| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_91235
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_80545 |
1 |
2743 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_80545
Contig Sequence (6572 bp)
>contig_91235 6572 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATACAAAGCTCTAAACATGGCATCATGANAGAAAATGTCAGTTTTATGAAGTTTCTCTAA
AGTGAAATCTGATTCCACCAATGGATTCCTCGGATGATTCTACACCAAAAGCATATATAA
TACATGGGTTCTTGCACGATGGCGACTTCAATCCCAACACCACCTTCCCGCATGGCGCGC
CGCAACGTTCCTCCCCCGTCGGTTTTGGCCAAGACTAGCGTACTCCCTCGCCCGTGTTCA
ACGCCGGCCTCAACACACAGTACAACTACTTGCTGTCGACGTACTCGTCAGCAGTCTCAC
CTGCGTCGTTTCTGCGCCCTGGCGTCCTTCCGTTCGCACCCACTTCGTCGCTCTAGTTTA
ACTACGCCGACGCCGTCGACATGGACGAGATCATCACGAGCAGCTCCGTCGCCACAGCGT
CGCACCCAGAGTTCGGCACACAAGATGAAACAACGGACACAAACGACGACATCGATGACC
AGCTCGACAACGCCGAGGAGGGGGAAGGGGAGGACGAGGAAGTGGAGGTGGAACCGGAAC
CAGTGCCGTAGAAAAAGGGGGAAGAGAAAGCGGCCGGCGAATGCCAAGACGGACAAACTC
CGCGTCAAGTGGACATCCAAGGAAGATGAGTGCCTTGCCGAAGCATGAAAGACTGTTAGC
ATTGACCCGACCACTGGCACAAATCAGAACAATGACATGTACTGGGGGAGAATCAAAATG
GCGTTCGATGAACGCAAGCTGGTCGACCCCGACTTCGCCAACATCCACATGGACCGCGAC
GAGAAGGCGATGGTGAACCATTGGTCGACGATCCAGACAGCCTGCAACAAGTGGCATGAC
ATCATGGAGGAGGTCACAGCTTGCCCGGGAAGTGGCGCCAACGTCGAGGGTCAGGTATGC
CCACAATTCGCCGGCCCTAGTTCATCACGTCGCCGTGTGCTTTGCCGACATGTTTCGTCC
GCCGTCTTGTGCAGATGCTTCGGATGTTCGCCATGTACCGCGCCGACAACGAGGACAAAA
AGTTCATGTTCCTTCACGTGTTCTCCAGGATCGACCCGTGCGAGAAGTGGAGGGAGGTTC
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GGCGGCAGGAGAAATTCGACGCGCGGTGGTCGACATTGATGATCAAGACCGCTGCAAAGA
AGAGGAACACCGACCTGGAGTTCATGATGAGGACAGACACATCGACGATGGACGAGAAGG
TGAAGGCGTGGTACATAGTACATCGTGACCTCATCTTGAACTAGATGACATCGCCGACGG
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ACCATCCAGAGCAAAGTATAACCACAAAACCGCTAATAATTTTCGTCTCTGCCACTAATG
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CCAAATGGCTTTGTGAATCTTCTACAAGCCGTTTGAAAACCTCATGGCCAGTTCTAGGAA
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AAAAAAATCAATTTTCAAATATGCGTTTTCTTATTTTAAATACACATTGACCATTTTACG
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GTTCAATGTATATTTTTTTTTGATTTATCGCTGCACATTTCAAGTTTGTATGGAAAGAGT
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TCAGATTTGTTTCGAGTCCTAAGCAAAAGTTCTGACTCAATACGGAGCCCGTATTTTGTT
