Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_99201 (6796 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_99201

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_81970 3 3167 bp MLOC_81970.1 Available Available LOC_Os03g50520.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13103.m05494 protein dynamin family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_81970






Contig Sequence (6796 bp)

>contig_99201 6796 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TACCTTCCTTTTCTGGTGTCTCCAGAGTTCTGGGAAGTCGTCGGTGCTCGAGAGCATTGT
CGGGAGGGACTTCCTGCCCCGTGGATCTGGTAATCCCGTCGCTGGATCGCCATTTTTGTT
CAAAAACTAGTCGGTCCTGGGTCGCTGATTTGCGTTATTGTTGGCTTGATCAGGGATCGT
GACGAGGAGGCCTCTGGTGCTGCAGCTGCACAAGACGGAGGGCGGCCAGGAGTACGCCGA
GTTCCTCCACGCCCCGCGGAAGCGCTTCTCCGACTTCGGTAAGGGACCTGTGCTCTCCGT
TTGTGCTTGCTTGTAGTTGTAGCCCAGCAGCTTGCTTGGTTTCTTCAGTTCCAAATTTTA
GAGTTAGAGCGTTGTCAAAAGATGTTTTCAATTGCAATTATAACCGACACAAGAGTACAT
GTGAGCAAGCATTCTGCATTCCCTAATCATACTGACTGCCTGAAACCACATCCATTATTA
TGTGAACGATCTATCTACAAACAAGATACAATTAGTGTAAACACTGCCTGCCCTGCTATC
AAAATATACGTTCACAATTTTTATGTCAGAACATGCAACCGTCGTATCTATATCGGCCAA
AATATCATAGGCATACCACATGATTACTCCACGCCCCACGGAAGTGCTTCTCCGACTTTG
GTAAGGGACCTACGCTCCCGTTGTGCTTGCTTGCAGCCCAGTAGCAATTACGTAAACATT
GCCTGCTCTGCTATCATATATAGGTTCACAATTTTTATGTAAAAAGATCCAACCGTTGTA
TCTATAACGGCCAAAATATCATAGACATACATGATTACTATGTGAACCGTCAACCGTGTA
ACATTTGCCAGTGACTGAGCATATTTATGTGTTAAGAGTTGTATTTTGACTCTGTACCAG
AGTACTCATCAACAAGTAAGCAATGAAAGAAGAATGTATAGTACCATCTCTGTTTTTGAG
CCGCTCGACTAGTCGATGAGCCACACTTCCAGGGTCGACTCGACCTCTCGACTCGACTCT
TGGGATGAGTCGAGCGACGTGGATTCTGGGCCGAACGACTCGTTGTTTTGGGCCCCACCT
GTCATATTTTTTTTACTGTATTTGTTTGCCCACCCCCCTGGAAACCTAGATCGAACCAGT
CCAACCCCGACCCAACCCTCTACTTGGCAGCCGCCACCACCCCTGGTTTGCTGATCGTCT
CCACTCCGCCCCTTCCCTCCTCCCCTGGTTGCTGCTGCTCAACCCCTCCCCCTCCTCCCC
TGGTTGCTGCTGCTACTGGTCTTCTCCTCCCCTCCTCCCCTGGTTGCTGCTGCTTAACTC
ACGTCGACTCATGAGTACCATACAACACATCTTAGAATCATCACAATGTATGAATACTTT
GAAGGTCCATGCAATATGAAAACAGTTACTCCCAATAGTACATCGTGAGCATCTAGTACT
TTTGTTTTCCTCATACAGCAAACTTAGTTATTTGTAGAGCTCAACCGATGAATTACATTG
CTTTATCTTTTCTTTTAGTACCATGAACAATAGCTTCAATTTAGAAAATTGGGCAATTTC
ATTTCTGGAAGAATTAACTGTATTAGTTTGTGAAAGCATGTGAACCAATTCATGGTTCCT
GGCAATTGTACTTGTTAATCTCTGGGCTGTTCACTGTTATTTAGCATGATAATTGTGATG
TTTATTTGGTTGTTTATTTTATTATTAGTGTTAGACATCAAAACATATGTGATCATTGAT
CTACTCTTTTGTTTGTTTGTTTGTATTGTGGTGATTTTAAGTTATTTTTTTGTTAAAACC
TTAATGCAGCTGCTGTTAGGAAAGAGATTGCTGATGAAACTGATCGCATGACTGGAAAAA
CGAAAGCAATATCAAATGTTCCTATCCATTTGAGTATATATTCTCCACATGGTAAGACTT
