Microarray Probes on PGSC0003DMT400017518

Probe IDChipProbe Sequence
CUST_13483_PI426222305 JHI_St_60k_v1 CAAAACCAGCATCAAGTGCATGTATTGCAAATGACTCAATACAGTAACTGCATTTGTAAA

Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400017518

Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)


Source Transcript PGSC0003DMT400017518 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)

DatabaseLink to BLAST HitFrameE-valueScore% IdentityDescription
Tomato (ITAG)None-----
TAIR PP10 AT5G64290.1 +2 4e-83 282 147/205 (72%) dicarboxylate transport 2.1 | chr5:25714495-25716642 REVERSE LENGTH=563

Transcript Sequence (3011 bp)

>PGSC0003DMT400017518 3011 pgsc_dm_v3.4
GTTTCCGCCACCCCAAAGGCCCCTCAAACACCCTGACCCTTTTTTTCATTTCCATAAATT
TTCCACATTTCATCTCTTTCTCTTCACTTCACTCTTTGCCGGAGAAAAAAAAATGGAGAG
ATTGGCACTTCACTCTCCATCTTCAGCCACCTCTGCCGCCGCAGCCGCCACCACATCCTT
CTCTCGTCTCTCCTACCACCATCTCCGATCACGTTCCTCCGCCATTCCCACCGCTGCTCT
CCGTCCAGTTTCCTCCCTTCGATCATCTATTTCCGGTTCAAGATTCAATCTTACCGGCCC
AAGATTCAATCTTTTTCATCCCAAACCTTTCCTTTTCAATCCCCTTTCAAAACCCACTTC
AAGAAATCCACCGTCTCCCAAACCCATCACTGCTTCTTCATCCCCTGAATCAGATAAGAT
AGTAATTGTAGATGTAAAGCCCAAACCCCAGGGTGCGAAGCTCATTCCTTTGATTATTTC
TGTTTCAATTGGTCTTATAGTCCGTTTCTTGGTTCCAAGACCACCTGAAGTTTCTCCTCA
AGCATGGCAATTGCTCTCCATTTTCCTATCAACAATCGCTGGTTTGGTCCTCAGCCCATT
GCCAGTAGGTGCATGGGCTTTTCTTGGACTTACAACCTCAGTTTTGACCAAGACTTTAAC
CTTTTCAAGCGCCTTTAGTGCCTTCACGAATGAAGTCATCTGGTTAATTGTGATTTCTTT
CTTTTTCGCCCGTGGGTTTGTCAAGACTGGCTTAGGAGATCGAATTGCCACATACTTTGT
TAACTGGTTGGGGAAGAGTACTCTTGGTTTGTCATATGGATTGGCCCTGAGTGAGGCTTT
GATTGCACCTGCAATGCCCAGCACTACGGCAAGAGCTGGTGGGGTATTTTTGCCTATTAT
TAAGTCTCTCACTTTCAGCTGGAAGTAAGCGTGGTGATCCCTCATCCAGGAAGCTAGGAT
CTTACTTGATTCAATCTCAATTTCAGGTATGCCTGATATAGATGTGTGGTGTGTCACATA
ATTAGATGACTTTAATGAAATGTAAAAACACTCTCTATGGATACATGAATTAGTACTGAC
CAAATGATCCTATTATTCAAGAATTCAATCTATATACACTAATGGTGAAAATAGTTTTTG
AGCCATTAAGGTAACATTAAGTTTGTAACCTGGAAAATAAGGTTATTAGCATGCTAAAAT
AGGTTAAACTATTAAGTTATATCCATAGGGTAATTTTTGAGTGATCTTTGTCTGAAGACT
AATATTTATCTTGAATTTGCAACAGAAGACATTATGCATTTGATCAAGTATTACTATCTT
TTCGGTTTGTTGCATCTGTCTCTTTTAGGAATACATAACATATATGGGGTATGGAATGAT
GTCAGCTATATGAAGCTCTTAACCTGCAAATTCATTACTGAGAACTCAAATCTATCTAGA
ATTGCTTTAATAGCTTCCATAACTAAAAGGGATAAAAATGAATTGTTTGGTTGTTGAAAA
TAGCTTTACCTGTCAGCACTTTAATTTTTTTTTTGCCTTTAAAAACAATGAAAAACAGCT
TTATCACATGTTGTTTTGTATTTTTAAATTAAAATTAGCTATATGTTAAAAAATAGATGT
CAAAAAATATGTGTGGAAATATAATCCTCTAGCCTTTTCATATTCTCAACTCTCAAGTGT
ATAAAAGATCTTGATTCTGGAGAAGAACAAAGGGGGATGTAGGGGCATTTCGATATTGTT
GTGGTGATTCCGAACATTTTCAACATGTAGGTTGAAAAATCTGATGCGAAGTCTCTGTTG
ACCAAACTGTCTAGAATATGTGTGCATTCTTCCTGTTTCTCGAGTTCTTCGTTACATTGC
TTGGCTGATTATCCCTTGTGCAATAGACATAATATATATGTTGATATTTTATCATGTTGT
TATATATATATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCTTCAATAAATTTT
AACATGCGTGCTTATTTGTCGTTCAATTGGAAAATAAGGGTAGTTGTATAAACCAACTAA
ATCAGAGAGCACGTCGTGGAGGCCTATGTTTCTATCCCCCGCAAAAGCTAAGGAAAACAT
GTAATGGAGGCCTATGTTTCTATTCCCCGCAAAAGCTAAGGAAAACATCTCTAACTTGTT
AGCATGGACGCCGATGTACTTGAAAACATGATCTGCAAGGAGGCCAGAAAGAGAGTCGCT
GCAATTGCTTGCATTGTTGCAAATTCCCCCAAAACCAGCATCAAGTGCATGTATTGCAAA
TGACTCAATACAGTAACTGCATTTGTAAAAAAAATTGAGAATATCTCTTGTTAAATTTTG
CATTTTTCTTTGTAGATTACCCTTTTCTGAGTACTTGTGTCCTTGGAGGTGCAAAAAACC
TATGTGACAACCCTGATTACCTAACCCTTGGACTGCTTGACACTGGTTTTGGGGCCATCA
TTCACCATTGCAGGCAATTGTGACGACTTCCCCGCTCACACCTCCACTACGTACTCCTCC
AGTTGTGTAAGCGTTTGTAATCTGGAGAGAAGAGACTGCCCCTTCAGCAACGACTCTCTG
TTGGTCAATGTTGCAAAGCTGGAGACGGTAGGATATCTTTAGATGCCTTGTTGTTCAGTA
ATTTATGGATCAGAAGTTACCAAGGGTTAATGTGTGTAATGTGTACTTTTACTTTTTCTT
AAGTGTGTAATGTGTAGTGCTTTCTGTACAGGTGTAGCACGTATTTTATGTCAAAAAAAA
AGGAAGGAAATATCCCAATTCATATTGACTCTCACACCTTCCGCTTTACTCTTCCTCTCT
CCATTGCAATTTTCATGGTAGTCATTAGCGTGTGAAATTCAGCTTCGTACTCCCTTTTAA
GATATTTTTGCTTAATTAATTTAACAAAAAAATTTTGCTCCCGTCAATACTCTTATGAAG
CAAATACACTCTTCTTCAACTGTCTAAGAAATTCTAATCATTTGATCAATTTCATTGTTC
ATCCTTCTTAA