Microarray Probes on PGSC0003DMT400025716
Probe ID | Chip | Probe Sequence |
---|
CUST_7410_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
GTTGTTGTTGCTTCCTTGTTCTCAGGTTTCCGAGTAAACATAATTTGGATTGATTTTACA |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400025716
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Source Transcript PGSC0003DMT400025716 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
---|
Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
TAIR PP10 |
AT1G76570.1 |
+1 |
5e-18 |
85 |
34/51 (67%) |
Chlorophyll A-B binding family protein | chr1:28729132-28730754 FORWARD LENGTH=327 |
Transcript Sequence (1370 bp)
>PGSC0003DMT400025716 1370 pgsc_dm_v3.4
AGTATCTGGTATGGAGAAGATCGCCCCCGCTGGCTTGGTCCAATTTCTTATGACTATCCG
GCTTATCTTAATGGGGAGCTACCCGGGGACTATGGATTTGATATCTGCGGGTTGAGCAAG
GATCCCGTGGCCCTTCAAAACTACTTTAAGTATGGATTGGATTTTGCTTCTATTAACTCG
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TCCAGAACTGTTAAACCTGACAGGACTTTTCCAGTTTGTGGAACCTGTTTGGTGGCGAGT
GGGCTACTCAAAGCTTAAGGTTGGTATCTTTCATATATGCGCTGTTGCTTGACTTCCCTT
GGTTGATAGATGCTGCTTCCCTTAGCTATTGATGTTATGAGTCCAAAAACTCCCATGCTT
GTTCTTTCCTCCAATCTCACCTCTCCAGTTATCGACTCAGCGGAACCTTGTCTGTCGACC
CAAGCAACTCATGTCGAATGTGCAAGTAGGTGAGAATCGGATGAGTTGATAATGCTACAA
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GGGATTACACTGGGTTTGTTGTTGTTGCTTCCTTGTTCTCAGGTTTCCGAGTAAACATAA
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