Map Locations of contig_91883 (5932 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_91883

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_80644 1 793 bp None Available Available None
MLOC_80643 8 4085 bp AK248174.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_80644






CDS Structure of MLOC_80643






Contig Sequence (5932 bp)

>contig_91883 5932 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCTCAGCTCTTGTAGATACTGACTTGAAAATGATATAACTGCAGTTTGGAACCGGTGTT
GTTGTCCTCCGTCAACCATAGCCGAACTTCCTAGCTGAGACAGGCTTTTACTTGTTCCCC
GTCCATCTTTGATCCATGCTTTAGCTATTTAAAAGTAACGTTTTCCCCGAACTGAAAATT
TATAGAAAGGTCTCTTGCTCGTTGCAGGTTGTAGTTGATGACCTCGAGTCCAACCTGATG
ATGAATTTGTTTGCAGATCTTTGAAATCTACGAGTATTGTTTCAATTCATCACAAACTTA
TATAACCTACAAATTATCTTACTAGGCAATATTTATAATACAGATTCAAATGCAAAGGTG
CATGAATCGAAGGACAATCCGAAGCTTTCAACTAATGGCACATCCTACAACCGAAAGGCT
CTAGCCCTCCTATTTTTTCATTTCGTTTAGCTACTTGGCCATGTCTTTGATATAGGTTTT
TGCTCCTGCCCTTCTTGTGGTTGCAGATTATTCTTTAGCCGGTAATGACATGGAATCTGT
TAAATATTTTGGTTTGTGATCTTGCTCTCCATGATCCTACTAGTTATCCGTACTCTTGAT
CCCTGTGTTCTTTTGGTCTTCTGCAAGTGTGGGTTGCAGGATATAACAGTTAGGATTTTA
TGCCCAAACCTATGTACATAAATCAGGTCAGTGTCTCGTAGACGGTCTGTTTGTTTCATT
TGTTATCGCCGCCTCCGTGAGTTGGCTTGCAGGATGGATCTGGATCTGGTCTGGAAATGA
AGCTCAGTGTGGTGTATGAACAGTATGTTGAAGTGGACTTGAGGCAGGTCAGTTTACCAT
GTTTGGTCACATCGATCTTGGTGACGCCAGATTTGAGTGGATATACCTTAAGTTCTTTGA
TTTATTTTCGTCTGATGGCTCAACATGAGTACCATTATCCCTCGGTACAAGGTGCATTCT
CGTTGGTTCTTGTTGTTACAGCTGATCTCCGCTTGTGGGGTATGTGTTTGTTCTCCTTCA
GATGCCGGAGGGTGATGGTTGCTGAGTGATGAATCAGAGGGTGGAGGTTTGTTTTAATGT
TCATGGTTATTTGGATTGGTTATGGCTCAATGCCTTGCATGATATAAGATAGCATCTTGT
GTGCTGAAGTTTTTGTTTTGGATTGAAGTCGGATTGGATCATTAAACATGGAATGGAGAT
CAGAGAATTTGCGAACTGCGTTTGGATAATTGATCCTCAATTTAGTTTCTTTGTTTGCAC
AGTCGAATTTAGCTTACAGCATCTCTCATATGGAACTGTTGGTTCTCCAGCTATTGGACT
TATGGGGCTTTCTGGAAGGGCTTTGACTGTTGGATGGGGTTTCTTCTCTTGACTTCATCT
TTCCTGATTTGCTTTGAACATTGCACTTCCTAGACATTGTTTTCTATGGCCTTGGTAACT
ACATGTCCTTGCAGATATTTACATGGACGAGAGATAATATAGTTTGCTATCTGGAACTGG
TGTTTCCCTAACTGATATCTCCCAGCCAAGCAGGCTTATCCTATCCCCTCAATGTTTGAT
GCATCATTTAGCTGTTCATAGGCAGCTTCGTTTCCCCAAAGCAGAAGTTGAAACGAAGGT
TTCTTGGTCATTGCAGGTCCTAACTGACGATTTAGGTCCAACCTGATGATGAGTATGTTC
