Microarray Probes on PGSC0003DMT400080154

Probe IDChipProbe Sequence
CUST_50208_PI426222305 JHI_St_60k_v1 CTTTGTCTGAACTCTGAAGCGAACAATATTTTAAGTTAGCCTAAGAGATGGACTACAAAA

Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400080154

Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)


Source Transcript PGSC0003DMT400080154 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)

DatabaseLink to BLAST HitFrameE-valueScore% IdentityDescription
Tomato (ITAG)None-----
TAIR PP10 AT1G56720.1 +3 2e-53 196 143/345 (41%) Protein kinase superfamily protein | chr1:21263630-21265559 REVERSE LENGTH=492

Transcript Sequence (3485 bp)

>PGSC0003DMT400080154 3485 pgsc_dm_v3.4
GATAAATTTAACCTAACATTACACTCTCTCTCCATAATTCTAGAACCCTACATCTTCTTA
TAGAAGAATCAAGTTCTTCCATCTCTCTTCCTCCAACCCCAACAATGATTACAACAATGA
ATCATATGATTCTTCATAAGTCTTAAGAGTGACTAATAAAAATACTCGACATAGTTCTAG
AAGCAACCATTTCTGTACTTTCTTCCAATCGACAAATACAACTCAAAAATCTCCAATTTT
TTTTTTTGCTTCAAACCTAGTTTCTTGGCACCTTCAAGTACAATTCTTTAGTTCTGTTAT
CTCTCAACAAGATCTTCCGAATTTGGGTACTTGTTCACTAGGTTGCTCGAACTCTTCAAA
AGTATTGTCACACTCATGTCAAATCATCCAAAAAGCTATTGAGAGTACCATATCGGATAT
GGACGGGTAATTGGTCGCCTTGGATGGTCTTGGACATCCTCGCCCTATGAGCTAGCTTTT
GGGTTGAGTTAGGCCCAAGATCCATTTCATTACACATGCACTACTTTTGGAAGATCCGAT
ATGCACCTATTGACATTTTTGAAGAGTATGTTGCTCGGACTCTTCAAAAGTATTGGCGCA
CCCGTGTTGGATCATCCTAAAAGACTACTTTTGGAGGATTTGAAGTAAGGTTTTCAAAGG
AGAATATTCTTGGTGTGGGAGGATATGGCATGGTCTACCACGAAAATTTGATTAATGGAA
CACTGGTAGATATTAATAAGTTCCTCAACAATCTCTGAGTTGATAAAATCAAATTATATG
CTTTCTTTAATGGTCCTTTTGTTTTAGTTGCCAACTTGAGTTTGAATTTAAGATCTTTGT
CCCAGAGAAAGAGTTTCAAGTGGAGGTTGAAGCCATTGGCCACGTACGTCACAAAAACTT
GGTTAGCCTTCTAGGATACTGCATTGAAGGAATGCACAGGTATTTCCCCATTTGGAAGTC
CCTGATAGTCCTATACCTTTTCTGGGTACGGTACTTGTTCACTAGGTTGCTCGAACTCTT
CAAAAGTTTTGTCACACTCATGTCAAATCATCCAAAAAGCTATTGAGAGTACTATATCGG
ATATGGACGGGTAATTGGTCGCCTTGGATGGTCTTGGACAATCCTCGCCCTATGAGCTAG
CTTTTCGGGTTGAGTTAGACCCAAGATCAATTTCATTACACATGCACTACTTTTGGAAGA
TCCATATGCACCTATTGACATTTTTGAAGAGTATGTTGCTCGGACTCTTCAAAAGTATTG
GCGCACCATGTTGGATCATCCTAAAAGACTCTACTTTTGGAGGATTTGAAGTAAGGTTTT
CAAAGGAGAATATTCTTGGTGCGGGAGGATATGGCATGGTCTACCACGGAAATTTGATTA
ATGGAACACTGGTAGATATTAATAAGTTCCTCAACAATCTCTGAGTTGATAAAATCAAAT
