Microarray Probes on PGSC0003DMT400048045
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_8993_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
CACATTGCAAATGGTCATAATTTGCTCAAATGGCCATTTGGTTCTCTTCTTAGTACTATT |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400048045
Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)
Source Transcript PGSC0003DMT400048045 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT2G42005.1 |
+1 |
0.0 |
550 |
282/410 (69%) |
Transmembrane amino acid transporter family protein | chr2:17531323-17532564 REVERSE LENGTH=413 |
Transcript Sequence (1967 bp)
>PGSC0003DMT400048045 1967 pgsc_dm_v3.4
CTTGAAACCTTCATATTCTCTCTAATCTCCTGAATTTTCAAAAAAAATAATCCAATTTTT
TTCAAAACCCTACAACCAATTCCAAATTTCTACCCAAATTTGAAAAAATCTTGAATAAAA
GATTTGATTTTTATCTAATTTTTGCCCGTAAAATTGTGATTTTTGATTTTTGATCATAGT
ATCCATATGGGGTTTGAAAAAGATAAAGCAAGTTCGTCCTCTCATGTTTTACAAATCCCA
AGAGAAGATACACCATTATTATCCAAGAATCATCAACATCTTTCTTCACCTTCAAAGACA
TTTGCTAATGTATTCATAGCCATAGTTGGAGCAGGGGTTCTTGGTCTTCCATATACATTC
AAGAGAACAGGATGGGTAATGGGTGCTCTTATGTTATTTACAGTTGCATTTTTAACTTAC
CATTGTATGATGCTTCTTGTATATTCTAGAAGAAAGATTGAATCCCATCTCAAGATTTCA
CAAATTTCATCTTTTGGTGATTTGGGGTTTGCTGTTTGTGGACCTTTTGGTAGGTTTGCT
GTTGATGCTATGATTGTTCTGTCACAAGCTGGTTTTTGTATTAGTTACATGATTTTCATA
GCAAATACTTTAGCATATTGTTTTAATTACTCTAAAACTAATCCAAATCCTAAAATCTTT
GGGTTTCCACCTAAAGCTGTGTATATTTGGAGCTGTTTCCCTTTTCAGTTGGGGTTGAAT
TCAATTCCTACTCTTACCCTTTTAGCCCCTTTGAGTATTTTTGCTGATGTTGTTGAATTA
GGAGCTATGGGGGTTGTGATGGTTAAAGATGTGATGATTTATGTAAAGAGTAGTCATGTT
CTTGAAGCTTTTGGTGGATTTAGTGTGTTTTTCTATGGTCTTGGTGTAGCTGTTTATGCT
TTTGAAGGTGTTGGAATGGTGTTGCCTTTGGAAGCTGAGACAAAAGATAAGGCAAAGTTT
GGGAAAATCTTGGGCTTTTCAATGGCTTTGATATCTCTAATGTATGGTGCTTTTGGTGTA
TTGGGATATTTCGCTTTTGGTGAAGATACAAAGGATATAATTACGACGAATCTTGGACAA
GGATTGCTTAGCAGCCTAGTTCAAATTGGTCTTTGCATAAACTTGTTCTTTACTTTCCCT
CTGATGATGAATCCAGTTTACGAAGTAGTTGAAAGGAGGTTTTGTGAAGGGAGGTACTGT
GTTTGGATAAGATGGATTATGGTTTTGGCAGTGACGTTTGTGGCGTTGTTTGTGCCAAAT
TTTGCTGATTTCTTGTCATTGGTTGGGAGTAGTGTGTGCATAATTCTTGGCTTTGTGTTG
CCTGCTTTGTTTCATCTGATTGTATTCAAAGATGAGCTAAGATGGCATAGTTTGGCTTGT
GATGGTGCAATTATTGTAGTGGCTGCTTTTTTTTCAGTCTATGGAACCTACTCTTCATTG
CTGGAGATATTTGTTGGAGCAAAGGAATAAATTGTTTGTCTTCCTTTTTAATGTACAAGT
TCAAGAGAAAGTTAAGCGTGTTTGGGCGAGAGTATACTAAGATGGCTGACCCTCGGAAGT
CCTTGTGTTGCATCCCTCAGTCTCTCTACTTTCACTAGGTAGGGGTAAGGTTTGCACACA
CCAAACCCCACCTGTGATATTACTATGGATATATTATTATTGTTGTTGTTTATCACGCAT
TATGGTTGTCCGTTTATTTTTCATCCTTCCTACCATTTGTAAATTTGCTTCCATGTAAGG
CCATTGATAATAGGCTTGGTACAACTATGGAGGTTGTGTGAGGAAGATGATCATGTCTAC
TTAGTATTCACATTGCAAATGGTCATAATTTGCTCAAATGGCCATTTGGTTCTCTTCTTA
GTACTATTTATATAATAATACTATATTATGTTTTGAGAATTGTCCTAAATGTGTGTATTT
ATTTTTAGTTTAAGTTGCGACTCTTGATACAACTTGCTTGGGATTGA
