Microarray Probes on PGSC0003DMT400034124

Probe IDChipProbe Sequence
CUST_46305_PI426222305 JHI_St_60k_v1 CCAGAGAAGATAAAAGACACAACAATTGTGTATATGTCACAACTCACAACTTGAAGACTT

Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400034124

Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)


Source Transcript PGSC0003DMT400034124 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)

DatabaseLink to BLAST HitFrameE-valueScore% IdentityDescription
Tomato (ITAG)None-----
TAIR PP10 AT1G15520.1 +1 0.0 2026 1003/1408 (71%) pleiotropic drug resistance 12 | chr1:5331993-5338175 REVERSE LENGTH=1423

Transcript Sequence (4598 bp)

>PGSC0003DMT400034124 4598 pgsc_dm_v3.4
TTTGCCTTTCATTCTTTTGTTCTTTAAGGCATAATAATTTAAAAGAACACAATTTGTGTA
TCCCTAAATACTGTTTTAACATCCATTTGAAAAAGTTTAAACGAATTCGAGCCCTCGGGG
CATCACAAAAACATAGCATTTTTGTAATAGTTAACGAAAAAAAAAAGAGATTAGCCTTTT
GATCGATAGAGTTGAGTGAACGTTGGATCGTTCAATATGGAGCCGGTAAATCTCAATAGT
ATGAGAGGTAGTAGTATGAGAGGAAGTATGAGAGGTAGTTTAAGAGCAAGTACTAGTAAT
TCAATATGGAGAAACAATGGTGTTGATGCATTTTCGCGATCAGCGAGAGATGAAGATGAT
GAAGAAGCACTTAAATGGGCTGCATTAGAAAAATTACCAACGTTCGATCGATTGAGGAAA
GGTTTATTGTTTGGATCACAAGGTGCAGCTAATGAAATTGATGTAAATGATCTTGGATAT
CAAGAAAGGAAGAATTTGCTTGAGAGGCTTGTTAAAGTTGCTGATGAAGATAATGAAAAG
TTCTTGATGAAACTCAAGAATAGAATTGATAGAGTTGGGATTGATATGCCATCAATAGAA
GTGAGATATGAACATCTAAATATTGAGGCAGATGCATATGCAGGAAGTAGAGCTTTGCCT
ACTTTTTTGAACTTCATGACCAACTTTGTTGAGTCATTGTTGAATTCTCTTCACATCCTT
CCAAGTAAAAAGAGGCAAATAACAATTCTCAAAGATATAAGTGGTATGATTAAGCCTTGT
AGAATGACTCTACTTTTGGGACCTCCGAGTTCTGGAAAGACTACTTTGTTATTAGCATTG
GCTGGAAAACTTGATCCTGCTTTAAAGGTTACTGGTAATGTGACTTATAATGGACATGAA
CTACATGAATTTGTGCCACAAAGAACAGCTGTTTATATCAGTCAACATGACTTGCATATT
GGAGAAATGACTGTTAGGGAAACTTTGGAATTTTCTGCAAGATGCCAAGGAGTTGGCTCT
AGATTTGAGATGTTGGCTGAACTGTCAAGAAGAGAGAAAGCAGCTAATATCAAACCAGAT
CCTGATATTGATATCTACATGAAGGCTGCAGCAACAGAAGGACAAGAAGCCAATGTTGTT
ACAGATTATGTTCTTAAGATATTGGGGCTTGACATTTGTGCTGATACTATGGTGGGAGAT
GAAATGATAAGGGGTATTTCCGGGGGACAAAAGAAACGTGTAACAACGGGTGAAATGCTT
GTTGGACCATCAAAGGCACTTTTCATGGATGAAATCTCAACTGGATTGGATAGTTCAACT
ACTTTCTCCATTGTTAACTCTCTAAGACAAACGGTGCAACTCTTGAAGGGAACTGCTGTG
ATATCTCTGTTGCAGCCAGCCCCCGAGACTTACAACCTGTTTGATGACATTATTTTGTTG
TCAGACGGGTACATTGTCTATCAGGGTCCTCGAGAAGCTATTCTTGACTTCTTTGAGTCT
ATGGGATTCAAATGCCCCGAGAGAAAAGGTGCAGCAGATTTCTTGCAAGAGGTAACATCA
AAGAAGGATCAACAACAATATTGGGCTAAGAGGAATGAGTCTTATAGGTTTGTCACATCA
AAAGAATTTGCAGAGGCGTATCAGTCTTTCCATGTTGGAAGGAAACTCAGCGATGAGCTT
GCAACTCCATATGACAAGACCAAAAGCCACCCTGCTGCTTTGTCTACTAAGAAGTATGGT
ATAGGGACGAAACAACTGTTGAAGGTCTGCGCTGAACGAGAATTCCTACTAATGAAGAGG
AACTCATTTGTTTACACATTCAAGCTCACTCAGCTTGCTATAATGGCACTTATAACGATG
AGTGTCTTTTTCCGAACTAAGCTTCCCCGAGATGATATGGATGATGGAGGAATATATGCT
GGTGCTCTCTTTTTCGTGGTCGTTATGATTATGTTTAATGGAATGGCTGAGATTGCCCTG
