Microarray Probes on PGSC0003DMT400066766
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_17732_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
AAAGAGGGGTGGCTCTGCTTATCGATGTATTTGTGTATATTTAGAAGATTTAAATCAGCC |
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Source Transcript PGSC0003DMT400066766 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT4G22740.1 |
+3 |
1e-28 |
117 |
56/99 (57%) |
glycine-rich protein | chr4:11944050-11945565 REVERSE LENGTH=356 |
Transcript Sequence (1653 bp)
>PGSC0003DMT400066766 1653 pgsc_dm_v3.4
GATCATCTTCTTGAAACAGTGAATAATGTCGAAGCTATTTGGTGGAAAAAACCCTTTTGA
TGATCCATTTTTCACTGAACCATTTGGTGGTTGGTTTGGTTGGAACGACCCGTTTGACGT
ACAGCAAGACTCTCGGAAGCAAATTACCATTGAAGAGTTAAATCCTGAAGGTGATGGTGG
TCAGGCTCAGGAAAATTCTGAACCAACAAAAGACTTGGTTGTTAAGAACAAGAAACCTAG
TCAAAAATCAAATGGTTAGTGCTCTTATTTTAACTTAGGGGTTGTATGTATGGTTGATTC
TACGACATAATTAATCCCAGCATAAAATTACCCCGTATAAAAATAATACAGTGGTTTGTT
GGTTGAGTGTTTCGTTGTAACATTAAGTTACAAAGGAATTTATGTATTGCTAATACTTGA
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CCACCTAGAATCGATCCATGGCCGCTATCGCCCCCTAACTTTGTTCTATTCTATTTGCCT
TCTCCTTAATTTCCATAAATGCGGCTAGCTCTTTTGCTAACGACTGTACGACCATGCATA
ACTGATCTTTGCATTACTAATACCCGCGTAACTAATTCCTATGTTATTAATACTTGCATA
ACTCTAACCACCAACTAAACGACTCCTTAGTGTTAAGCTTAGCTGATTATTGTTATGCAT
ACATTTCAAGTTTTGTGTCTATGGAATGTTTGTGATAGTACTTTACAGGGAGCCAGAGTT
TCAGCTACCGCAGAGTTTCTTATGGTGGTTTAAATGGAATGTACTATACTTGCTCTGAAG
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TTGGGGAGTCTCTGCACACAATCTCCAAAGGGATTCACAACAAGGGCCATTCTGTCACAA
CAAAGCATAGTTCAGATGGGCGAGAGGACACACTGCAGACTTTGCACAATCTCGATGAAG
ATGAGCTTGGTGACTTTGAACAAAATTGGAAAGCTAATGCTGATAAGTATTTCCCTGGAC
GGGATAAGGGTTCAGCCTGCTGGAGAATCAAGGGTCCATAAGCAGCTTGTGGGATGAGTT
TGCAAATTGGAGGGGCTTGGGTGGTTATGAACATCCAGCTCTGGAGTACTATGGAAATAC
AGGACCGGTGGTGCAAGTCAGTGAATCAGGGGAAGATTCTTCTAGGAGAGCCACAAGAAG
AGTCCCAGTGGAGTAGAGGGAGGCTTCCTTTGATGATGAAATTAGTGGTACCTCTTATAT
CCTACCAGTGTAGCCTACTTACATGTTTTGACCTGTTCTATTATCAGAGTTTAGTGTCTC
TTGTCGGTTCGCGTTGAGCATGTTTCAGTAAGACTCTGTTAAAAAACTGGATTTGATCAG
AAGTCAAGAGTAATGTACTGTGTGAGTGATCTACGTATCTATTCTAATTATCAACGAATT
CTGCAAGTTTTAGGGATGTTTTGGTGTTCTTTTCATTTTTCCTGCTAGCCACTAGTAGAT
ATCTATTACTTAAATCGATAAATAGAAAGAATTAAAGAGGGGTGGCTCTGCTTATCGATG
TATTTGTGTATATTTAGAAGATTTAAATCAGCC
