Microarray Probes on PGSC0003DMT400073888
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_4794_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
TATGGCTCTTGTTCACATTTTAGAGGGAAGTTGGGAGATCCCTTGGAGTGTATCAACGGA |
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Source Transcript PGSC0003DMT400073888 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT3G24255.1 |
+1 |
8e-18 |
78 |
39/123 (32%) |
RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein | chr3:8789471-8793208 FORWARD LENGTH=746 |
Transcript Sequence (8508 bp)
>PGSC0003DMT400073888 8508 pgsc_dm_v3.4
ATTACAATTAAAAATCATATGCACAATCATTGTACCAACAAGTCAATCATCTATTGCAAC
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AGGTCATGAGTGTTTCTAGACCTTTTACTGTTGTTAAGTGGTTCTGAAAATGTCATTTAA
CCTGCATCAAGTATAAGATAGTCATGCATCTCTAAGTGGCTAACCTAACTTCTTGTTAAC
TTTAAATTAGATGGTGGTATTAAGTTCTTGTGAAGTTCAGCCCATCGATTTATAGTAATG
AGGATAAAAGTAAGCATTAGAGAGGCAGAAGGATGAACTTATCTCAATCTTGAGACTTGG
AATGATCATCGAGGCAAGTAGTTAATTCTGACATAGCAAAGCTGATTTTTGAAGGTGTAG
TCTCCTCTTCAGATCAATTAGAGCTTATCCGGCGATGAGGAAGATGGAAAGATTTGAGCT
TAATGGAGATTTGAGCTTGGAGGGAGTCATTTTGTAAGGTGCTGAGTTGTAGAAATCAAT
GGAGTTACTAACTTTAATCTATACTCTTTAAGCTTTAGTAGTATGACTCACCCTTTATAC
GTTTGTTAATGCTACTTCAAATACTTGGCCAAATAAACTATTAGGTGTAGTATTTAAAGT
GACTTTCAAGTTGCAATAATCTCTCCCATTTATAAATTTTAAATCCTG
