Microarray Probes on PGSC0003DMT400035604

Probe IDChipProbe Sequence
CUST_39161_PI426222305 JHI_St_60k_v1 GGAAAAAAGACAACGAGCTCTTGTTATTAATGTGTCGTTTGTTGACAAGTAGTTCTTCAT

Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400035604

Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)



Source Transcript PGSC0003DMT400035604 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)

DatabaseLink to BLAST HitFrameE-valueScore% IdentityDescription
Tomato (ITAG)None-----
TAIR PP10 AT5G35320.1 +3 1e-06 50 25/36 (69%) unknown protein; Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | chr5:13521893-13523144 FORWARD LENGTH=225

Transcript Sequence (3133 bp)

>PGSC0003DMT400035604 3133 pgsc_dm_v3.4
GAAAAATCTAGACTTGGGAGAAGAGTCTACAAGCTTCCATTATTCTTCCTATAACTGAAA
TTCTCAACCTCGTTCTTCTTTCACTTTCATAAACCGAGCTCTCCAACTACCTAACAACAC
TCTGGTTGCTGCTTTGATCGATCGTTTGAGAAGGAGGTAGGTAGCATAAATTTGTGCAAA
TTGATCTCTGATAGCTTTTTAGGGTTTTTTTTGGACGCTGTTGTTAAAAGAAGAATATGG
AGCCATACTATACATTGAAGATGAAGAGGAAGGATTTGGAAGATGTTTATGATGAATTTT
CTGAATTTTCACTTTCTTCTCCCGCCAGAAAAATTCGTCGACTGGTAAACCTCTTCGCCC
TTTGAGAAATTCTTCTGTTTTTAACTGCAAGTATATGAAATTCTGTTGAAGGTAGTGATT
AGTATGATGGTTTTGTAAATTTTTTTCAACTAATGGAGGTTGAGCTTGATTTTTTGAGTA
CTGGAATTGTATGAACTTAAACTAGAGAAGAATGCACTTGGTGTTGATTGAGGTGGATTT
TTGGATTTGAATTGTATGAACCTTGGTGTACCAGTTGCAGTTGCCTACATGTGATCAGGA
GATTCGCGTGGAAACAGTTGTAGTTAAGTCTTTCTTCGTACTCAGGAGCTTAGAGCACTG
GGCTGCCTTTTAAACTATATTGCTTTGAGTTTCTACCATAACTCCTGTTATTTACTGGGT
TCGAGATCAATTCTGTTCTTATTTAGTGAATTTTTAAACACACACATGGTATGTCAAAGC
TACACGTAAATAACCCTCTACATTAGCCTCAGGATATAAAGGTTACGGAGTTACTGGCGA
AAAAATAAATCACTGTTGTTTCAACTTAAGAGCAGGATGAATATAGAGGATTCCTATAGC
TAACTCCGACTAGTTTGGGATTGAGGTGTAGTTGATTTGTTACGACTTAATTTGGCAGAA
TTGAGGATAAATCAAAGAATGTTCTAAAATTGCTATCGCCCCCTTTCAGTTTGTTTTTGA
TGAAATTGCCTGTGCAATGAGTATGTTAGTGATGTTTTTTTCTATTTACTCTATGTTTAG
GATGCAGATTTGCCTCCCATAATAGAAGAGGTTGAAGAACCAGAGATTCCTATAGCTTTT
GAGCAAGCAGCTACTTATCCAAGCTTCGGAAGCAATGCAGTAAATAGGGGTCTAGTAATT
