Map Locations of contig_95794 (6987 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_95794

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_81336 1 1207 bp AK358390 Available Available None





CDS Structure of MLOC_81336






Contig Sequence (6987 bp)

>contig_95794 6987 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCATGCAAGGGAAGTAAGCACTACGGAACACACATGAAATCATGGCACAAAATGATATCA
TCAAGATCTCTGACAAGGTGGCCNNNNNNGGAAGGTTACAAGAAGGGAAAGTTCTACACT
TGGGGCATTACAGACTTCTTCAGCACTGGGATTATGTCGGATGGGTTAAACTCAACTTCT
ATTGTTCTTATTCCAAAAATCCCTAACCATGTTAAGATTTCTGATTACAAGCCTATAAGT
TTGTGTAATGTCATATACAAAATTATCTCAAAGTGTGTGGCTAATAGGCTTTGGCCTCTC
TTGGATGGTCTTATATCTCCATAACAGAGTGCGTTTATTCCAGGATGGATGATCACAGAT
AATGTGCTTGTTGCCTTTGAGTGTATTCACCATATTAAACAGGAAAAAGACCCCACTAAA
AGTTTTAACGCTTTAAAACTGGATCCGTCCTAGGCATATGATAGAGTGGATTGGGTTTTC
TTGAGGCAGGTGATGCAAAAGATGGGTTTCGCTCAACGATGGATTGACTGGATTATGACT
TGTGTCACATCGGTGAGGTATGTTGTTAAACTTAATGGGACCCTCTTGGATTCATTTGCA
CCGACGTGTGGGCTTTGGCAAGGTGACCTCCTTTCACCATTCCTGTTCATGTTTGTGGCG
GACGGCTTGTCGGCGATTCTTTGAAATAAAGTTGAGAGGGATGAGATCTCCCCGGTTAAA
GTATGTAGGCTTGCTCGTGGCATTTCCCATTTGCTCTTTTGCGGATGACACCTTGCTGTT
CTTTCATGCGTCTAGGAACCAGACTGAGTCTGTGAAGGACGCGCTTCAAATGTATGGTAA
AGGAACAGACAAATGTCTCAATCCTGATAAGTGTTCGATTCTCTTCAGTACAACTTGCCC
ATTGGTGCAGCAGGAAGAGGTGAGAGCTGTGTTGGGAGTGTCTAGTTTGGTGTTTGAAGA
AAAAATAACTAGGCATGCCTACTCTCGAAGGCCGGATGTCGAAAGGGCGCTTCAAAAACC
TCCAGACAAGGCTCACTAAGAGATTGATGCAATGGGGGATGGGTATCTAGCCCAACCTGG
CCGGGAGGTTTTTATCAAGGCTGTAGCGCAAGCACTTCCCACCTACATCATGGGAGTTTA
CAAACTTCCTTTTGCTGTTTGTGATGATCTAACTCAGATGGTTAGGAACTTCTATTGGGG
CTCAAAGAAGGGAAGGAGAAAGGTACACTGGAGAGGATGGCATTACTTGTTACAGCCTAA
AGATAGAGGAGACGCAGGATTTCGAGACTTTCGGCTGTTGAATCAGGCGTTACTTGCTCG
CCAAGCATGGAGGCTCATTAGTAAGCGTGATAGTCTATGCACACGAATCCTAAAAGTTAG
ATATTACCCTCGTGGCAATCTTATGGATATTGTCTTCTCAGGTAATGCGTCATCGTCTTG
GCAGGCTGTTAGTCATGGTCTTGATCTTCTGAAGAAAGGAATCATTTGGCATGTTGGGAA
