Microarray Probes on PGSC0003DMT400025850
| Probe ID | Chip | Probe Sequence |
|---|
| CUST_7469_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
CAGTGTTGTGTTGTCATCTGTACTCTTTGCCTGTTACTTGTTTTGAGTTACATGTTTAAA |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400025850
Click here to view details at Spud DB Genome Browser (opens in new window)
Source Transcript PGSC0003DMT400025850 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
| Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
|---|
| Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
| TAIR PP10 |
AT2G30600.5 |
+2 |
6e-179 |
553 |
285/457 (62%) |
BTB/POZ domain-containing protein | chr2:13037410-13041475 FORWARD LENGTH=855 |
Transcript Sequence (3652 bp)
>PGSC0003DMT400025850 3652 pgsc_dm_v3.4
CTGGATATTGAATTTGACTTTTTTTGGGTGTGAATTGTGATCTGGCAATGAGGATAAGGA
TGAGGTGCAAATTGAGAACACAAGTTGTATAGGTTGATATTTTTGTTTGATTAGTTGTAT
GGTGTCTAGAGATTTCTGGGTTATTTTCAGATGGTGACCTTCCCAACTATCTCATTAGAT
TTTGAGGTTTCAGAAGTGGCACCTCATATGTTTAGAAATTGCTTTCAAGGACATCTTTTT
CCTTTTCTTTATATCTTGCTGTCAAATGTCAAAGCCCTTCCTGGATCCCATTTGATGATT
CATGCTTATCACGATTTATTGAGCAAGTTGTTTTCTTAAAATCTTTTTTGTTACTATCTG
TCAGACACTATATATATAGCAAGTTTTTCCTCAATCATTTCTCATATTGACTACTGAATC
TCTGGCTAAAAATATGGTTCATTATCAGCAGTATTCTGAAGTGAGTAAAGAGGAATTGTT
TCCTCAGAGAGAAATGATGGAGAAGAAGCAGAAGAAGTTTCTTACTGTGGCCCCGTTTGA
GTGTGCCTGGCCTAATGATCTGAGATTTAGAGAAGCAGGAAGGGGTTGTGTAGCTTTTGA
TGCTTTCGCGCATAACGATGTAACAGTTGTTTTTCGGGAGCAGGTAGGGAGTCAACACTA
TCACTACAAAAGGGATAACTGTCCACACTATACTGTAATCATTGGTAGTCATAGGAACAA
GAGATTGAAAATTGAGGTTGATGGTAAAACGGTGGTGGACGCTGCTGGTGTCGGTCTTTG
TTGTTCTTCAGCATTTCAAAGCTACTGGATTAGTATCTATGATGGATTGATTAGCATTGG
CAAGGGAAGGTATCCTTTCCAGAATCTTTGCTTTCAGTGGCTTGATTCAAATCCCAATTG
TACCGTTCAGTACATTGGTCTTAGCAGTTGGGATAAACATGTTGGCTACAGGAATGTTAA
TGTACTGCCTGCCACACCAAATCATTTATCTTTGTGGAAACATGTGGATTTTGTTGAGCA
TGATTTTGGAGAGGATGATTTAGAACAAGAGTTAGAAGATGGAATTGCTAATTATGAAAG
TTGGGGTCTTGGAAAGTTTCTTGAGAATTGGGAGTTATCGGATATGTTTTTCATTGTTGG
AAAGGAAGAAAGGGTTGTTCCAGCTCATAAGCTAGTTTTAGAGGCATGTGGGGATTTTTG
TCTTAGTTCATCAGTTGAAGAAGCTGTTCACCTGCCAGACATAAGTTATTCTGTTCTTCA
TGCACTTCTTCAGTACATCTACACTGGACATACTCAGATTTTGGAGTCTGATCTCTGCTC
ATTGAAGTCTTTGAGCTTACAATACAAAGTGATGTCATTGGTGAGGCAATGTGAAGAGAT
CCTTGAGCGAATTATGTCTAATAAGCAACTCGTTGACTCAACTCAGCTTGTAGACATATT
