Microarray Probes on PGSC0003DMT400022888
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_5739_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
CTTGTGGAAAGCAAGTCTTGATTAATGGTTTTCAACCACTAACTATGGCTTCTGCTTCAT |
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Source Transcript PGSC0003DMT400022888 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT5G53840.1 |
+3 |
4e-19 |
64 |
39/137 (28%) |
F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein | chr5:21859148-21860672 REVERSE LENGTH=444 |
Transcript Sequence (2472 bp)
>PGSC0003DMT400022888 2472 pgsc_dm_v3.4
ACGCTCTCTAACAAAACGAACTCGAAGCTCCGTCCCAACCCTCGTTGTCATAAAAAGTTG
GAAAGCCCTAAAAATGGCTGATAGAGCTCTCTATTCACTCTCGTTAGACTGATAAATCTG
CGGATGCGAGGTAATCTCACTATACATTTGAAATCAGTACTGTTTTCTGCTTTTAAATCC
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AATCATTTCGGATTTCATCAGCTTAAATTTCTTCATCTTGAAGAAGTTGAGTTATCAAAC
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TATAATGACATATTAGAAGAGGTATCCGATGAGGTCTCGAAGTTTCCTAGAGCCTCTTCG
CATGTTGTTGTGTCATTTCTTAATTTCAAACCCAAATCAAGATCTCGTTACCGGGACAAT
TTTGTTTAAAAGAGGTTGTGATTGTGAGGCTATGTTGCTTGGACTTGGACTTGGACTCTG
ACTCTCCAAAAATGTTGTACTACTTTTGGAAGATCTGACATACATTTGAAGTGTCCAAGC
AACATAGGCTAGAAGTACCCTTTTAGAGAACTAGTGCATGAGCAAGCACATGAAGCCTTA
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AGCATGTTTGACTCCGGACAAAGAAGCATTCAACTTGTCAACAGATGTTACACGCGTCTC
CAAGATTTAGGAAGTATTAGTCATCTCTTTCTGCACTATATGGTTGTTGTTGACCTCTGA
AACATGTTTTATTATGTTTTTGGACTTGCGTGGGTCATGTCGTACACAGTTAAAGATGCA
TATGAATGCTGGAAGCATGAAGAAGATCTGGATGTCCCTGCAAGTATTTTTTTTGGTGTT
TTTGGTGAATTTCAACTCCAAACTACTCCCAACTATAAGCTAGATGTTTGTGTAACTTAT
TTAGCTTGATGGACAACTTAAGCCATGTAAATTACTTATTTCATCAAAGAGTAAGGATAA
TTTCCCTTTGCTTCATTTTTCGTTTTATTATTGTAGCTTTACTTGAGCTGAGGGTCTATT
GGAAACATTGAGGTAAGACGGCGTACACACACCTCTCCAAACCCCGCTTATGGGATTGCT
TCTACTTTCATACACCAACAATGATTACTGTCAAGAAGAGTGATGAGTGTTTGGTGTATA
CTCCAAGAATGGCTTGTGGAAAGCAAGTCTTGATTAATGGTTTTCAACCACTAACTATGG
CTTCTGCTTCAT
