Microarray Probes on PGSC0003DMT400068940
Probe ID | Chip | Probe Sequence |
---|
CUST_47006_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
ATTTGGGGGAATTTTGCTTGTTTCATTGGGAAATCATCAACAGGTCATGACTACTCTACT |
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Source Transcript PGSC0003DMT400068940 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
---|
Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
TAIR PP10 |
AT1G12650.1 |
-1 |
4e-43 |
146 |
79/159 (50%) |
unknown protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF947 (InterPro:IPR009292); Has 700 Blast hits to 631 proteins in 192 species: Archae - 0; Bacteria - 32; Metazoa - 138; Fungi - 168; Plants - 60; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 302 (source: NCBI BLink). | chr1:4306183-4307673 FORWARD LENGTH=248 |
Transcript Sequence (3285 bp)
>PGSC0003DMT400068940 3285 pgsc_dm_v3.4
GTTATTACTTTGTTGACTTGAATATGAACTATTAGTACTATGTTTGGACTTAATTTTCTG
TTTGTGCTAGACAATTTTAAAGTTCTGTGACATGGTGACAACTTAATATTCATATTGTGA
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