ACAATTTTCAAGCTTCCGGTCTACTTCAAGCAAAGGGACCTTCTTTTTTATCCTTCATGG
GCTTATGCCCTTCCGACATGGATTCTCAAAATCCCTATAACATTTGTTGAGTGTGGAATG
TGGACATTCCTTACATATTATGTCATGGGATTTGATCCAAATGTTTCAAGATTGTTCAAA
CAATTCTTGCTTCTCGTACTAGTACACCAGATGGCATCAGCATTGTTCAGATTCATTGGG
GCAGTGGGGAGAACAATGGGAGTAGCTAGCACATTTGGAGCATTTGCTCTTCTTTTACAA
TTTGCACTAGGAGGATTTGTCCTTGCACGAGAGGATGTGAAGAAATGGTGGATTTGGGGT
TACTGGACCTCACCACTGATGTATTCCGTTAATTCAATTCTCGTGAATGAATTTGATGGA
AAGAATTGGAAACATATTGCGCCAAATGGAACCGAGCCCCTTGGAGCTGCAGTCATAAGA
TCTAGGGGATTCTTTCCAGATGCATACTGGTACTGGATAGGTTGTGGGGCACTTCTCGGA
TTCACGTTGATCTTCAACTTCTTCTACAGTATTGCACTCGCTTACCTTGACCCATTTGGT
AAGCCACAAGCTATGATATCAGAAGACGGTGAGAATGCTGATAATGTTGAACTCATGGAG
AGAAGTGAAACCGAGGGTCAGGAAAAGAAGAAGGGAATGGTTCTTCCATTTGAACCCCAT
TCCATCACTTTCGATAACGTTGTATACTCTGTTGACATGCCTCAGGAAATGAAGGAACAA
GGTTCTGCTGAAGATAGATTGGTACTTCTAAAGGGTGTAAGTGGAGCTTTCAGGCCAGGT
GTTCTCACAGCTTTGATGGGTGTTAGTGGAGCCGGTAAAACAACATTGATGGATGTGTTG
GCCGGAAGGAAAACAGGAGGATACATTGATGGTGACATCAAGATTTCTGGATATCCAAAG
AAGCAAGAAACGTTTGCACGTATTTCTGGATACTGTGAGCAAAATGACATCCATTCGCCT
TATGTTACAGTTTATGAGTCCTTGGTTTACTCAGCTTGGCTGCGTTTACCTCAAGATGTT
GACGAAAATAAGAGAAAGATGTTTGTTGACGAAGTTATGGAACTTGTGGAGCTAGCTCCA
TTAAGATCAGCCTTAGTTGGACTCCCTGGAGTCAATGGTCTATCAACCGAGCAACGCAAA
AGGCTGACAATTGCGGTTGAGCTGGTAGCAAACCCCTCTATCATTTTCATGGATGAACCA
ACTTCAGGGTTGGATGCAAGAGCTGCTGCTATTGTAATGAGAGCTGTTAGGAATACTGTC
GATACAGGAAGAACTGTCGTCTGTACCATTCATCAGCCTAGCATCGACATTTTTGAAGCC
TTTGATGAGCTATTTCTAATGAAACGTGGAGGCCAGGAGATATATGTTGGTCCTCTAGGT
CGCCATTCTTGCCATTTGATCAAATACTTTGAGTCATTGCCTGGAGTTAGTAAGATAAAA
GAGGCTTACAATCCCGCAACTTGGATGTTAGAAGTCACCGCCTCATCTCAAGAAATGATG
TTAGGGGTTGATTTTGCTGATTTATACAAGAATTCCGACCTCTACAGGAGGAACAAAGCC
TTGATTGCTGAATTAAGTACGCCTCGTCCTGGTACAAAGGATCTACATTTTGAAACTCAA
TTTTCACAGCCTTTCTGGACCCAATGTATGGCTTGTCTCTGGAAGCAACACTGGTCGTAT
TGGCGTAATCCATCTTATACTGCTGTTAGATTCATTTTCACAACATTCATTGCACTTGTC
TTTGGCACAATGTTTTGGGATCTTGGTACCAAAGTGAGTCGGAGTCAGGATCTTATCAAC
GCTATGGGATCTATGTATGCTGCAACTCTCTTCCTTGGTGTACAAAATTCATCATCAGTC
CAGCCTGTTGTAGCCGTTGAGCGTACTGTATTTTACAGAGAAAAAGCTGCTGGAATGTAT
TCTGCCATACCTTACGCCTTTGGACAGGTTGTCATCGAAATACCTTATGTATTTGTACAA
TCGGCTGTCTATGGTCTCATCGTGTATGCAATGATCGGGTTTGAATGGACTGCTGTCAAA
TTCTTATGGTACTTCTTCTTCATGTACTGCACCCTCTTGTACTTCACCTTCTATGGCATG
ATGACCGTGGCTGTTACCCCCAACCAAAACGTTGCATCCATTGTCGCGGCCTTCTTCTAT
GCAGTATGGAATCTCTTCTCAGGATTCATCGTTCCACGACCTCGTATTCCAATATGGTGG
AGATGGTACTACTGGGCTTGCCCTGTTGCATGGACCTTGTATGGTCTTGTTGCATCACAA
TTCGGAGACATCCAAACTCCTCTCACCGATGATGAAAATGTTGAACAATTCTTGAGACGT
TACTTCGGATTTAAGCATGATTTTCTTGGCGTTGTTGCTGCTGTGATCGCTGCGTTGCCT
GTTATGTTTGCCTTGACATTTGCATTAGGCATTAAGGCATTCAACTTCCAGAGAAGATAA
AAGACACAACAATTGTGTATATGTCACAACTCACAACTTGAAGACTTTTTTTTTTAATTT
TCTATGTATGTTGTATTTTTACCTTATTGAATTCCAAG