Microarray Probes on PGSC0003DMT400035604
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_39161_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
GGAAAAAAGACAACGAGCTCTTGTTATTAATGTGTCGTTTGTTGACAAGTAGTTCTTCAT |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400035604
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Source Transcript PGSC0003DMT400035604 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT5G35320.1 |
+3 |
1e-06 |
50 |
25/36 (69%) |
unknown protein; Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | chr5:13521893-13523144 FORWARD LENGTH=225 |
Transcript Sequence (3133 bp)
>PGSC0003DMT400035604 3133 pgsc_dm_v3.4
GAAAAATCTAGACTTGGGAGAAGAGTCTACAAGCTTCCATTATTCTTCCTATAACTGAAA
TTCTCAACCTCGTTCTTCTTTCACTTTCATAAACCGAGCTCTCCAACTACCTAACAACAC
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