TATATGCTTTCTTTAATGGTCCTTTTGTTTTAGTTGCCAACTTGAGTTTGAATTTAAGAT
CTTTGTCCCAGAGAAGAGTTTCAAGTGGAGGTTGAAGCCATTGGCCACGTACGTCACAAA
ACTTGGTTAGCCTTCTAGGATACTGCATTGAAGGAATGCACATGTATTTCCCCATTTGGC
AGTCCCTGATAGTCCTATACCTTTTCTGGGTACGAAATATGAAGCTTTAGATTGTTCAAT
TACTTTCATGCGCATGTGAAGTAATTGAATGAGTATTCTTGTTTAGCATTTGAAAATGCT
TTGTTCTAAAGCATCACCACAAGATGTTGGTTTACGAGTATGTCAACAATGGAAATTTGG
AACAGTGACTTCATGGAGCCATGCGACACCACATGTATCTCACTTGGAAGGCTAGGATGA
AGGTTCTCTTTGGGACAGCTAAAGCGTAAGGTCATTCAGTTAAGATAAATCTATTTTGGG
ACAGCTAAAGCGTAAGTTCTCCTTGTGCTATCATTTCTTGCAGTCTTGCCTATTTGCATG
AGAATATTGAGCCCAAAGTTGTTTATCGACACATCAAATCAAGTAATATATTTGATTTGA
TGATGACTTCAATGGTTAGGTCTCTGATTTTGGTCTGGCCAAACTCCTTGGTGCCGGTAA
AAGTCATATCACAACTTGAGTCAACCTTTGGGTATGTGGCTCCTGAATATGCAAATACTG
GTCTCTTGAATGAAAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGGGTAGTGTTGTTAGAATCGATCA
CAGGAAGAGATCCTGTGGACTATGGCTAGCTTTGGGGGTAGTGTTGTTAGAATCGATCAC
ACATGAAGAGATCATGTGAACTATGGCCATCCTGCCTAAGAGGGCCCAAGAGGTTCGTTA
TCCTTCGTACCTTATCTTAAGATCTAATTAGCACACTTGATGTAAAAATCTTATCTGCAT
CCTCATTATAGAAAAAGCTGTAAAACTTATTGTGCCCAGATCTTTGGCAGAATAGATCTT
TATATTAATGCTCGCTTTGCTGGTTTTCTAATATTTGTCTCATTGTCATTTTCTGTTAAG
TTTCCCTTGAGTTTTCTCTGGATTATTACTTGTTCTTGATATACCATGTACCATAACAAA
TGTACACACACTATTAATCTTTGAGAAGGATATCTGAACCTGGTAAGTGGTAGCAGATAT
GTGACTAGCCAGTGCCTTTTGGTATATGTTGATTACCATTCACTTAGTAGAAAGGGGCTG
TATTTTAATGTTCTAGCCTATTAAACATTAAGCACCATTTCATTTGAAATAAGCAAGTAT
ATGTGTTTTTCTAGGGTTGGAGATTATGGTTAGTGTTGTTAAGGTTCTACAATGAGCATC
TTAACTTCAACTCATAGTCCATTCTATTTTTGGATCTTTTATTCTAAAATCTATGCTGTT
ATTTTCTCTCTTCTCCACTCTTCTGAGATTTGCTCTTCTCGAGTTGCTGCTTCGATTTCC
AAGTTAACTATTCCTTCAAATTCCACCATAATTTTGTTCTTCGGGTTTTGTAAAATGTGG
ACTTACATCTGCTCTCCAGATGTAGGTATCTTAATTGTCAAGTCGTTTGAGCTACATGTA
GAGTTCTTAGTCAATTGGCTTAGTGGGAAAAGCTAACCTTTCAAATTCCATTTTAGTTGT
CTACTTCTAATTTTACATGGTTCTTAAGAAACAATGATTAACATGAGTATTGTTTTACCA
TAATACTCATATTAATTGATATCTATACTTGGATCTTGAAAAATGATTTGGGGACGAAGT
AATCAATATTGATGGTAAATTAGGAATTTTTGTTTTGGTCTCTTTTTGATAAGTTAAAAG
TACCAAGTATAATCGAAAATCTATTATTATTTTTTAAATAATGGACAAGTAAAAGTAAAC
GGAGGGAATAACAAGCAATAATAAATTTAACATCATTAATTAATGTGTAGTTTCTTCGAA
TCTTTGTCTGAACTCTGAAGCGAACAATATTTTAAGTTAGCCTAAGAGATGGACTACAAA
ATGAG