GAAGATATTCTAAACCCTGCACCTTTCCAATTCGTCGTAATTTTTTGAACATATAATTTA
TCTTATGGAGACAAAATTTAAACATTCAGATTGAATTGCTGGATGTAGAAGGTTTGAAGG
TTGCTACAGGGCATCAATCTAGACGGACCATCCTACAGCCGAAAAAACCCAGTGCTCTCT
ATTTGATCTCTTGAAGAAGCTTCTGTTGTCTTAGCTGCCTTGTGCTTGTAGCATTGATTG
TGTTTTTTTGCCTCCGCCTTCTTGTGGTTGCAGATTGTTTAGCCCAAGCTATGCTGGTAG
CCATCAAAATATGTCGCATTTTTGGTTTCTGATCCTCTCCTGACTTCTATAGTTGGGTAA
TGTTGATGGCTTGATACGCAGAAAGAGGTTAGGGATTATCGCTATATATACTAAAAACAA
TGGAGAGTTGAAGCTTCTCGACTCGAAGCTTGAACAAACAGTTTGGCATGGACACTACTA
CTCATCATGTCTTTGATTAGTGTCATTTCCACTGAATATGATTCCGATGATCCCGACTTA
TTGGTATGGAATTGATTTTCAGAAGTGATGTTCTTACCATTGGTGGTTCTCCAGTGGGAT
CTGGATTACGAATCTTCAATGCATCTTCTTGGTTTGCTGGGGAACTTCCTATTTTAATTT
GACAACTTTGTAAAATAGTTGGGCTAAGTTTGATGGTTTTACTGCTGATTGTATACTTTC
AACTCAAGTAGCTTGTACATATGTCAGTTTGTTTCGTTCTGCATTCGTCATGGATTTGAA
GATACAAAGCCTCCACACATCTTACGGTCCTCTAATGGTTAATTTGATCTGGATTATGGA
ATCTTCAATTACATATTCTCAAATCTTCAATTACATATTATTGGTTTTCCCGGAGCTTCC
TAGTTTTAATTTAGTTAACTAGCAAAAATACTAATTTGATGATTCCTGCCAATTGCACAC
TCTTAAATCAAGCTTATACATATACTGGATTTTTAAGACACACAAGTATCTGTTGACACA
TCTTATGGCCCAAGGACTCTATTATGGGCTAAAAGTGTGAAAGCTTTCTCTGTGCCTGCT
GATGAAGATATTCAAGATTGAAGATTTGAATCACCTTGCCCCATTAGAGAAATTAGTAGG
TTCTGGAATTTATAGCTTTCCTTGTTTGTGCCCCTATGTTTCTGTCTTATGATCTTGTGC
AAACGTTGTGTGAATATTTATTGCCTTTGGTCAATTCGTGTGTCGTGACAACGCTGCCTT
TGGTTGATGGTGTGGCTTGTATGCTTAGCTGAATAATTGGTTGTAGTGTTTGCTAGTTTA
TGTGCTTAGTAGTTTTGTAGTTTAACACTGCCTTTGCCGGTCCCAAGCCCGGATGAGAAA
ATGTGGAGGGAACTGCATCGTTTCCACTAGAACTTGCATGGTCTCTAAATATTTTAATTT
GAGTGGACAGGGAATGAAGTGTGTAGAAGTTACAGAGTTACTGTCCTTAATGTCCTATAA
TCAAACAGTGACTTGTAGCATACTCTGGTAAGCATATGATTCAATCTTTGAAATGCATCC
TTGCTATGACGAGTCCAATAAAAAATCTAGGCAACTTCAATTGTAGAATCCCAGAACTTA
CTTGATTGCTTACTGAAGTTGCACAAGATACTTGAATGTGAGGGAATGTCCTCGTGTAGT
GTTGTTGAACAATACATTCTCTAGAAAGAGCAATGATTGCGTTTCGGTTGGATGATGGGA
TAACTGCAGTGAGGGGATAGGCATGGACGTCAGGTAACGCATCTCCAAAGGCCTTATTGA
TGTGCTAACTTAAGTGAGGGGACAAACGCACAACAATGTGTCTGATGGAACTGAAGCTTC
AACCGAGGACTATAATACGGTCAGGTGAAAAACCCTCTAGACACAAGCTGTGTCCCTTCA
TCACCTCCTGTTCATTTTATTTAGGAACACAGACAGTCAGGCTTTGCGCACTAGATACTG
CATTTGTCTTGCTTCTAATTTTTTTTGAAGACTACTCAAGAACAGTACATACATACCGTC
CGCGTCACCCAGCAGGCAGCATGCGCGGGTGGAACCACATCGCCGCCTCCCGGCGCACTC
GTCGGAGAGAGGACAAGTCTGGGCGCAGGTTACCAAGGCCACGCCATTTCGATTTTTTTC
