Microarray Probes on PGSC0003DMT400050446

Probe IDChipProbe Sequence
CUST_38384_PI426222305 JHI_St_60k_v1 GGACTGCACATTACCTGGAAAGTTAGAATTAAAGAGTTACTACATAAGTGTTGAGAAACA

Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400050446

Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)


Source Transcript PGSC0003DMT400050446 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)

DatabaseLink to BLAST HitFrameE-valueScore% IdentityDescription
Tomato (ITAG)None-----
TAIR PP10 AT3G11410.1 +3 1e-27 117 70/154 (45%) protein phosphatase 2CA | chr3:3584181-3585649 REVERSE LENGTH=399

Transcript Sequence (4216 bp)

>PGSC0003DMT400050446 4216 pgsc_dm_v3.4
CCCTAATTTAATTCTCCAGAAACGTATAGTTTCTGCTTAGCATCCCTTGATCAGTGTAGC
AGTTTTTTTTCGACGCTCAATTCCATTGCTTTAATTATCACCTTATCCAAAACCTTTTCA
GATTCTTCCCTCATCTATATAAATTTGTTTCTCTTTGTTGTGACTCATTCAAATACATCA
GGTAAATATTTTTTTCTCCTCTTTATTTATCAAGAGCTGCTCTATTTTCCTATTTACTGT
GTATGTCTTTATCTAGCTTATTTCGTTTCATTCTCTTAATCATGTCTGTTCTTGATATTG
CTACTTCTGTGATATTGTTATTTCCTTAATATTACTTGTCACAGTGTTATCTTAATTATA
TTGTTGCAAATTGCCTATTGTTGCTTGGTGTATAACTGATTTATTTGTCGTTGAAGTGAA
AGCCCAAGTACATTCTCTGTTTCTCCCTATGTCCTTGTGTTGGGGATGCAAATGGATACA
GAGTAATGACTTTGGGTCCGAGATATTTATTTTGTACTTGCTCATTCGCCAAGTATATGG
ATCTGTGATTCTTTATCAATAGCCACTTTGTTTCCCTTGTTTTCTGTTTATTCCTTGGAA
AGTTTGGAATTTGTAGTCGGCTGTTTGAACTTTTGCTTATTTTGATTTGGGTATTTTTCT
AAATTGTTCAGTTTTGCTTATTTTGTTATTGTTTGATCTATTTTCATTATATAAAAACAT
ATTGATTTATTTCAATGGATTTTATCTGATAAATTACTTATTCGTTAGGTGGAAAATTTT
ACGACCTATTATTTTATTTTTTCAGCACACATTAATAATCATACTCTAACGTTTTATTAT
AATAGCTAAGTTTTATGTGAAATCGGTCTTGATAAGTACTAATGAACTGTATCAATTGGC
TTCAGTGGCATTTTGCCTCCTTGTAGCTTGGATTGGTTATTCTTCCATCTCTCAGCCTTT
GTACTTGTGTAATAAAATATGCATTTGGATTGTCTTTCCTCTACTTTCTGGTTATGCATC
TATTCATGCTGAGTGCTGAGCCAACCTCTCTGTACATCCCCTGGTAGAAAGATTCAGGAC
TAGCACTTTTGGATTTGGAGTAAATATTTGTTATGGCCTCCTTAACGTGTTGCAATGTTA
GATGTGCTTGTTTTTATCATTTTTGAATTGAAACCTTATTAGAACTCTCTTCATAAGGAT
AGTTTTCTTTGGATATTGGTTGGGTATTATGCTTGCAAGAAATGCTACAAGCGAGTTACT
GTTATAAAAAGTAGTGCAACTTGTACCTATTGTAGGATTGAAGATATTGATTATGAGGAA
AGGTAAACTACACAAATGACTATCAAAAGTATTACTTACTCCACCAAATAAATGAATATA
ATTATTAAATATTGAAATGAGTTTAACATATACCTATGAAATAAATTAAGTCATACAAAT
TAAATTTTCAAAATATATTTTTACATATCTTATTAAATTAGAATTAAAGGAAAATGCACC
CATCATGCTACTAAGGAATTTAGACCCTTCAAATGGTGATTCTTCATCGACCCACACTCC
TCAATGCGTTAATGTCACATTCATGATAATTGTTTGAGTCCCTCAATCTTCTCACATAAA
TTGTGACATTTAACCAAACATTGTATAGTTTCATATTTAAGTTTCTTGTTTGTTGATATT
GTATTGCATTTTAATGTTTTAGTATTATTATTATTCATAATTTACAGTACTTTCATGCTT
CAAATTTAATGCTTCATATTAAGTTGATGTTGTCATTCATAATTTAGCACATAAATATCC