TGGTTAGAATATTCGTGTGTGGCGAGATAATTGGATACCACGACCTCACTCTTTTAAGCC
AATATCTCCACAAGCTCGATGTCGTATTCGATTTGTTTCAGATTTGCTTGACAGCAATGG
ATCCTGGAATCTTCAGCTGCTACAGAGGTACTTCCTGCCGGCGAATGTGTCTGAAATTCT
GAAGATTAGAGCTTCCCCAAGGCTGGAGGAGGCTGTTGTTGCTTGGGCGCCTGCAAAGTT
GGGGGTGTTCACAACAAAATCAACATATACATTTGTGTTCGATGAGTCTGTCAGGGAGTG
TGCGATCTCTTCTAGTTCAGCACCGGATGGAAGCAGAAGCTGCTAGAAGTATATGTGGAG
CTGCAAAGTGCCACCAATAGTAAAAAACTTTGCTTGGAGAATGTCACTCAATTCGCTCCA
AACCTGGAGAAACAAGCATAAGATTCGGTTGGAAATTACTAGTCGTTGTCCAGTTTGTGG
TATGGAAGAGGAGGACAACTTTCATCCTTTTGTTAAATGTCAGTTTGGTAGGGATCTATA
CCTTGCTATGGCCGAAGTATGGGAACTTCCAGCGTTGCAAATGATGGAAGGAATTGGGAA
GGAGTGGCTGCTTCATGTGCTCGCCCTACTGTCCGAACTACAAAGGGGTTTGCTGATGCT
AGTCTTTTGGAGAAGTTGGTATGTTCGCAATCAACTGGTACACTCTAAACCTGCTCCCCC
ACTGTCGATCTTGGTGAAATTCCTGCAGGATTATGTTGAGGCGTTATCAAGCATTAACGA
AGGCTCTTCCCAGGATCTGATCAAAGGGAAACGGAGTTATTGTTTTAGCAAAACTCCATC
TAAAAGAGTTGGAGAGATTAGTCATGCTGCCCCTGGAAACCACCCCCATCAGGTTGGGTT
AAACTGAATACGGATGGCTCTTTCTCGGAAGATGGTGATGCTGGGGCAGGAATAATCCAG
CGAGACAACCTGTGGGCTATTGTGTTCTCCTCTTGCAGATCTCTTTTATTTTGCACAGAT
GCTCTGGAGGCCGAACTATATGCTTGTACGGAAGGGATTTCCTTCGCCATTCAATGATCC
GACCTGCCAATTCTGATAGAGATGGACTCGAGCACAGCTGTGGCGATGATTTCAAGTGGT
GAACCGGATCGATCGGTGTATGCCTCTATAGTTGGTGAAATTAAATATCTTTTGAGTCTT
AGGAAAACTTGTTTTTCTCTTATACCTAGATCTCAAAATAAAGCTTTCGATCGCCTAGCT
AATTTTGGTAGGATCAAAGGTGGAACTATGACTTGGGTTAGTTCTACTCCTAAGCATGTT
TTGAAGTTGGTCTTGGATGATTGTGTAAACCCTCATTTTGAGTAATACAAGTATTATTCC
GGCAGAAAAAAGGAAGTGGGCAGTTGGAAGGTGGATGGATGAGGGCTAGTGGAGCCCACA
CGTCAGTGAGCGGTTTCGGGAGGCTTTGTCGGACATGTTGGTTGCATCGCGGACTTTTAT
TTTTTGGCCCTGTCTGTTGCGAGCAAGACCTTTTTTCTTCGCTTATAGTGCTCACGCTTT
TTATTGATCACCTCGATTTTGAGTTTGGCTCAAGGGTGCTACGTGTGTGTCAAATTCCAT
GTTATACTGAAAATCATGTTATGCATTAAATCAATAAAATCTTACCAAAACTACGCCATG
CATTAACTCAAACAAATTAAATGTTAGCAAAATCTCAACTAAATCAAAACTTTATTTGCC
CTACCTTAACATTCTCAAACCAAATTAAATCATACTATAACCTCAGCTAAATCAAAACTT
