Microarray Probes on PGSC0003DMT400034124
Probe ID | Chip | Probe Sequence |
---|
CUST_46305_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
CCAGAGAAGATAAAAGACACAACAATTGTGTATATGTCACAACTCACAACTTGAAGACTT |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400034124
Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)
Source Transcript PGSC0003DMT400034124 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
---|
Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
TAIR PP10 |
AT1G15520.1 |
+1 |
0.0 |
2026 |
1003/1408 (71%) |
pleiotropic drug resistance 12 | chr1:5331993-5338175 REVERSE LENGTH=1423 |
Transcript Sequence (4598 bp)
>PGSC0003DMT400034124 4598 pgsc_dm_v3.4
TTTGCCTTTCATTCTTTTGTTCTTTAAGGCATAATAATTTAAAAGAACACAATTTGTGTA
TCCCTAAATACTGTTTTAACATCCATTTGAAAAAGTTTAAACGAATTCGAGCCCTCGGGG
CATCACAAAAACATAGCATTTTTGTAATAGTTAACGAAAAAAAAAAGAGATTAGCCTTTT
GATCGATAGAGTTGAGTGAACGTTGGATCGTTCAATATGGAGCCGGTAAATCTCAATAGT
ATGAGAGGTAGTAGTATGAGAGGAAGTATGAGAGGTAGTTTAAGAGCAAGTACTAGTAAT
TCAATATGGAGAAACAATGGTGTTGATGCATTTTCGCGATCAGCGAGAGATGAAGATGAT
GAAGAAGCACTTAAATGGGCTGCATTAGAAAAATTACCAACGTTCGATCGATTGAGGAAA
GGTTTATTGTTTGGATCACAAGGTGCAGCTAATGAAATTGATGTAAATGATCTTGGATAT
CAAGAAAGGAAGAATTTGCTTGAGAGGCTTGTTAAAGTTGCTGATGAAGATAATGAAAAG
TTCTTGATGAAACTCAAGAATAGAATTGATAGAGTTGGGATTGATATGCCATCAATAGAA
GTGAGATATGAACATCTAAATATTGAGGCAGATGCATATGCAGGAAGTAGAGCTTTGCCT
ACTTTTTTGAACTTCATGACCAACTTTGTTGAGTCATTGTTGAATTCTCTTCACATCCTT
CCAAGTAAAAAGAGGCAAATAACAATTCTCAAAGATATAAGTGGTATGATTAAGCCTTGT
AGAATGACTCTACTTTTGGGACCTCCGAGTTCTGGAAAGACTACTTTGTTATTAGCATTG
GCTGGAAAACTTGATCCTGCTTTAAAGGTTACTGGTAATGTGACTTATAATGGACATGAA
CTACATGAATTTGTGCCACAAAGAACAGCTGTTTATATCAGTCAACATGACTTGCATATT
GGAGAAATGACTGTTAGGGAAACTTTGGAATTTTCTGCAAGATGCCAAGGAGTTGGCTCT
AGATTTGAGATGTTGGCTGAACTGTCAAGAAGAGAGAAAGCAGCTAATATCAAACCAGAT
CCTGATATTGATATCTACATGAAGGCTGCAGCAACAGAAGGACAAGAAGCCAATGTTGTT
ACAGATTATGTTCTTAAGATATTGGGGCTTGACATTTGTGCTGATACTATGGTGGGAGAT
GAAATGATAAGGGGTATTTCCGGGGGACAAAAGAAACGTGTAACAACGGGTGAAATGCTT
GTTGGACCATCAAAGGCACTTTTCATGGATGAAATCTCAACTGGATTGGATAGTTCAACT
ACTTTCTCCATTGTTAACTCTCTAAGACAAACGGTGCAACTCTTGAAGGGAACTGCTGTG
ATATCTCTGTTGCAGCCAGCCCCCGAGACTTACAACCTGTTTGATGACATTATTTTGTTG
TCAGACGGGTACATTGTCTATCAGGGTCCTCGAGAAGCTATTCTTGACTTCTTTGAGTCT
ATGGGATTCAAATGCCCCGAGAGAAAAGGTGCAGCAGATTTCTTGCAAGAGGTAACATCA
AAGAAGGATCAACAACAATATTGGGCTAAGAGGAATGAGTCTTATAGGTTTGTCACATCA
AAAGAATTTGCAGAGGCGTATCAGTCTTTCCATGTTGGAAGGAAACTCAGCGATGAGCTT
GCAACTCCATATGACAAGACCAAAAGCCACCCTGCTGCTTTGTCTACTAAGAAGTATGGT
ATAGGGACGAAACAACTGTTGAAGGTCTGCGCTGAACGAGAATTCCTACTAATGAAGAGG
AACTCATTTGTTTACACATTCAAGCTCACTCAGCTTGCTATAATGGCACTTATAACGATG
AGTGTCTTTTTCCGAACTAAGCTTCCCCGAGATGATATGGATGATGGAGGAATATATGCT
GGTGCTCTCTTTTTCGTGGTCGTTATGATTATGTTTAATGGAATGGCTGAGATTGCCCTG