AACATATTATGAAATGCATCAATTAAATCTTTATAGCTTTACAAGATCAATAATAACTTA
TGCGCTTATGACAAGACTATTTAAAATAATGTACACTTCTACTACATCAATAATATTGCA
CGCACTCATGACAACACAACTTTACAAATGTCTCTCAATAGAGAATGAGACAACTTATGG
CTCATACGTGCAACGCACGTGCCCCTGACTAGTTACATAATAAGTAAAAATAAGCAAAAA
TATATATATTAAATTAACAATAGGATCACACAATTGATTATTATACAAAATGAGACTTTT
TGATATTACCTAGCAATGAATTTAAAACCAATAGATACATCTATAGTAAAAATAAATATA
ATATTTAAATTAAGACAGAACAACCCTACAAATAAGGTGCTATATATTCTCCCATCAATC
ACCTACTGGCTGCAATGTGTTTGTCATATTCTTAGCTTTCAAACAATGACTAATGATAAA
TTTTATGGCGCCTCGCGCGGAAACTGTTTTCCGGCAAACCACATTGTCGAAATCAGGTGC
AATGGAAGATTTTAATCTCAATGCGAAACAACAAAAGTGCTCTCGTCTTAATAGTAGTCA
GCAATTGAAGTGATTGTGCATGACATTAATGCCTGACATCTCTAGCACTAACGCCAATGT
TGTCGTAACCAACTATAAATGCTATAAAAAGAAACGAAATCAGAATATTGGAGTAACGAA
TGATGATAATGATGAGAAAACCAGAAATGGAGAAGAATACAGAGAGAAAAAAGAGATTGT
AGTGTCTATGTTATTCACCATGAGTAAGACAACTTCTCATCATCAGCAACAACATTCAGA
AAACAGTGTCGTTTTGACCAGAACTCCCAGTAATGTCGATGAAGTGAGCAAGGAAACAGA
GGATTTACAATCCATTACGAGATATTCACATGGATCTATCTCTTTGATCGGTGGAAGAAG
ACAAATGAAGGATGCTCTATCAGTGAAGCTGGATTTATTGACGAATTATGACTTTTTTGG
TGTTTATGATGGACATGGAGGGTCATGTGTAGCTCATGCCTGCCGTGACTTGTTGCACAA
GGTACTGATGGAAGTAATTCTTGAAGAAGATGGGAAATTTGAAGAAATAAATTGGGCGAA
AGTGATGATGACGAGTTTTTATAAGATGGATAAAGAGGTGAACAGGATTAATGGGGCGGA
AGTGGCGACAATTGGATCAACGATAGTCGTGGCGGTTGTGGGGAAGGAAGAGGTAATAGT
TGCCAATTGTGGGGATTCTAGAGCTGTGCTTTCACGAGGTGGAGTTGCATTGGCCTTATC
TAATGATCATAAGGTATTTCAAAAATTTGGAATCTTGCTTTTTAAAACTCTTGGAACAAC
TTAGGTATCTAATACGAGTAATTTGGAAAGTTACTTCAAAAATGTCCTTTGATATTGTGG
ACTGCACATTACCTGGAAAGTTAGAATTAAAGAGTTACTACATAAGTGTTGAGAAACATT
CTTCTTCAGTGAATTAAAAATAAAAGTAATATAAACAAATTGAATCGAAGAGATCAACTA
AAACTTGATAGGTGCATTTATATGAAATGAATGGAGTAATTCTTTATTTGGTTGTTAATT
TTGTAAATTGTACACAGCCGGACAGACCTGATGAACTGGAGAGAATTGAGAAGTCAGGCG
GGAAGGTCATCAATTGGAATGGGCATCGAGTCCTAGGAGTACTGGCTACTTCAAGATCCA
TTGGTACGTCCAGATTATGTTTCATATCGAATCAAAATTAAATGATCATGTATTCTAATT
TCTGTCTAGGACACACCAAAAAACGAAGACGTAAGCTTACATATAGAATTTCTGTATTCT
TGAATATTCAATGTGACAAAAGAGTTAATGCAAGGGATAACTACCTAAAACCGTATGTAA
TACCAGAGCCAAAAGTCACAGTGAGCAAAAGAACGGATGGAGATGAGTTCTTAATACTTG
CCAGTGATGGTCTGTGGGATGTTGTTCCCAACGACGTTGCTTGTGATTTTACAAGAAAAT
GCTTAAATGGTCAGATTAGAAGGTGCAAAAATGGAAGTGAGCATTCTCAAAATAAGGTCA
TGAAAGAAAATGTTGCAGCGAAGGCAGCAACCTTACTCGCAGAATTGGCGATTTCACGGG
GCAGTACAGACAGCATAAGCATCATTATAGTTTAGTTGAAGAAATCTTTAGGCACCAGAG
ATGGAAATAGTATTTATAGTTCACTACTTTGATAGTTCATTTTTTCTCTCTTTATAAATT
TCTTGCTTTGTGTCCATTATGGATTGTTTGTACTTTGTATAATATTGTACCTGGACTTGA
AGTCCTAAAGTCTATCAATTTCATGTCGTACTTACCCTTGAATTCTCCTTTTATATATAT
ATTCCGTCTTTTAATT