Microarray Probes on PGSC0003DMT400072700
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_2080_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
CCTCACTTGCGGGATTTCAGTGATATGTAATTGTTGTTGTTGTGTAGAAACAAAGTTTAT |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400072700
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Source Transcript PGSC0003DMT400072700 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) |
Solyc10g083950.1 |
+1 |
0.0 |
1080 |
542/572 (95%) |
evidence_code:10F0H1E1IEG genomic_reference:SL2.50ch10 gene_region:62970502-62972211 transcript_region:SL2.50ch10:62970502..62972211- functional_description:Nodulin family protein (AHRD V1 ***- D7MWD3_ARALY); contains Interpro domain(s) IPR010658 Nodulin-like |
| TAIR PP10 |
AT2G39210.1 |
+1 |
0.0 |
692 |
342/563 (61%) |
Major facilitator superfamily protein | chr2:16366287-16368231 REVERSE LENGTH=601 |
Transcript Sequence (2078 bp)
>PGSC0003DMT400072700 2078 pgsc_dm_v3.4
CCTCAACCAACATCTTCATAATTAAAAAAAAAAACAAGAAATTCATCAAAAGCCATGGAA
AATTTTGGTCTACACATGCTTGTTGGTAGATGGTTCATGTTTTTTGCTTCAATTTTAATT
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GTTGTTTCTTGTGTTTTACTGAGAGTTATTCGGACTATGAAGGTTAACAAACAAGAAAAT
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