Contig Sequence (2961 bp)
>U35_393 2961 Hv_44K_v2
GGGCTTCCTCCCTTCACCCCTTCCATTCTCCCCGGGAGCGCCGCCGCTTCCCTCATCTCC
CACACTCCCTCCTCTCGGCCCGGGAGGCGGAAGAGGAACCAACCCCAAGGAACCATATTT
CCAGCTGTGACACTCAAACACAGCCAAGATGGTGAAGTTTACAGCGGAGGAGCTCCGCGG
AATCATGGACAAGAAAAACAATATCCGTAACATGTCGGTTATTGCTCATGTAGACCACGG
CAAGTCTACGCTTACCGATTCCCTTGTGGCAGCTGCTGGAATTATTGCCCAGGAAGTTGC
TGGTGATGTTCGCATGACCGATACCCGTGCAGATGAGGCAGAGCGTGGTATCACAATCAA
ATCCACTGGTATCTCTCTCTTCTACCAGATGACTCCTGAATCACTTGAGATGTACAAGGG
CGATCGTGATGGAGACGAATACCTGATCAACCTTATTGACTCACCTGGCCACGTTGACTT
TTCTTCGGAAGTCACAGCTGCTCTTCGTATCACTGATGGAGCTTTGGTGGTTGTTGACTG
TATTGAAGGTGTCTGTGTGCAGACCGAAACTGTCCTGCGCCAAGCTCTTGGTGAGAGGAT
TAGGCCAGTCCTTACTGTGAACAAGATGGACAGATGCTTCCTTGAGCTTCAAGTGGAAGG
TGAGGAAGCATATCAGACTTTCTCCCGTGTTATTGAAAATGCCAATGTCATCATGGCAAC
ATATGAAGATGTGCTCCTGGGTGATGTCCAAGTGTACCCGGAAAAGGGTACTGTTGCATT
CTCTGCTGGTTTGCATGGGTGGGCTTTCACCCTTACAAACTTTGCCAAGATGTATGCCTC
CAAGTTTGGTGTTGATGAGGCAAAGATGATGGAGAGGCTGTGGGGTGAGAACTTCTTTGA
CCCAGCCACAAAGAAATGGACCTCCAAGAACACTGGGACAGCTACCTGCAAGAGAGGTTT
CGTTCAGTTCTGCTATGAGCCAATCAAGCAAATCATAGCCACCTGCATGAATGACCAGAA
GGATAAGTTGTGGCCTATGTTGAAGAAGCTTGGTGTGACCATGAAGAATGATGAGAAGGA
CTTGATGGGCAAGGCTCTCATGAAGCGTGTGATGCAAACTTGGCTGCCTGCCAGTCGTGC
TCTGCTTGAGATGATGATCTTTCACCTTCCCTCTCCTTCAAAGGCCCAGAGGTATCGTGT
GGAGAACTTATACGAGGGCCCCCTTGATGACATTTATGCAAATGCTATCAGAAACTGTGA
TCCTGATGGTCCTCTTATGCTGTATGTGTCCAAGATGATTCCAGCATCTGACAAGGGTAG
ATTCTTTGCCTTCGGACGTGTTTTTGCCGGGAGGGTTGCAACTGGCATGAAGGTCCGTAT
CATGGGTCCCAACTTTGTTCCCGGCCAGAAGAAGGATCTGTATGTGAAGAGTGTCCAGCG
TACTGTTATCTGGATGGGAAAGAAGCAAGAATCTGTTGAGGATGTTCCCTGTGGTAACAC
TGTTGCTTTGGTTGGTTTGGATCAGTTCATCACAAAGAATGCAACCCTGACGAATGAGAA
GGAAGTTGATGCCTGCCCAATCAGGGCAATGAAGTTCTCTGTGTCCCCTGTTGTGCGTGT
TGCTGTTCAGTGTAAGGTGGCTTCTGATCTTCCCAAGCTTGTTGAGGGTTTGAAGCGTCT
GGCAAAGTCTGATCCTATGGTTCTCTGTACCATTGAAGAGTCTGGCGAGCATATCATTGC
TGGAGCTGGAGAGCTTCACCTTGAAATCTGTTTGAAGGATCTGCAGGATGACTTCATGGG
TGGTGCTGAAATCATTGTTTCCCCTCCTGTCGTCTCCTTCCGCGAGACTGTTCTGGAGAA
GTCCTGCCGTACAGTCATGAGCAAGTCCCCCAACAAGCACAACCGTCTTTACATGGAAGC
TCGCCCATTGGAGGAGGGATTGGCTGAGGCTATTGATGATGGCCGCATTGGCCCACGTGA
TGATCCTAAGGTGCGCTCCAAGATCCTGTCTGAGGAGTTTGGTTGGGACAAGGATCTTGC
CAAGAAGATTTGGTGCTTTGGACCTGAGACGACTGGCCCCAACATGGTTGTTGACATGTG
TAAGGGAGTGCAATATCTCAATGAAATCAAGGACTCTGTTGTGGCTGGGTTCCAGTGGGC
ATCAAAGGAAGGTGCATTGGCTGAGGAAAACATGCGTGGCATTTGCTTTGAGGTCTGTGA
TGTTGTTCTCCACACTGATGCCATTCACAGGGGTGGTGGTCAGGTCATCCCAACGGCCAG
GAGGGTCATTTATGCTTCTCAGCTCACTGCCAAGCCAAGGCTGCTGGAGCCCGTCTACCT
GGTTGAGATCCAGGCCCCGGAGAATGCACTTGGTGGCATCTATGGTGTTCTGAACCAGAA
GAGAGGGCACGTGTTCGAGGAGATGCAGAGGCAAGGTACCCCGCTCTACAACATCAAGGC
CTACCTCCCCGTCATTGAGTCCTTTGGATTCTCAAGCACCCTGAGGGCCGCGACCTCCGG
CCAGGCCTTCCCCCAGTGTGTGTTTGACCACTGGGACATCATGGCTTCTGATCCTTTGGA
CCCGGGCACCCAGTCGGCGACGCTTGTCACGGAGATCCGCAAGAGGAAGGGTCTCAAGGA
GCAGATGACCCCTCTATCTGATTTCGAGGACAAGCTCTAAATTTTTGGTGCTGTTATCCC
TTACCTGCTCTTGTTGAGTTGAACTATTTTGTATCGATGAGTCAATCTTACTATCTTGCT
GTTAAATGACCTGTTTGTGGTGATACTGGGAAGAGAACTATGTTTTGATGTCTGGTGATG
TAACGGATGTTGAACTTAGATTATGTATCTGTTGTCCACTGGTAATTCTTTTGCTCTTAA
AAAAAAAAAAAAAAAATCTCGAGAGAGTTACCTGGTTCTTCGTTGATATAATGTTGCTCC
TATAAAAAAAAAAAAAAAAAA
Homology of Contig U35_393 to Model Species (E-value threshold 1e-50)
Pseudo-peptide dataset | Hit | Hit length | E-value | Description |
---|
Rice v7 | LOC_Os02g32030.1 | 844 | 0.0 | protein|elongation factor, putative, expressed |
Brachypodium v1_2 | Bradi3g44480.1 | 844 | 0.0 | |
Arabidopsis v10 | AT1G56070.1 | 843 | 0.0 | | Symbols: LOS1 | Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein | chr1:20968245-20971077 REVERSE LENGTH=843 |