Microarray Probes on PGSC0003DMT400079444
Probe ID | Chip | Probe Sequence |
---|
CUST_35354_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
CGATTGTACAGGTTCCTTGTCTTTCAGATTTGTACTTTGCAACTACTTTGTTATGTGTAA |
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Source Transcript PGSC0003DMT400079444 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
---|
Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
TAIR PP10 |
AT2G25490.1 |
+2 |
0.0 |
622 |
335/640 (52%) |
EIN3-binding F box protein 1 | chr2:10848018-10850275 REVERSE LENGTH=628 |
Transcript Sequence (2671 bp)
>PGSC0003DMT400079444 2671 pgsc_dm_v3.4
TGAAGTTCTTGATGTTTGATCTTCAGGTGATAATGAGTTCTATAGTGGAGGATCACTTTG
TTCAGCTGATTTGGGTCTTATGTTGGCTCTTGGTCATGCTGATATTTACTGTCCTGTTAG
TAAGAGGGCACGCATTAGTGGCCCGTTTGTTGTTGAAGAGAGGACAAAGAATCCATCCAT
TGAAGTACTTCCCAACGAATGCCTATTTGAGATCTTCAGAAGATTGGAAGGAGGCCGTGA
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TCTCGAGTATCTCTTGTTGGAAGAGTGCGACAAGATCACCCAAACAGGCATCCTAAATGC
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GGAGAGCTCCAAGGCAGGACTCGTCAAGGTTAATCTTACTCACTGCCTGAACGTGACCGA
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TAACGATCTTGATGTTTCAAAGTGTTCAATAACTGATTCGGGTTTAGCTGCTTTATCCCA
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GAGCTTTTCGTCTCTTAGAACATTGGGTGAGAGCTTAATTGGTTTAAATCTCCAGCACTG
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CCATCTAGGTTGTTTTTCTAGTGTCCAAGTTCTAGTTTTTGATAGGATTGTAAAAAGTCC
TCGATTGTACAGGTTCCTTGTCTTTCAGATTTGTACTTTGCAACTACTTTGTTATGTGTA
ATAAACTCTGTTTAGTTTGTCTAAATTGTGC