TTATCCAAGCTGGCTCCAATGCAGCAAAACTTTTCCTTATGGGTTGCCAATTGATAGAGA
AAGGCTTGAACGGTTCCTCTCGACTGGAGAGTATAGTGATCTAGACCTTTATGTTGGAGT
TCATGATATTGTTTTGCGATCACATAAAGTGATCCTTGGGTCATGGAGTACTCCTTTCAC
AAAGATGTTTACAAATGGAATGAGGGAGAGTGTTTCTTCAGTGGTCTGCTTAAAAGATGT
TCCTCTTGAAGCATTCAAGATTATGCTAGAATTCATGTACAGTGGAGAACTTAATAAAGA
AGCTACTGAGGGAATCAATACCTTGTTACTTCAGCTACTTTTACTAGCCGATGAGTTTGG
GGTAACACTTCTTCATCAGGAGTGCTGCAAAATACTTCTGGAGTGCCTCTCAGAGGTAAT
CTTGTGATTCTGACCTCTTTCCAGACACCTCTTTTGTTGCTAAACCTGTATCTGTCGTGT
GCATGTTGAAAGTGCTAAATGTCAGACTACAATTAAAAGAGTGGAGAAGTGATGCAGTTC
GAAGTTGTGAGCGTGAGCAGAGCCATTTTATGAAAATGAGATACAAATATTAATACCTTT
CATCTATACATTATATGCAGGGATGGAGTTCTCCTATTGGAAGAAGGTTCAAGAATTTTT
TCTATTATGCCAAGTTTAGTGGACGAGGAAGAAGACACTTTGGAAAAGTCTTTGGGTCGT
GATTGTGACACTAACTATTGATCTTTGTTGCAGGACTCAGTATGCCCAATTCTTCAAGTG
ATATCATCTATTCCCTCGTGTAAACTCATCGAAGAAACCTGTGAGAGGATATTCTCCATG
CACTTTGATTATTGTACAACTGCAAGCATTGACTTTGTCATGTTAGATGAATCAAGTTTT
AGCAATATCCTTCAGCATACAGATTTGACAGTGACATCTGAAGAGAGAGTTCTCAATGCC
ATCTTGCTTTGGTGCTTACAAGCAAGAGAACTGTGTGGATGGGAAGCAGTAAACGAATTG
ATGGTAAATTCAACACCTGAGATGCTTTTTGGAGAGAGACTTGAGTCTCTAAATGAATTT
CTGCATCTTGTGCGGTTCCCTTTACTTTCACCTGATTTGCTGAATAAGTTTGAACAGAGT
AGCCTTAGCCAGCAAATTCCCACTTTTGACCATCTGGTTAAAGAGGCATTAAGATTTCTG
GAATTTGAGGTCACCGATTTTCAAGGAAGCCAGAGGTGAGTATACTTAAAAGGTTTTATT
CAAACCACCCTGTGACCATAGTTAGATATGGTATTGCAATATCCTCGAGGGAATGACCTA
GTAAATTAAGCGTCTAATAAATGAAATAACTATTTGTCGGTCTGTATGCATGCTAAACCT
GTCTTTCAATTGGAGCATGACTATACAAAATGTCTAAAAGCTGATGAAGTTCTCTGTGTC
TTATGATAATAGATTTCAGCATAGAAAATCAAGTTTTAAGGAGCTGCTCTACATATGCGA
TGGAGATAGCAACGGGGTCCTTTATTTTGCTGGCACATCATATGGGAAACACCAGTGGGT
GAATCCTGTTTTGTCCAAGAGAGTAATTATCACGGCTAGTAGCCCCATTTCAAGATGCAC
TGATCCCAAGGTGTTAGTATCGAGGAACTTCCAGGGTACATCTGTTGCTGGACCTCAGAT
GGAGGGCGGAAGAAACGCTTCGTGGTGGATGGTTGATATTGGTCCGGATCACCAGCTCAT
GTGTAACTACTACACATTAAGACAGGACGGATCAAGAGCATTTATCAGACGTTGGAACTT
TCAGGGCTCTTTGGATGGGAAAAATTGGACAAACCTGAGAGTACATGAGAATGATCAAAC
TATTTGCAAGCCAGGTCAATTTGCATCATGGCCAATTACTGGTTCAAATGCATTACTTCC
TTTCAGATTCTTTCGAGTTCTCATGACCGGTCCTACTACAGACGATACTAACCCGTGGAA
CTGTTGCATCTGCTTCTTAGAACTCTATGGCTATTTTCGTTAGCTTGGCGTCGGTTTGAA
CATAGTTTTTGTTTTCAAACTCTTCATTTACAGTCAAAATGTTGTATGGTTTTTGTATTC
CTCAATGATGTTTACAGTGTTGTGTTGTCATCTGTACTCTTTGCCTGTTACTTGTTTTGA
GTTACATGTTTAAAAAAGTGTCTTTTTGCCATATTTTGTTCTCTTATTATTA