ACAATTTTCAAGCTTCCGGTCTACTTCAAGCAAAGGGACCTTCTTTTTTATCCTTCATGG
GCTTATGCCCTTCCGACATGGATTCTCAAAATCCCTATAACATTTGTTGAGTGTGGAATG
TGGACATTCCTTACATATTATGTCATGGGATTTGATCCAAATGTTTCAAGATTGTTCAAA
CAATTCTTGCTTCTCGTACTAGTACACCAGATGGCATCAGCATTGTTCAGATTCATTGGG
GCAGTGGGGAGAACAATGGGAGTAGCTAGCACATTTGGAGCATTTGCTCTTCTTTTACAA
TTTGCACTAGGAGGATTTGTCCTTGCACGAGAGGATGTGAAGAAATGGTGGATTTGGGGT
TACTGGACCTCACCACTGATGTATTCCGTTAATTCAATTCTCGTGAATGAATTTGATGGA
AAGAATTGGAAACATATTGCGCCAAATGGAACCGAGCCCCTTGGAGCTGCAGTCATAAGA
TCTAGGGGATTCTTTCCAGATGCATACTGGTACTGGATAGGTTGTGGGGCACTTCTCGGA
TTCACGTTGATCTTCAACTTCTTCTACAGTATTGCACTCGCTTACCTTGACCCATTTGGT
AAGCCACAAGCTATGATATCAGAAGACGGTGAGAATGCTGATAATGTTGAACTCATGGAG
AGAAGTGAAACCGAGGGTCAGGAAAAGAAGAAGGGAATGGTTCTTCCATTTGAACCCCAT
TCCATCACTTTCGATAACGTTGTATACTCTGTTGACATGCCTCAGGAAATGAAGGAACAA
GGTTCTGCTGAAGATAGATTGGTACTTCTAAAGGGTGTAAGTGGAGCTTTCAGGCCAGGT
GTTCTCACAGCTTTGATGGGTGTTAGTGGAGCCGGTAAAACAACATTGATGGATGTGTTG
GCCGGAAGGAAAACAGGAGGATACATTGATGGTGACATCAAGATTTCTGGATATCCAAAG
AAGCAAGAAACGTTTGCACGTATTTCTGGATACTGTGAGCAAAATGACATCCATTCGCCT
TATGTTACAGTTTATGAGTCCTTGGTTTACTCAGCTTGGCTGCGTTTACCTCAAGATGTT
GACGAAAATAAGAGAAAGATGTTTGTTGACGAAGTTATGGAACTTGTGGAGCTAGCTCCA
TTAAGATCAGCCTTAGTTGGACTCCCTGGAGTCAATGGTCTATCAACCGAGCAACGCAAA
AGGCTGACAATTGCGGTTGAGCTGGTAGCAAACCCCTCTATCATTTTCATGGATGAACCA
ACTTCAGGGTTGGATGCAAGAGCTGCTGCTATTGTAATGAGAGCTGTTAGGAATACTGTC
GATACAGGAAGAACTGTCGTCTGTACCATTCATCAGCCTAGCATCGACATTTTTGAAGCC
TTTGATGAGCTATTTCTAATGAAACGTGGAGGCCAGGAGATATATGTTGGTCCTCTAGGT
CGCCATTCTTGCCATTTGATCAAATACTTTGAGTCATTGCCTGGAGTTAGTAAGATAAAA
GAGGCTTACAATCCCGCAACTTGGATGTTAGAAGTCACCGCCTCATCTCAAGAAATGATG
TTAGGGGTTGATTTTGCTGATTTATACAAGAATTCCGACCTCTACAGGAGGAACAAAGCC
TTGATTGCTGAATTAAGTACGCCTCGTCCTGGTACAAAGGATCTACATTTTGAAACTCAA
TTTTCACAGCCTTTCTGGACCCAATGTATGGCTTGTCTCTGGAAGCAACACTGGTCGTAT
TGGCGTAATCCATCTTATACTGCTGTTAGATTCATTTTCACAACATTCATTGCACTTGTC
TTTGGCACAATGTTTTGGGATCTTGGTACCAAAGTGAGTCGGAGTCAGGATCTTATCAAC
GCTATGGGATCTATGTATGCTGCAACTCTCTTCCTTGGTGTACAAAATTCATCATCAGTC
CAGCCTGTTGTAGCCGTTGAGCGTACTGTATTTTACAGAGAAAAAGCTGCTGGAATGTAT
TCTGCCATACCTTACGCCTTTGGACAGGTTGTCATCGAAATACCTTATGTATTTGTACAA
TCGGCTGTCTATGGTCTCATCGTGTATGCAATGATCGGGTTTGAATGGACTGCTGTCAAA
TTCTTATGGTACTTCTTCTTCATGTACTGCACCCTCTTGTACTTCACCTTCTATGGCATG
ATGACCGTGGCTGTTACCCCCAACCAAAACGTTGCATCCATTGTCGCGGCCTTCTTCTAT
GCAGTATGGAATCTCTTCTCAGGATTCATCGTTCCACGACCTCGTATTCCAATATGGTGG
AGATGGTACTACTGGGCTTGCCCTGTTGCATGGACCTTGTATGGTCTTGTTGCATCACAA
TTCGGAGACATCCAAACTCCTCTCACCGATGATGAAAATGTTGAACAATTCTTGAGACGT
TACTTCGGATTTAAGCATGATTTTCTTGGCGTTGTTGCTGCTGTGATCGCTGCGTTGCCT
GTTATGTTTGCCTTGACATTTGCATTAGGCATTAAGGCATTCAACTTCCAGAGAAGATAA
AAGACACAACAATTGTGTATATGTCACAACTCACAACTTGAAGACTTTTTTTTTTAATTT
TCTATGTATGTTGTATTTTTACCTTATTGAATTCCAAG