TTATTACCTTCCCTACACATACTCAAACCAAATTAAATCATACCAAATCTATAATATGGT
GTGTTGAAAGTATATATTAGACACGATTAATGTTGAAACACCAGAATATGTATATGACCC
CGTTGCACGCAAGGGCAATTAGCTAGTTAGTATAAAAATATTATTCGAGAGGAGAAATAA
GTAATTTGGAATATATAAAATAATTATTTAAATTAAATATTGTATAAAACGCATGGTAAT
ATAATAACTTTTACTAAAAGTCTTATTAGGGCATCTCAAGCCACCCACATTCTTCCGGAT
CAAGCGGTCCGGACCCATTTTTCCATCCAAGGCGGCACCACATTCATCCACGGACCGGTC
CAGATGTTTTTTTCCTGGATACCATTCTTATCGTTAAGCTGTCGTTCATCCCGAATGACA
GTTTGTGATGGCAGAGGAGCTTGTTGCTCTTAAGTGCATCAGGATATGGGATCTTGTTTC
TCTTCCTTCTAGTGTTTGGCTCATCTCTTTCAAGTGGGCCTACAAGGTTAAGACTCGCTG
TGATGGTTCTCCTAACACTACAAAGCTCATCTTGTGGCTCGCGGCTTTTGGCAGGAGCAT
GGTCATGATTATGATGAGACTTTTGCTTGTGTGGCCCATATGACCACTACTTGCACACTT
CTTGTCATGGCCTCTGTTCGCGGTCAATGTCTCATCTTGATGTTAAGAATGACTTCCTTA
ATGATGAGACGCATGAGGAGATGTACATGTAGCCCCCATGTGGGTATTATGTTCCCGATG
GCATTGTTTAACGTCTTTGTTGCTCTCTCTATGGCCTTAAGCAAGCCCCTCGTGCGTGGT
TTGAGCGTTTTGCCTCTATGATGTCTGCCGCTGGTTTTTCAGCAAGGGCTCATGATTTAG
CGTTCTGTCTCCACCTTTCTATTCGTGGTCGGGGTCTCCCTCTTCTATATGTTGATGACA
TGATTATCATCGGCGACGACCCCAAGTATATTGCCTTTGTGAAGGCCCGTCTTAGTGAAA
AATATCTTATGTCTTGATCTTGGTCCTCTTCACTACTTTCTTGGGGTCAAGGTCTCTTAT
ACCTTCGATGCCTTTTTTATTTCCGAGGAAAAGTATACTCACTATCTTCTTGCTCGTGTT
GTTCTTACTAATGAGTGCGTTGTTGAGACTCCCATGGAGCTCATTGTTCACCTTCGTGAT
ACTGATGGTGGCCCCTTGTTTGATCCGGCGCGTTATAGTCATTTGCTGGAAGTCTTTTAT
ATCTAGTTGTCACTCGTCTGGATATCTCTTATCCAATCAATATTTTAAGTTCGTTTCTTT
ATGCTTTCACTTTAGTTCACTATACTCACCTCCTTCATGTTCGGTGATATCTTCGTTGCA
CAACATCTCACTGTTTGTTCTTTTCTCGCGTAGTTCGTTACGGCTTCAGACCTATTCAGA
TGCTATGTAGGCTAGCAATCCCTCATATCGCTGTTCACTTTTTGTTTACTATGTTTTTCT
TGATGGTTCTACCATTGACTGGAAGACAAATAAAAAGACTACGGTTTCCCATATGAGTGT
AGAGGCTGAGTTGCGAGATATGACTCTTTTGATAGCAGAGATGACTTGGTTCCGGTGATA
CTTCAGGAGTTTGGTATTTTCATCACTACACCTACTCTGTGAAGCATGAGCTCGCCAAAC
ATATTGGTATCGATTATTTTTCTATGCACATCGGTGTGTTGGGTGAGGTTATTACTCTTG
AGTATGTGAATTTCAAGTTATAATTGATGGGTTTCTTTATGAAGGCCTAAACAAAAAACG
TCGCATAGATTCTATCTCTCCAAATTCAATGTCGTTGATCCATACTTTGTCAAATATATG
