Microarray Probes on PGSC0003DMT400069890
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_30402_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
CGTGTTTAGGGTACTGTGTGATAAATTGTTTAACCAAGATTTAAAGGTAAGCTCTACGTT |
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Source Transcript PGSC0003DMT400069890 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT2G39950.1 |
+2 |
1e-64 |
151 |
132/356 (37%) |
unknown protein; Has 978 Blast hits to 254 proteins in 81 species: Archae - 0; Bacteria - 8; Metazoa - 109; Fungi - 53; Plants - 41; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 767 (source: NCBI BLink). | chr2:16676758-16680204 REVERSE LENGTH=636 |
Transcript Sequence (5475 bp)
>PGSC0003DMT400069890 5475 pgsc_dm_v3.4
TTTATCTTCCCAATTTGTAACTGTTCGTCGTGTGGCTCCCGTGATTTTCTCTCAAATCTC
TCTGAATTTGTTGGATTTTTTAAATTTTCATTCATAGATTTCAATCGATTTGCTGATTTA
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ACCTACTTTCACACCTTTAGTAGGCGATTCTATAGTTCATATTCCTGTTATTGACGTGTG
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GTTACACCCAAATTTAGTGAATCCTTTAATTCCTGCAGAAACAGAATCAATGGCTGAGAA
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TACTGGAAGCAGAGGACTTTACTCTAGAACCATAGGTGTTGATACCACAATAGCAAATGA
TTTTGCATTTAAGGGTTTGGCTTCATTATCTGAAAAGCCTGTTGGTGGATGGCTTGATAT
GAAGAAAATTCGTATACAAGAGATGTTTGTTCCAACGGATAAACCAGGTATTTCTGGTGA
ATCTTCAATGGATGATGATGGTGGTTTTATAGATTTTGAAGAGGAAAGAAAGAATTGTTA
AACAGAGTGCTCTTGTTTGCTCTTGTGTTTTTCAAGTTGTGCCGCAAAAAAAAACTGTGA
ATATTTTGTTTGTAGTTTTGTATTGTCAAATGTAACTAATCTCAAGTCCATTCAATATTA
CCTTTATATGTGCTATCTTTTACATTCAAGTATTTTGGGTCTATAATTTAAGAAAACGGA
GACATTAACGATGATGTTTCACCGTGTATTGGAGCAAGGAGGGTTGAAGCGTAGGCTCGT
GTTTAGGGTACTGTGTGATAAATTGTTTAACCAAGATTTAAAGGTAAGCTCTACGTTTCA
TTAAATAGAGTAGCC
