Microarray Probes on PGSC0003DMT400079445
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_35389_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
CTTTGGGGGGTTTGTGTTGAAGTGAAGCAACAACCATGTCTACTCTTGTTAATTACAGTG |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400079445
Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)
Source Transcript PGSC0003DMT400079445 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT2G25490.1 |
+1 |
0.0 |
627 |
337/647 (52%) |
EIN3-binding F box protein 1 | chr2:10848018-10850275 REVERSE LENGTH=628 |
Transcript Sequence (2880 bp)
>PGSC0003DMT400079445 2880 pgsc_dm_v3.4
ACAATACTTGTTCTTTTTTTTCTTCTCTACTTTCAACTTTCCTTCTTTTTTTTCCCCTAC
TTAGATAGGGTTTTTGTTGAAATCTTGAACTTTTTCATGTGTAATGCAAATCTTGGTTGA
AGATAAAATTTGGGGTTTGTTGTTCTTGGTGCAAAGTTTTTTTTTTTTTAATTTCCTTTG
GGGGGTTTGTGTTGAAGTGAAGCAACAACCATGTCTACTCTTGTTAATTACAGTGGTGAT
AATGAGTTCTATAGTGGAGGATCACTTTGTTCAGCTGATTTGGGTCTTATGTTGGCTCTT
GGTCATGCTGATATTTACTGTCCTGTTAGTAAGAGGGCACGCATTAGTGGCCCGTTTGTT
GTTGAAGAGAGGACAAAGAATCCATCCATTGAAGTACTTCCCAACGAATGCCTATTTGAG
ATCTTCAGAAGATTGGAAGGAGGCCGTGAAAGGAGTGCAGCAGCTTGCGTTTCTAAGCGT
TGGCTTATGCTCTTGAGTAATATGAGGAGCTCTGATATTCGCCATACTAATCTTTCAGCT
GCTAATGGGGCTTCAGATGATACAAAAATGGCCTCAGCTGATGAAGATCTTGAAGTGGAG
TGTGACGGATATCTTACTAGGTGTTTAGAAGGGAAGAAAGCTACAGACATTAGGCTCTCA
GCTATGGCAGTTGGAACTTCTAGCCGTGGGGGTCTTGGAAAGCTCTCAGTTCGGGGGAGC
AACCCCGTTCGGGGTATTACTAATGTTGGTCTATCAGCAATCGCCCACGGTTGTCCGTCT
CTTAGAGTTCTTTCATTGTGGGATGTTCAGGATGTTGGAGATGAAGGTCTTATGGAGATT
GCAAGAGGATGTCATTCATTAGAAAAGCTAGACTTAACTAAATGCCCCTCAATTTCCAAC
AAAGGTCTGGTTGCAATAGCAGAGAATTGCCCAAGTTTGACTTCTTTGACGATCGAATCT
TGTAAAAATATTGGAAATGAGGGACTGCAAGCTATTGGAAGATGTTGTACCAAATTAGAG
TCTCTTACTATTAAAGACTGCCCTCTTGTAGGTGATCAGGCAGTTGTTAGCCTTCTGTCG
TCAGGCAATACAAGGTTGAAGAAAGTGAAACTTCATTCTCTAAACATTACGGATTTCTCC
CTCGCTGTCATTGGTCACTATGGCAAGGCGATTATCGATCTTAATCTGTGTAAACTTGGT
CACGTAAGTCCGAGGGGGTTTTGGGTTATGGGTGCTGCTCAGGGTTTGCAATCTCTGGCT
TCTTTGACTGTCACTTCGTGCATTGGACTGACGAATCCGAGTCTTGAAGCAGTGGGAAAG
GGCTGCACAAATATTAAAAGCATGTGCCTTCGCGAGTGTGAACGTGTTACTGATAGTGGA
CTTGTTGCATTTGCTCAAGCTGCTGGATCTCTCGAGTATCTCTTGTTGGAAGAGTGCGAC
AAGATCACCCAAACAGGCATCCTAAATGCTGTTTCAATCTGCAGCAAGTTGAAGTCACTT
TCCCTGGTGAAGTGTTCGGGAGTCAGGGATTTGCCTCCACAAGCTTCCTTGTTGTCTCCC
TGTGATTCTCTCCGATCGTTGTCCATCCGAAGCTGTGCAGGATTCGGTAGCAGAAGCTTA
GCTATGGTGGGGAAGCTATGTCCCCAGCTTCATCATTTGGATCTCAGTGGGCTTACTAGA
ATAACAGATGCTGGGCTTCTCCCACTTTTGGAGAGCTCCAAGGCAGGACTCGTCAAGGTT
AATCTTACTCACTGCCTGAACGTGACCGATGAAGTGGTGCTCTCATTAGCTAGGCTACAC
GGTGAGACTTTGGAATTGCTGAATCTTGATGGATGCAGGAGGGTTACCGATGCAAGCTTG
GTGGCAATTGCTGATAATTGTCTATTACTTAACGATCTTGATGTTTCAAAGTGTTCAATA
ACTGATTCGGGTTTAGCTGCTTTATCCCAAGGAGTGCAATTGAATTTGCAGGTTCTTTCA
CTCTCAGGTTGCTCCATGGTAACAAACAAGAGCTTTTCGTCTCTTAGAACATTGGGTGAG
AGCTTAATTGGTTTAAATCTCCAGCACTGCAATGCCATTGGTAGCAGCAGAATCGAGGCT
CTTGTTGAGGACTTGTGGAGGTGTGATATCCTCTCCTAAAAGCCTACTGGAGCACAAGGC
TATGCATCATCCAAAGGTGTTTGAACTACGAGTCGTAGCTATTTGGTTCATTAATCTTGG
TGGGATAGAAGTAAACATGATTGTGGTTTTTGGCTAACTAATGGCCTTGTGATGCTCCAG
TGGCTTGGTTGTTTTCCAGGAGGCTATGACAAACAACTTTTTCCATCCATTTTTTGCAGG
CTTCATCTACTTAAAAGCTTGTTCCACATCGTTCAAACTCCGGTGTCACACGGAGGCTGC
CTCTTACACAACCATGGTATCCTGAGAATACAGTTACCTAAGTCCTGGTGCTAAAGTTTT
CACTAGTGTTGCTCCTTGTCCCGTCCTTCGGGGATGAACTAATAATGCTTCTCTTAAACT
ATATAGATATCATGCATTTGCCTTGATAGTACTACACTGCAGAATCAGACAGTTTTTTCT
TAGTTCTAGTATGTAAGTTTTCGTATTAAGAAGTCGTCCTCGTTGTTACTATAAGTGTTT
TACTTATCATCTTAGTCGTCTGTAGTTGGAATCGAACGATTTCTGTAGCATGGTGTCTGA
TAATCTGGGGCTTGGTCATGGCAACTAGTCCATCTAGGTTGTTTTTCTAGTGTCCAAGTT
CTAGTTTTTGATAGGATTGTAAAAAGTCCTCGATTGTACAGGTTCCTTGTCTTTCAGATT
TGTACTTTGCAACTACTTTGTTATGTGTAATAAACTCTGTTTAGTTTGTCTAAATTGTGC