GGGTATTTGTTTAGATTTGCTGTTGTGTATCTTAGTGGTTACTTTTCATATGTATAGTTT
TTCTTTTGGCAAAATGTGTTGATGCTACTGCACTATATTGCCGGTACTCCAAAAGATTTC
TATGTGCTAATTAGATATGTAGTTTGTTTTTTACCTTTTGAACTGCTTTAATTTGGCAAC
CTTCTTTGTGCAGTTGTTAACTTGACACTTATTGATCTTCCTGGACTGACGAAGGTTGCT
GTAGGTAATATTTCAATTATTGACTTAGCTGCTTCTTCTTTGGTTAACATAAGATTCTTT
ATTGCATTATTATATAACTATCCTAACTGCAACTATCTACTACAGAGGGGCAGCCTGAGT
CTATTGTGCAAGATATTGAAAACATGGTCCGGTCTTACGTCGACAAGGTAAAAGTCATTG
CTGTGGTTTGCTATACTGATTAGGCTAAAACGTGAGTAATGCTTAGAACTGGCATAACAT
ACCAGGGAATATTCATGAAGTAAAATGTAGCTCAAATAAACATGGTATTACAATGGTGCT
GTATTGGCATTTTTTTCTCCCTTCTGGGATGGGTATGATAAATTAAGAACCAGTCTTAAG
TTTGCGTTCATTCTTGCTCTCTTGCTATATTTATATTGTGATTCTTATTTTTATTTACAC
GAGGCAAAGATGATTGACCATACTGTTGATCAAAATCTACAACTTTCTTGACCTATTTTC
GTTGTCTGGAAACTTCAGCCAAACTCTATCATATTGGCCATCTCTCCAGCAAACCAAGAT
ATAGCAACATCAGATGCTATCAAGCTTGCTAAGGACGTGGATCCTACAGGTGCAGTTTGA
ATTTTGTTCCTGCAGCATTTCAAATCTACTTTGCATAAAACAAGAATTATATATGTAGCT
TCTTTTGTTATCATGCCAGGTAATCTGGCAGGTTTCTTCTTTCTTTTGACATCCTTTTTC
ATTTTCAGGTGAAAGGACCTTTGGAGTTGTAACAAAACTTGATTTGATGGACAAGGGTAC
CAATGCTATTGATGTATGTGGTTTTGCAATTGCTATGAACTCATCCTCTATGGGCATATC
ACTTAAACTTCCTATCTTAATTGATCTTAGGTACTCGAAGGGAGGTCTTATCGCTTGCAG
CACCCCTGGGTGGGCATTGTCAACCGTTCACAGGCTGATATCAACAAAAATGTTGACATG
CTCGCAGCACGTCGCAAAGAACAAGAGTACTTCCAAAGTAGTTCTGATTATGGTCACTTG
GCACATAAAATGGGTGCAGAGTATCTTGCTAAGCTTCTGTCACAGGTTAAGTCATTTACT
CTTGCTGTTTGCTTTGCCAAAATTTTGAATTTTGCATAAACTGTTTGCTGATGTACTTCC
ATTTATTTATCCAGCATTTAGAGGCTGTGATCAAAGCCAAAATTCCAAGTATTATATCAA
TGATCAACAAGACAGTTGATGAAATTGAAGCTGAGTTGGATCGACTTGGTAGGCCAATTG
GAGGTGATGCTGGGGTAAGAACAACCATGCTAACATAAAAGCTGAAAGTAATTTGCGGCA
CAGCTTGGAATGCTTGTTTGCAGTGATGTTAATGGCATATTCCCAAACAACTTCTATATA
ACATTTCTCTTATACATTTAACATAATCAACAGGCACAACTGTATACGATATTGGACATG
TGTCGTGCATTTGACCGAGTTTTTAAAGAGCACTTAGATGGCGGGTAAGATGTTCAACTA
GCCATTTTGTACATGTGACTTTTCTTTTTATAATGATGCCTTGTATGTTCATAAAGTGCC
ATTGCTAGATAGATGGTGAAGATACTACAAGCATGCTTTTCCTTTTTTGTTTCAAAGAAT
GCTTCTGATAATTTACCTTTCATTATTCATTGTTACCAGTCGACCAGGTGGAGATCGCAT
TTATGGTGTCTTTGACCACCAGTTACCTGCAGCATTGAAAAAGCTTCCTTTCGATAAACA
TCTTTCATTGCAAAATGTTCGGAAAGTCATTTCTGAGGCTGATGGTTACCAGCCCCATTT
GATTGCCCCTGAGCAAGGTTACAGAAGACTTATAGATAGTTCACTCAGCTACTTTAGGGG
TCCGGCTGAAGCTTCAGTTGATGCGGTATTTTTTTTAATCCATGGCTCCTCTTGAGGCTC
CTTAATGTTTAAGCAACTGATATATAAACATACCAACTTAACTGATCTTCTCATGTAGAA
TCTAGGTTCTAGCCTATGGTATTTATTCATTACTAGGACAGTCCCCGTGCGTTGCAACGG
GATATAAACATTCTAGTACGTTCGCTTGTGATTTACCTGCCCATATTAACGCGATTGTGT
AAATAAATGTTTATTAAATCCTACCCGTGATTTACCTTATATTTTGATGAGAACATCCGT
AAGTAAACTAAAGTGGAATAAATTCAGAAGATAAGTAAATTAAGGTTATTGATTATCATA
