Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_93522 (6470 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_93522

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_80909 1 243 bp None Available Available LOC_Os03g31940.1, FRAME:-3, EVALUE:8e-13, 13103.m03646 protein transposon protein, putative, Pong sub-class
MLOC_80910 1 229 bp MLOC_80910.1 Available Available None
MLOC_80908 1 1345 bp MLOC_80908.1 Available Available None
MLOC_80907 3 3078 bp MLOC_80907.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_80909






CDS Structure of MLOC_80910






CDS Structure of MLOC_80908






CDS Structure of MLOC_80907






Contig Sequence (6470 bp)

>contig_93522 6470 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCGCAGCTTGGCTGCATCTCGCTTCGGATTTGGTACTATCCCCACCTCTCCACCTCTCT
CCGAGACGCACACACACGCGCGCGCGCTCTCTCTCCCCCCTCTCTCTGACCGGATCAGGC
GAGCGCTCGTTGCCGGATCGCTGAACCATCGTCCCGGTGGCCGCCGCGTCAGTTCCACAC
CGCCACAGCGCCGCCAGCCACCGCCGCTCCATTGGCTTGGATTTGGTTGTGGCGTGGGCT
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TGCTTGTTTCAATTGCTATTTGACTTTTGATTATGGTTTCCTTCCTATCATGTTCATGAA
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TGTATTCTTGCTCACTTGCATCCATGTATACATAAAAGGTGTATTGATAGTTCGGTTATG
ATATTAGTTCTTTCGGTAAAATCATGTTCTGGTCAATGCGAAGGATTGTTTTGCAAATTT
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GGGTTTTGTGTGACTATGTGGAAGTGTGCAAATTGGGACGGCTTGCTTTCTGTGAGCAAC
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ATTATTGGTTTGATTCTTCTCAATATGTTAATAATTTATAGCAGTATTGGGATCTCACTG
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CGGAGGGAGTATATGTTATCATCTACGACACTTGCGAGATACTCTCATAGCGAACTGGAT
GTTGAGTTACACTTACATGCTCAGAATGCTTTGAATTAGTGATGCATCAATAGATTCTGC
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GCATCCCTTGTTCAAACTATGCTATTAGTTGCAATTGTATGTATGTTCTTACTTGCATGT
TCTATTTCTTTGCTCAGCATTCCCATTTAGTAGTTCCTGCATTTTATTTTGCGCCTGGTT
TTCTTCCTTTCATACATTTGTTGTGTTATTGTATAAATTGTGCTATATTGCTCTTCTTCA
TTCATGCATTTGCTGCACTATGGCACCTCAAGCATCAGCAATAAGAAACTGTACTACATT
TGGTCTTCGCTGTCATCATACTGTATACATCATTTATAGCAGTGATGGTATCTCACAGTA
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TTTCTACTCTTCCTGCGCTTGCTGATGCATCAAATAGGCTGTACTTTGTTTAAATAAAAA
AAGATCATGTGTGCCGAGGGCCCTTGGAGCTATTAAGCATTTTCTTGGGGCTACTAGTAA
GTTGATCCATCCACACCAAAACATGATGACTTAGCCAACAGATTCTGAAAGTAAATGAAA
TATAATTATGGAGGGGATGGTGCCTTGAAGTCAAGTTCATGTGCATCTATAGCGTACCAA
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AAAAAAATTCTTCTCTATTTGACCCCAAATGTAAAATTTGTTCCCTATGTGACACTTCTG
TCTAGTTTGGGCACAAACAGTGTTGAATACAACATGAAAAGACCATTCTACCCCTGATGT
AATGCAAGGTTGAAAAAAATAATCTTTCATTTGTTCGACTAAACCGGTTTATTAGAGGCG
AAAGAAAGAGAATAGCGACAATGCTTGAGGATTTGTGAGGAAAAGTATAAGGGGTGCTGC
AACTTTTGTGCTTGCATGCATGCATGTATCTCTAGTGCTAATTGCTTTGGTGAATAGCAT
TCATGGTTTATTTTTTGTTCCTTTTTTTCCGTCTCACCTTCCATCACCATCCCTTCACAT
TGGTTTTTTCACCTTCTAATAAAAACTTTCATAACCTTTCCAAAATTTCGTAACTAGCCA
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ATCAATTTTGAATCCTAAAAGCATCTCTAGCAGACCTTGTATAAAGCCAACCCGTAAAAG
TGGTTTATAGTACGCGAAAAAGAGATATTTGTAGAAGATGCTTTTTTATAAGTCGACAAT
GCGAGGTTTGCTCGGTCGGCACCAAATCGACCCTGCAAGCTGAAGTGCTCGTAAAACAAA
TGTGCAATATAAGTAAAACGTCAATATTACAAATACAATAATCATTCAAAGTACAATAAT
TATTCAAATCACCGTAGCAAACTAAATAATTTAATACAAAACTAGTATACAAATCACACA
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ATGCTTAATTACATCCTTCTCAAGTTAATAGTTGTGTTTCAATCCTTCTCAAGTTGACAG
TTGTGTTTCTATTTTCAATAAGTCTGAAGAAAAGCTCTAATTTGGTTAGGGTCTCTAGCT
GGTTTGACACGGCTGCCCACACTGTTATAGAATAATTTCATCCTTTCTCATCTTTGAGAA
TCATATGGTGAAAAATAACATTGCATGTCATGGTGTTTTTCAAGGATCACTTGTCTCAAA
ACCGAGCAGGACCACGAACAATGGCAAAACTAGATTGCAAAATCCCAAATGCTCTTTCAA
TGTTTTTTCGGGCTGCCCCTTGTGCCTCGCGAATTCAGACTCTTTCCTACTTTGGGGGTC
TTTGATGCTCTTCACAAATATGCATGGGTATATAATCTATAAGATAGTACCCTTTTGTGT
ATTCATGTTCATTGATACTGTAGTTGCAAGTTGAAGCATCACCTAGCAAGCAAATGAAAC
TGTTGCAACACATTCACATTGATATCATTTACAGTATCCGGCATATAAAAAAGCAATGTC
AAATCCATAAATTATGTTAAGCTATGACCCATAGTACAATTGTTGCATCACGAGACTTGT
CGCAATACATTCCCTGTCATGCTTTTGAGTAACTTTTTCAAGTTCAATGTATACAATCTA
TGCTTACTAGTATGTCAGGCCAACCTCTTCTTTTATTAAATGCCATTAAATTTTTTGTGT
CTTCCTCGTTCGGCGTCCGAAGATATTCAGGACCAAAGACACGAACAATCACTTTGGCAA
ACCTATGCACAGACTTAATTGTACTATCTTTCCCAATGCGAAGGTACTCATCGGTATATT
TAGCCGGAACGCCGTATGAAATTACCCGCATAGCTGCCGAGATTTTTTGATATGCACTAA
ATCCCTTCAAGCCCACGACAGTTCTTCTTTGAGTAAAATATCGACAATTGGCTTCACGAG
CTTGCACAATTTTTACAAAAAGGGATCTGCGCATACGGTACCTTCTCCGGAAGAGGTGCA
ACGGGTATGTTGGATTGGCGGCGAAGTAGTCTTGCATCAGCATCTCGTTCCCGAGATGGC
GATTTCGCGGAATGCAAAGACGTCCGACGCTCGATCCTCACAGCCTCTTC