Microarray Probes on PGSC0003DMT400029949
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_40535_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
TGTGGTATCTTGAAAACTACTCGATACAACCTAACGATACATCCAATACCAATGATTGTG |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400029949
Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)
Source Transcript PGSC0003DMT400029949 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT1G08630.1 |
+1 |
5e-180 |
518 |
250/354 (71%) |
threonine aldolase 1 | chr1:2743948-2745685 REVERSE LENGTH=358 |
Transcript Sequence (1843 bp)
>PGSC0003DMT400029949 1843 pgsc_dm_v3.4
CTTGAAATTTGTGGCTTAGAAGACAGACACCCATTGAGTTAGGAAGTGAAAAAAAATTTG
AGTGAATTGTCTCTCTAGCATTGCTTGTATTGAAGAAACAGAGAAGAGAAGCTTATAAAT
TCAGTGAAGATGGTGGTAAGAACTGTGGATCTTCGCTCAGACACAGTCACTAAACCAACT
GAAGCCATGCGGAACGCTATGGCCAATGCTGAAGTGGATGATGATGTCTTGGGTTATGAT
CCAACAGCCCAACGCCTTGAAGCAGAGATGGCAAGGATAACGGGCAAAGAAGCAGGATTA
TTTGTTCCTTCAGGCACTATGGGTAACCTTATCAGTGTGCTGACTCATTGCCAAATCAGG
GGCAGTGAGATTATTCTCGGTGATTATTCCCATATCCATATTTATGAAAATGGAGGCATT
TCCACCCTTGGAGGTGTTCATCCAAGGACAGTGAAGAACAATGAAGATGGTACAATGGAT
CTTGATCTGATTGAAGCTGCGATTCGAGATCCTAGCTTTGAAATATGTTACCCAACCACT
AGGCTGATCTGCTTGGAGAATTCGCAAGCTCACTCAGGGGGCAGATGCCTTTCTGCGGAG
TACACAGACAAAGTCGGAGAGCTAGCAAAGAAGTATGGTCTGAAGCTTCACATTGATGGA
GCTCGTATATTCAATGCATCAGTTGCACTTGGAGTGCCTGTTCATAGGCTTGTACAGGCT
GCTGATTCAGTTTCGGTATGCTTATCAAAAGGTCTTGGTGCTCCAGTTGGATCTGTGGTT
GTTGGTTCGAAGAGTTTCATTGCCAGGGCCAAAATCCTGAGGAAGACTCTAGGCGGTGGG
ATGAGGCAAATTGGTGTCCTTTGCGCTGCTGCTTTTACCGCTTTACAAGAGAATCTTGTT
AAGCTGGAAGGAGATCACAGAAAGGCAAAGAGTTTGGCTGCGGAACTTAACAAAATCAAA
GGGCTTAAAGTTGATGTTGCTACTGTAGAGACTAACATTGTATATTGCGATATACTGAAG
GGGTCAAGGATCAGCGAAACAGAATTGGTCAAGACTTTGGAACAATATGGTTTACTTATA
CTACCAGAAGGCCCACTGAGAGTCAGATTTGTTCTACACCACCAGATTTCAGAAAGTGAT
GTACACTATGCAGTGTCTTGCCTTCAGCGAGCTTTAGCAGGAGTGGCTGAAGAAAATGGT
GACAAGTAACCGGATAAACGGTTTCAGACATGATCTCTTTCTGTTAGAAACTGTCCAAAT
GTTACATGGGAGAGACCAGTTTCATTTGCAGATTTTAGTCTAAATCTTTTAACTTTTCAT
TTCATGTCCTTTTAATGATCAAAAGACTGTTTGTTCTTCATATGTTTGTGGTTGAACTAG
TTTTAAAATTTATCCTAATGATTTAGTAAGAGATGTATGTTGGCTCATATGCAGCAATGC
TGATGTGGTATCTCGGAAACTATTCGGTACAACCTAACGATACATCCAATACGAATGATT
GTGTGACTTTCTTATGTTATGGTGTCTCGAAGAATGAATTTAGCCATTGGCTCATATGCA
GCAATGCTGATGTGGTATCTTGAAAACTACTTGATACAACCTAACGATACATCCAATATC
AATGATTGTGTGACTTTCTTATGTTATGGTGTCTCGAAGAATGAATTTAGCCGTTGGCTC
ATATGCAGCAATGCTGATATGGTATCTTGAAAACTACTCGATACATCCAATACCAATGAT
TGTGTGGCTTTCTTATGTTATGGATAATATGCAGCAATGCTGATGTGGTATCTTGAAAAC
TACTCGATACAACCTAACGATACATCCAATACCAATGATTGTG