TGGTGAAGGTTGGACAAAGGGGTGGTGGGAAGGAAAGTGAAATATGGAACCTTACATTCT
TTTTAAGTAAGTAGAGATAAAGTTAACTCAGGATATTGGTGGACTATGAGCAACTTCTGA
ACTAGTATAATAGGGACATCTGAAGTACGTATGGAAAGATGTTATTTCGTGTGATTATCT
TGATTAATTCAAAAAGGCATGTATGGATGTTGTATGTGAAGTAACATAGCAGGAAACCAT
TATCTTGTTGAAGTACTGAACGTCGGAATGGTTTAGTAAGTTTGTTCCATGTTCAAATGT
GGAAGCAGTGTGAGTAGAGCGGAAGTGGAATTTTCACATTTCTCTTTTTTTGACATAATA
TGGAGGATATCTGATAGCAATGCTTGTTTGGGAGCATTATTTTGTTAGCTACATGCACTT
GCTGATGGTCTCATAATTTGTAGGTCCATTTGGTATTGAAGGAGCTAGTCCGAAGGTCGA
TTGCAGCAACAGAGGTGAGTGCTATTTTTTAGTATTGGTGAACTTTGGTTATGGATGAGT
GATCGCCGGGCGTCACTCTTGCCTTGGACTGTTTCTCGTTTCTCATATATCATGTCTACC
TTGATTATTCCAGGAATTGAAGCGTTTCCCAACGCTTCAATCAGATATAGCTGCAGCAGC
AAATGAAAGCCTAGAAAGATTCCGTGAGGATGGCCGCAAGACGGTTATTCGTCTAGTTGA
CATGGAGGCCAGTTACCTAACAGTAGAGTTCTTCAGGAAACTTCCTACTGAACCAGACAA
AGGAGCTAACAATAACACTCCGGCCAACGACAGATATCAGGATAACCATCTTCGAAGAAT
CGGTAAGTTAATTATATTCAATCTTTTCAAAGGGACTATTGATCAGGCAACCGTTTTAGA
ATGTAGGATCACTAGTGCTGTAGAACCTTGGGGCTTGGAATAATTGCACATGATGGACAG
GCTCGCTTTATGCATCTTGATGTTAGTGTGGATAAATTATCCATGCTAACAGAGTTCGAC
AACAGTTTACAATATGCCTGTATCAATGACATCGTCCCTTTATTTCAGGATCGAATGTAT
CATCTTACATCAACATGGTTTGCGATACATTGAGGAACACGATTCCGAAAGCAGTCGTGC
ACTGCCAAGTGAAGGAGGCAAAAAGAAATCTGCTCAACCGTTTCTATGCGCATGTAGGAA
GCAAAGAGGTATGTTTTTGCTAACTACTTACTGAATCTACTATTTTCGCACATAAATACA
GAGATGTTTTACCCACCCACCAGTCAGTGGCTAAATGTGAAAAATTTCACCAGACTTTAA
GTTTGCGTATGTTAACCTTGTGTTGATTTGCATTTGTGTAAGTACAGCAAGTCGGGTAGA
GTCCTAAACCACTGGTCTCATTCTCCTCCATTTGTCATTGCTTCCATCACACAGAAGAAG
CAGCTGAGCGCGATGCTGGACGAGGACCCCGCGTTGATGGAGAAGAGGGATTCCCTCGTG
AAGAAGCTGGAGCTGTACAAGTCCGCAAGGAACGAGATCGACTCGGTTGCATGGAAATGA
TCTGATCTGATCTGATGGACTGTTCGTGGCTGGAACAGATAGAACGTTTGTAGTAGCGAC
GCTCCATTCGTTTTGCATATGCTTTGTACACGGTCTTTGTTGCCGAGTGTTGTTTTGTGG
CTACCGCCTAGACGAGACATGGACAGACGCAGTTGCTTCCTTGGGCCAACCATCCTTTGG
CCTCCTGTATGATCCGTATCGATTATATTGATGCAGATGATGTATTCTTTATTCAATTGG
TGTTTTGTCATGGCCCTCTAATGTGACGTGCCCTCTGAATCTCTGATAGACATTTCAGTC
TATGATTCGAAAATGCTAAACGGAGGCCCAGCTCATCGAGCACTTAATTTGAAAATTTTG
AAGTTCATATTTTTTATGATCCAACATGTTTTTTAAAAAGAATTACACATGTATACTTCC
TCCATTCCTTTATATAAGGCCACAAACTCATATTACAGATACTAGGACAAAATTTAATGA
CAGGTTCGAAAGTTAAGCTTTTTTTTTGTTAACCGGAATTATTAATACGTTGCATGCATG
CAACGAATGAGTGAGAAGAAAGTAGTCAAATGTCATTATGAATACATACATGCAATTATT
AAACAAGTTATTAGTACTCCCTCCCTCACGGTTTAAAAGACACAGTTAGACTTGCGTACG
TTTTTAAAATAGACAAAGACTAAGTCACGTTGCATTTATTCCTAGCAGCTAAGAGCAACT
ACAATAGTACAGCTAGCTGCTGGCTATAAGCCATTGTCATGTCATCTATAGCCCATCTTA
TAGCCAGCATGTACAATAGTTCATTGCAAAAGTGTACTACTTCTTCATTATATGGTCCAC
CTTTCATACTCACAAA