Microarray Probes on PGSC0003DMT400006302
Probe ID | Chip | Probe Sequence |
---|
CUST_17859_PI426222305 |
JHI_St_60k_v1 |
GGAGCAGAGTCCTCCCTAGTACTTTTCGTTATGCTTTTGTTTGTATTTTGTTCCTTTGAT |
Link to Spud DB Genome Browser for Transcript PGSC0003DMT400006302
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Source Transcript PGSC0003DMT400006302 - Homology to Model Species (BLASTX to E-value < 1e-50)
Database | Link to BLAST Hit | Frame | E-value | Score | % Identity | Description |
---|
Tomato (ITAG) | None | - | - | - | - | - |
TAIR PP10 |
AT1G61820.1 |
+2 |
3e-128 |
229 |
113/263 (43%) |
beta glucosidase 46 | chr1:22835452-22838444 FORWARD LENGTH=516 |
Transcript Sequence (1789 bp)
>PGSC0003DMT400006302 1789 pgsc_dm_v3.4
ATTTCTTGAAGATGGAAAAGGGTTGAGTAATTGGGATGTTTTTAGTCATACTAAAGGAAG
GATAAATAATGGAGATACTGGAGATATAGCGGATGATCATTACCATCGATTTCAGGTCGA
ATATCTGGATTTTGACTAGTTCTCTTAAAAGAAATTAACTTTACTTTCTAATTCTATGAA
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GTAAAAAATAACTATATTTATTATTTTAAAAGTTAAGGATAATAGTAAT