Microarray Probes on PGSC0003DMT400049654
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_37644_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
GTGAGTGTTAACATTAGCACTGAATCCTTTCATTCTGAGGCAATGAATACTTCATTTGAA |
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Source Transcript PGSC0003DMT400049654 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT4G21570.1 |
+1 |
1e-133 |
403 |
198/274 (72%) |
Protein of unknown function (DUF300) | chr4:11471126-11472269 REVERSE LENGTH=294 |
Transcript Sequence (2480 bp)
>PGSC0003DMT400049654 2480 pgsc_dm_v3.4
ATTATGTATTTATTAGGATTATCCATAAAAAGTCATTTATGTAGAGATTTAACTTGTTTA
GATTACAATATTGTTGAAAGATCAAATTTTTACCTTTCTTTAAAATGTTGTTTCTGTTCA
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GTTTTCTGGCAGGGTATTCTGCTTAGTACTCTGGTATCACTAGGCATAATAAAATCTCAC
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TGCAACATGTATTGTTGTGAAAAATTATCTTCAGACATCAGTCAACTTCTCCCTACTGTT
TGTGTGTTATATTGGATTTACTTGTTTGAAGTATACCAGATTCCTATTACAGATCAACTA
GAACATTTTGTGAGTGTTAACATTAGCACTGAATCCTTTCATTCTGAGGCAATGAATACT
TCATTTGAAATAAAATAGAGAAGCATATGAGCAGTTGGTTCTTTTTTTTTTGTCTTCAAT
ATAATTACAGTATTATTTTT
