Map Locations of contig_97412 (2935 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_97412

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_81647 1 200 bp MLOC_81647.1 Available Available LOC_Os04g55960.1, FRAME:+1, EVALUE:7e-17, 13104.m05813 protein NADPH reductase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_81647






Contig Sequence (2935 bp)

>contig_97412 2935 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CAGGAAGCGCGTCACCATCTTCTTCGACACCCAGACCGGCACCGCCGAGGGCTTCGCCAA
GGTCCGTCCCCCCGTCCGTCCGTCGCTGTCCGAACCGATTCGGCCCAGATCCCAAAGCCC
GCCTGCTCTTCTTTTTTAATCAGCACGAGTGTCCCCCATGCCCGTCCCTTTTTACCTTTG
ACCCGATTCTGATTCCGCTGCGGGCTGATTCAGTTCACTCTGCTATTTTATTAACCTCGT
GCCGCGATTTTGGTTGGTGCATGCGTGCAGGCTATGGCGGAGGAGGCCAAGGCACGGTAC
GAGAAGGCCGTCTTCAAAGTGGTGGATCTGGTAACTTGTCGTCGATCTGCTTGTTTATGT
GTGTTGAGCTGTTTCTACATGGGATTCTGAGATATGCTTGGAACACGTGCAGGACGACTA
TGCTGCCGAGGACGACGAGTACGAGGAAAAGCTCAAGAAGGAAACGTTTGCGCTCTTCTT
CTTAGCAACGTGAGCTCTCTCCCTTTTTATACGTGGACTGCATGTGAATTGCCCTCACGA
GCTCTTGCAGTTTTGGTTCCTAGATTACAGCTGAATCGCGCATGTGAGCTCTCCCAGTTT
TGGTATTGCGCACGCGGGCTCTTGACGTTTTGATTCATAGACTGCATTTGAACAACACAC
GTCAGCTCTCGGCGTTTTGATCTAATTTGCAGGTTGACTTGACTTCGCACATCGTCCGCG
TCCTCACTTCACTCAAGGTATGCTGCTGCGCTCTACTCCTGCAGTGGGAATTGCAAATTT
AGTCGTTCAGCTCACTGTTCCCCCAACCCCGTGAACAACCTACTCAAGTAGTAATGCTTT
TGTAAGTGACGCTAGCAGCAGGCGGCAGCTCCATGTCTGATGCAAAGTTCACAGCTATAG
CAGCACTCGGTTTCTTTCTTGGCCTGGATGGACACATCCTTGGCAATTTCCTATGATCTC
TATGCGCCTTTATAGGTCTGAATTACATAATCATGGGTTTTTGTCCCTTTGGCTTGCAAT
TATGGGCTGCAATGCAGATAGGTCTGAATTACATTTCCTATTGCTTCGGAGTCTTGTCTA
ATTTTTTGTATTTGAGATGAACCAGTGCTCTCATGTTCCACTAATTCTTAGCCGATCGTC
CGAACATGTTATTTCCCCCTGATAACTGTTTTAACTTTTGATTCCTGCCATCATTCTAGG
AAGAGTTAATACCACCATTGGTACAAACACTTGTAGTGGTGGGAACAGAATCATACAAGA
ACTAAAAAAACTCCAAAGAACTGGCCCTTCAACTTAGCTAAGAGAACTTTTCCATACAAT
TCTGTTAAATCCTACGTACACCATCTATTTTCTCTTAACTACAGTTGTTGCAGTTGATGT
CTCTCACAAAGAAAACTATAGCCGCTGCACACGATTTGAAAACGCGACCTATATCATTGT
TTTACGTTGTGTTACCAAGACAACAAGCATCACTTGATATGCAAAGCAGAGACATCTATT
TTTCTTTCAAAATGATATTTTGTGGTGTACTAGAGTATGGTGCTAATGTTCTTGTGCTTG
AAACATTTTACTGAAATTGTTATAGAATTTGTTGACATTTTCATGTAGTCTAAAAAACAG
TTTACTAACATTGTAGAAGTTGAAACTATTAGACGTTGAGAATTGTCTGCAACTACTGTT
GTAATCTTGTAGATACATAAAAGTTGATCTGTTGTTGTGGGAATAAATCATTATGAAACA
TTAAACTCCAAGTTAGTTGATTCACCACTTTTGAGCCTTAAAAAGGAAATATCACATTGA
ATAACATGTCGACAAAATTCATCGTTCAACAGTAACAATAAATCTTTTTTTTGTACATGA
GTTCTATTCATTCAGATGGGATATACGCAATCAATTTTCATTATTCAAATTTAACCTGTG
AATAATAATTTCTTCTATGTAATTTTTCACTAACTAATAATTGCAAATCTTTAGTGATAG
ATCTTAACACCAAATTAATGATATCGGTTTTATGTCACAGAATTAAACCATGTATTTCTA
GGTATAATTTTACTGAAAACAAAATGAAACTGAATAATAAAAATATATGAGTTACTGGCC
AAGGTTTGAATTTACCTACCAAAGCATGATTTATATATCCAAGGCAGAAGGGGTTATTAT
TCTATTGCATATTATGGGCAAAGAAGTTAGCAATGAGTCGTAGAGGACAATCATCTAAAT
ATGGATAATTCTATTTTGGAAATAAACTAAATAAAAAAGGATAATTATTTAGAAGAGCTT
TCTCGGGCATGTCGCCGCCCACCGTTCTGCTTAATATAACGGAATGTACGATAATACTTC
TTGTTTAATGGTGTAGAAATTTTTAAATCCTAATTTAAGTATATCATGCTGCAAAAATGT
TTAATTCTTAATTTTGGTAAATCACACCGACTAATAAGTGGTGCTGCTTGTCATGGCCAT
TGGTGCTTCTTGTTTAATGCAAGTTGTCATGGTAACACGCATGAAAACCATATCGAAGGT
CTTTTGTTCGAAGGTGCGCCGCAGCGCATAGTTGTTTGTTTTCTATTTCTTTTTCCATCT
ATGTGGTTCAGATAGTAAACATTTATCTCAACTTTTGACGGATAGTTCCTTCTGGTTGGT
GTCTATCTCGTGCGTGCTTTTAATTCATGTCATTTGAATGCCCCATCCCCCAGTTTTGAA
TCCCCCGTAGCTCATTTTTTAATAATACCGTGCATCCCACCAACAAGTTGGTCCACGGTG
GGAGAGAGAGAGAGAGTGATCGTCTGCAGCAGTTGTAGTTTTTTTGTGAGAGACACTAAC
AGTTGCTATTAAGAGAAAATAGACGGCATACGTCGGAATTAACAGAATTGTATGGAAATG
TTCTCTTGGCTTAATTGAAGGACCACTTATTTGGAGTTTTTTAGTTCTTGTATGA