GCCCCATGGGAATACAGATTGCCTATTTCCTAACAACTACTTCCTCCACCCCAAAATAAA
TGTCTCAAGCTTATTAGAATTTTATACTAAAGCTAGTACAAAGTTAAGACATTTATTTTG
GGACGAAGGGAATACATTCCAAACAATACAACCAAACAAATTTGTCAAATATAAATATTT
AGCAAAGTATAGATCTGTGCAAATATATTACTGACTCCAATGTTTCTTGATATATTCAGC
AATCCATCACTAGAGAAATATTATATCAGAAAGTGGAAAGCCAACACACATATCTATGTA
TGTGTGCACTACAAAAAGTGTTCAGTTTGTCAATAGTCGGAAAAACAAAAAGAATGACAC
ATACCACTCCACAAGCGGGATGGAACAAAGAGGTACATGACTAGGAACACTTGGGTTCAG
ATTGTTGTTGCTGAACTGTATTATTATGATTTGCTTACTGTACAATATGTTGTGGAAAAT
TGTAACCAACTAGATTGATACTGACTAAAATTAAATTGGAAAATAGGCAAGTGGATACTG
ATTGAATCAACAAAGCTTGACTGGGCAAAAGGCAGGTTTGGATGGACCCATAGTTCGGCT
TCCTTACCAATCTAAGTGACAGCTCAAATCACATCTAGCCAAACAATCAGTGGGAACAGC
TGAATACTGCAAGGTAACAAACTGAATGAAGGAAAGAGCTGAAGAGTATAATCTCAGTGG
GCACAGTACAAATGATAATCCTAACCTTGGCTGGGTGCGATGAGTTCATTAGGCAAACGG
GTTTTATCAACCAACGAAATACCCAGTGACCCATAAACATCAACATCACAAAACTATGAC
AAACCTTAAACACATGTTCAAATAGAAATGACAAAACACATAACCCTACCGCAACCCTCC
GCAGACTTGGTATTAAATACTTATCAGTCATTCTCTACCATCAGCATCAGCAAAACACAT
TCACTAAAGCTAGCCAGTCATTTGCAGAGACAAGCTTTACAGATAATAAAACATCGTACA
TAACATAACAGAATCTACATTCAGCATTGGCAATCTCCACAGCAGGATGAGGTTCCTGAC
GCCTCCAGTGCTTAAACACTTTGCCATGCATAGCAGAGTCAACAAAAGGAATAAGAAATC
CACACACAAAATTCCCAGTTATGTTTCCTGCTCCGATCTTTCCAGAATGGCAGGACAGAT
CTGCTTCGGACCACGAAAAAACAACAGCATGCATGCTGCCACTTTCAACACGTTGTTCGG
CGCACCTTCATAACAAGTTTTTGGGGGTGTGCTCCATCACAATAACTCATTTCGTACCCG
AAGGGTCTGCCTAAATAATATTAATCTTTATCTTCCTAGGCGGTGTTCCAGGTTTTGAGT
TGCCTGTTCCAGCTTTCCCTTTCTTTTCAGAAGGTTTAAGGATCTGGAATGAGCATGTTA
GTGAATCATCTATGCTCATCATGGCACCAGCATTGTCGAACTCGCCACAATAGTTGGGTG
CAGAGAATATGGTTACGAGCTGACGCTTTGCAAAGAATTCATATCCATCCTCCACCACCT
GTGCATAGATGATTCATGTAAGAAAGTGAATGGTAAACAGAGGAACTATTGCAAGGATAA
GATTTTTCCAATAGCAACAGATCAACTGAGAATAACTAACCTAGAGTTATATGACTTGCA
GTAAACCAAGCTAACTCAATGTACTTATTGTAGAAGCAGCTAAAATATCAGCATTTTGTG
AACTGAATCACATTCAAAATTGCATGAAGACTACTATATGCTGCATAAAGTCTTAACCAA
ATTTATGACCCATGACCTCAAAACACT