ACAGGTGAACAGGACAGGAGGGCGAGACGCGGTCCTCTGGTGGAGGGGATGTTAGCAAGG
AACTGGAGGAGCGGCAGCTCACGAACAGAGGCATCAGAGGGGCTCTACGGATCGAGTCCC
GGAACGACATCAGAGGGCCTCCACGGATCGAGTCCCGGAATGATCTCGCAAAGTGACAGG
AGAGCCGCAGGCGACTAGGGCCTCTTTGTTTGAAGACTAATTTTGCCAAGTCAAAATGTG
GCAAGCCATTAAAGTATGGCAAGCCACAAAGTGTAGCTGAAAAAACGAACGCCAAACTTT
AGCAAAAGTTGACAAAAAAATTGACTATGACAAATGAGCCATAGCAACAATAAAGTGTGG
CAAGCCAAAGTGTGACAAAAACCAAACATATGTCAACTAAACTGTGGCTGTCAAATTTTG
GTTTGGCAAAGTGTGGCTGAGGACCAAACATGCTCTCCAGCAGCCACACGATAGAGGGCA
CCCGTGTCCAGCACCCCCTCCTCACACCTGCACCTTGCGAGCTCCCAGGAGTCATGCCCC
TGACGCAGCTCCACACCCACCAGAGTACCAAGCGGCACCCGCAGGTCGCGCCCTCCAGCA
CGGATCAGACGTGGTACCAGCGCTGCCCTCTCCCCAGCCTCTAGGTGGTTTTTTCACACA
GACATGGGGGTCCAGCGCAGGGAGAACAGAGCGGGGAGATGTGCACTGATGATACCCCTG
CTGCAGGGGCCAGTCCAGAACGCCGTATGCTCGACGCCAAGGACGGCCACCCAGCAGAGA
CCGGTACAGAGGTACTCCGTCCGTAAAGAAATATGAGAGCGTTTAGATCACTAACACAGC
TAGTAATGTAATGTTGAATCATTGGCGAGTGAAACGTCCGAATTTGTCAATGTAGCGGGT
GCTGCTTGTCCATCCATTGATTCAAGTTGGCGCTGCTAGGCAAGCTGAGTAGCAGTGTCC
TGCAACTATGGGTTATTCAACAAACCTTTGGTGGATGCTGCTTGATTGCATAGTTTTCAG
TGCCTATCAACTCTGGATAATTAATGCCTATATATAGTTTTCAGGTTCTTAGCTTTCCGG
CTGAAAATTCAAGGCCTGCCATTTATTGATTGTGTTTTACAGTGTTCTTGCTGAAAGCAT
TGTTTTTGAGAGTATGGATCTTCTTCAGAGTGAAAACTTAAGATCTAGTATCGACGATGA
TGGTGCATGAAAACTTAAGATCTAGTATCGACGATGATGGTGCTTGTGCACTATTTTTTT
CTTGCATGCGTCGTTTTTGATGAATTTGGACTTTAAGTGTTGTCTAGATAGTGGTTCATG
CTGCGGCTACAAGGAATTGATCACTAGCGGGATCTTTTTTTTTTCATTGACTATTTTGAC
CATTCTCATTGTTGTATGGTTTCCGACGAGGCCACACGGGAAATACCCGCATGAACCACA
TTTCCTGTTCTATGTGGGTTGTGTATACACGTGTTTTACTCATTTCCCTCCTCTTATTTT
GGAACGTTAATCACTAAATAAATAAGCCATATTATGTGAGTTGTATTGGCTTTTATTTGA
ATTCCACACCGGATCAAAACCTTTTGATACTTGCTTAAACTATTCAAACCGTGTCATGAC
AGTGGATAATCAATTATCCGAGAAATATAAATCTTGCTTATGAAAGGTTCACTCAAACTC
AAAAGGATTTATTTCTTCCAGAACTCGTTTTGTAGTATTTGTGAAACCATTTCAACCATG
TTGAGTGAGAAAAAATTGATTTTTTTTCAAATATGGTGGATGAATATTGTATTTAGAGGT
TATTTTGAAATTTTACTACTAGAATCAGAGAATATGCTGTCAGTCAACTCTTTGCCGTGT
GCTTGCGTTGCCGTCCGCTTCCTCAAAACAGACGGCAAAGAAAGGACCAATGGCAAATAT
ACTCTTTGCCACGAGTCCTTTCTTTGCTGTCACCCAGCAGACGGCAAAGCCCATAATGGC
AGACGACAGAGTTGTGGCTTTTGCCGTCTGCCTTTAGGGGCTTTGCCATCCGCTGCCAGA
CGACACAACCCTTCCTATCTAACGGCCGTCAACCCCCACCCCGCCCCCTCTC