Microarray Probes on PGSC0003DMT400042533
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_31532_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
GTGACTGACCAAATTTATATCCATCACCTCAGGATGTTTAATGTTGGTCTATGATGTATT |
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Source Transcript PGSC0003DMT400042533 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT1G79770.1 |
+3 |
5e-35 |
127 |
74/165 (45%) |
Protein of unknown function (DUF1677) | chr1:30014371-30014874 FORWARD LENGTH=167 |
Transcript Sequence (1010 bp)
>PGSC0003DMT400042533 1010 pgsc_dm_v3.4
TTTTCTTAAAAAAAATAATTAATAATCATTTGGTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAA
TGGCACCCCATGGAGAGACAATTACCAAATCATCCTACCTTCGAACAAAAAACGTTACCA
AGCCCCCTAGACTCTCCAACGATAATTTACAACGTACAATGTCCGATATTTCGTTCGAAT
GGAACGCGATATGTCCCGTTGATTCTTCAAATCTACCACCAATTTCCGAAGTAGAAAATG
CGAAGTGTGAGTGTTGTGGTATGAGCGATGAATTCACACATGAATATATCGATCGCGTTC
GAAAAAAATATTCAGGCAAATGGATATGCGGCCTATGTGCAGAAGCAGTAAAGGAAGAAG
CGGAAAAAAATGGAGGAAAAAATGAAGAAGCATTAAGTAGTCATATGAGTTCTCATAGCA
AGTTTAATAAATTTGGTAGGGTTTATCCTGTTCTTTATCAAGCTGAAGCAATGAGAGAAA
TGTTGAAGAAAAGTAGTAGAGATGGAAGGGGAATTCTTAGAGCAAAATCTATAAGTCCAA
GGGATAAAATTGTCATAAAGAAGGGTACTACTGGGATTGCAAGAAGTACTAGTTGCATTC
CTGCAATTACTAAAGAGATCAATGAGCTTAATTAATTAATTAACCTAGATAATTTGATTT
ACTGGTCTAATATGTTGTGGAATTAATAATGTTTAATAACAAGATTTGGACTAATTAAAC
TATTGTGTTAGTTACTCTTCGAGTTTTTTGGGGTTAATTAGTTCAGGTTTTTAACCTTTT
TTGTTCTCTCGTGTTATGAGGGGTTTTATGGTCACGTTTGTAACTCAAATGTGACTGACC
AAATTTATATCCATCACCTCAGGATGTTTAATGTTGGTCTATGATGTATTATATTTTATT
CAAATTAATACGATCTATTTGAGTAAGATTTTAAATAATATAATTGGTGTAAGTCTTGAT
TTTAAAGTATAAAAGATGTATTTTGGGATTGATGATAAGTCATATTAGCG