GAGGAACTGCCAAGTGTGCCCGAGAATGAAGAGAGGGCAATTGTTCTATTCAAGCCCATG
AACACACAGCCTGTGCATTCCCCTTCTAATTTCTCCGTTAAAGTGGATCCCCAGTTTCTT
AATGGTCTCAAAAGTAAGTCTCTGGTCCCTATACCTTTAGTTGTTAATTTAGTTTATATG
AGATTATTTGGTAGTTTTATTGAAAACATCGAATGCATTAGCTTATTTATTAGGCTTATT
AGGTTATATTAATATGGTTTAGATCACCTTGAGATCAACAGGATGAACATAGTATCTAAT
TGTTGGTGGTGTGTTTCTTGTTTTAAGAACTTGTTAAGTTCCACAGCTCGAAAAGTAATG
GTGAAGCTCTGTCTAAATTTGGTAGAGGTCACGAGAAGGAATTTGCCTTGAATGCTAAGG
AGCATGTATAAATCTTCCCAGGGGTAAATTGGCAATACATCAGTTCAAGATGAGCTGATT
GGGGTTGCAGTTAATATATAAGCCAGCTTGAATGCTAAGGCAAACTTTAGGTACTTTCTA
GAATAACCTTTGTCAATGCAAGTGTAGCTCATGTAGCTCAGTCTTTCTTTTTGACGAATT
TATTGGTGAAAAAAGTTAGAAATCCCTGTTCTCTTTGTGGAACTTGTTTTCTTAGTGATC
TGATCATGGAGCTGAGCTAAGGAATAGTCAGAATCCTGTATGTATTGAGTATTTTTTGAG
GAAGGTGTTAATGGAAACAAGCTTCATGAGATGCGCTCTTACTATATTAGAAAGAAAAAA
TATTGTTTTGGCTTCTACAGATCCAAAAAAAAGAGGATATTGGTTTATCTTTTTAGAGAA
AATGGATGTGATCCTGATAATGGTTAAAATTAGAATTTGATTGAGAACTTTTTGACAGAG
TCTAATTTGATCCATGGGCAGAGCCATAGAAGCTGGTTGCCGTTGTATATTCCTTGGTTT
GATTAGACGGTGGTGTTTTACCTAAGTGAAAAATATACTTTAAAGCTCAGTGATCAGTTT
TTGTATGTTGTGCAGGTCAAATCTTCTGGGATAACACTGCAAATGCATTTAGACTAGTTG
ACAATGAAGCAACGCAACAGGACGACTCTAGTTCTGCAAAAGAATGTCTAGCGGTTGTTC
CGTGGGTTCCATCTCAATTTCCTTCTGCAGCAGAAGCTGAAGTCCTTAGTCAACCTGATG
TTTCAGATATGATGGATGCTGAAGATATGGAGGGAGTAGCTATGGATATTGAAGATAACA
GTGTGGATGTTGAACCAAGAACTGCAGTCGAGGCTGGTGCAGTTGGTGTAAATGATGGTT
TTCATCATTGGCAACAACAGCATTGTATGACGACGACTCAACTGCCTCAGAACACATCAA
CACCTATTCCCTGGTACCGGTAATTGGCATATAAGGATTAGGATGTTATAATTACGATTA
GATATTATTAGAACTCTCCATGGGTCTCCTCTTGCAAGGAAGCATTGGTTAGGTAAAAGA
GGGTGAAGTAAATAGTAGATAAAAGTACTAGAATGTGAATTGAAAAGGTCAGGAGACCGT
TATGTTAAATTCAGCAAGCATGGCCTCTAATATGTCGAGCGAAGAGCTGCTTATGGTTTT
CTAATGTCTCCATCATTCTCCATATCTTGGATATGATTTTTCTTTAGTTGTTATGCCTAT
TTTGCTTACACACTGATAGAGATTGTGGAATGGAAAATAGTCACTTTGGGAACGAAATTT
GTTCAACTCATAATAGTTAAAGAGGAAAAAAGACAACGAGCTCTTGTTATTAATGTGTCG
TTTGTTGACAAGTAGTTCTTCATAAAATTATTTTGGAAGTTTGTAATCACAAAAAAGAAA
TATGGAAATATGTGATTTGGTATTGTACGATATTTTGATATTTTATTCATGAATTGGAGA
AACTTCATACTTT