCATCACTATTGATTAAAATCACATTGTAAACATAA
TTTTGAAAAACTTAAATAGGTAAACTAACATTATATTCAGATTCTACACATGTTTCTAAT
CAAATTTCATATATAATAATTTAAAATTACAGTTACGGTTTAAAATATATAATTTTTAAA
GTATTTGTCACTTATAATTGAGCTGCGGATTAATTAACAACATGGATCGGCCTCGGTACG
AGATATTGATTATATGCTATTGATTAAAATTACAGCATAAATAGAATTTTAAAATTATTA
AATAGGTAAAATAATAAATAGAAATTTAAAATTGTTAAATAGGTAAAATAACATCATATT
TAGATTGTACACATCACTATTGATTAAAATTACATTATAAATAGAATTTTTAAAACATAA
ATAGGTAAACTAACATTATGTTCAGATTCTACACATTTTAAAATTGGAGTTGCAGTTTAA
AAGATATGATTTTTGAAGTATTTATCACTTATAATCGAACTGTAGATTAATTAATAGAAA
TTGTAGGGAATTTTCTAAAAACATATGAAAAATGATTCGTTTTTTACTTAAGTCTGGGCT
GTAGGTTTATTTTATGAAAACTAAAGAAGGTTTTTACAAAAATTATAAAAAACAATTTCT
TTTCTCACTTAAATCCGAACTGCGGGTTAATTTCGGAAAAATACAGGAGTATTTTATAAA
ATGCACGACGGACGATCAGAAGCACTATTTGTTTTATTATTAGGTAATGAAATGGCTCAC
TGCTACAGCTTTTAAAAGAACTA