CACACCCTGAAAAAATGTCTTGCGGCCCATAGCAGCACACTGACCCATCACCGCCCTAGG
GCCCATTAGGGTTTTGCTGGCGAAGGCAGCGACGCGCGTTGGCTATAAATCGCAGTTGCC
TCTTCCCCCGTTTACACCATCACCGCCGCCTCCTTCTCCGCCCGTCTTCGGCAGCCGGCA
GATTTGCTTCTTCGCCCTCGTTGATTTGTGTCTCTCGTTTCGTTTTGCTGTTCTTTATCT
CGTCTCAAATTTGATTCTAGTGATTTGTTTGTGCTTCGTCATCTGGTCATTGGGATGATC
GGTCTCTCGAGTCTGATCGGTTCCCAATGGACTCGTTCCCTTGAAGCAACATCATCCCGT
TGTATCCCGAGTTCGCCCCTCTCGTGTGCCCTCCGAGTTTCTCTCGCAGGGCGCCGGTGG
CTCTTACATACATTTACATCACACACCAAAGCAAAAAATTTGTTATTTGATTTGCCTCTT
TCGAATCTTGATTTTGACAACCGTGATGAGCTAATTTTACAGTTACAGACCTGTAATGAC
TCCTGCGGAAATGATCGCATGGTCAAAGAACATCTAAGGGACTGAGTTGTCTTGAAAATC
ATGATTCCAATTTTGGATCTTGTATTTGACGTGTGTTTTTGTCTGCTGCTTCTCTTAACA
GTATTCGTGTCTGTGAATCAATTTGTATGGTTCCCGGGCAGTATGCAGACGGGAAGCAGA
AAGCAATTGTTCCTCTCGCTATCCACCGCGGAAGTTTTGTGATGTGATTGGACGTCGAGG
AACTACACTACATTACTTTCTGAATTCTGTTATGTTTTTAAAATTTGGAATCCTTTTTTA
GCACATGGTCTGATTGTCTGAAAACTGAAACGGGCAGATCAAATAAATGAACCTAATAAG
AAACTGTATCATGTGGACCAAGGATCTGCATATATGTCAACGAATGCTATGCGGCAGTCA
GTGTCACAGACCTTGTTGCTGGCGTTCAGCAAGCGCTGCATTGACTAGAAGGGCAACCAG
ACCTTGGAAATTCAATTCAGAAATTCAAGGAACCAGAATCAATTCAGGAAAACAGAAAAT
CTGACTTGGCTTCGGATTGCATTCCCTACTAAGGCCAACAACAAATATCAGAATGGACTG
TTGATACAAATCCACCACTTGATTAGAAGCCCTCGGTTGATCAACTATGTAGATAATCCT
CCTGGTTAAGTATTGCTCTGAAGTTCTCGGAATGTCAGTTGTTTTTTCAATGTTGCATTT
TGTTGGAAAACTATCTTGTTGTGAGACGGGGGGACATCCGAGTCCTTCTGCCTGTTTAGG
AGCAAACTATCTATGTTTGTATATTCCTTGGCGAACGTCACAAAACAAACCTTTGAACGT
GTAGATTCCTCTGGAATTTCTCCATTTGAAGGTGGTCTCATATTCCATTGCCCTTGATAG
CGGCGTTGCTGCAGTTAAACTTTGGGACATGCCATGAGATAATCATTTCTTCAATTACTA
CTATTCTGTTAATGTTTCTTTGTACTCTTTGTTTTATTGGACGACATCGAGTCATTTGGG
TGTGGTTTCCCTCCTTATTCCTCTGTTAGGACCCTCTCCAGTAGTGATCTCAAAAACCTC
ATCCTATATGTGCGTTTAGTGCCTCTCTCCCATATGTTTTTTGTTTCACTGGTGTGCTGC
TGTAGTAAGTCGGGCTGAGAATTTTGTTTTGGAAGAAGTGACCGGGACACCAATTTTTTC
TTGTGAACACGCAAAAGGCTTGCGAGTTGGTGTATTAAGATATCAATCTTAACTAAGCTG
AATGAGTAAATGAAGAAACTTACCGATTTAAACTCACTAGGATTTGTAAAATAGTATTAG
AATTGATCTTGAATCAAACAACAGGTTTGCAACTTAAACCATAGAACTTCGAATGATGTT
TGCTTGGTTTCATGAAGAGTCAAAGAGATTTGTTTTTAATCCATTGAAATGTTGCCATTT
TCTACCATTTTTTTGCTTCCTATATTCATCTGCGTGCCCTCTGGTTTTTGCATCAAACAT
GAAATGTTCCAAGTTTCTTTATTTTCTGTTGGTTTTAATTCAACCGCCCTACATGATGAA
TTTAATATATTAGCTATGGATGTATGTCCAGATGGGTCAATATAATTTGTCATAGTTACT
CTGATAGGGCATTTGCTGTTATTTCATCTCTTATATGTAGCATGTTGACCGGAAATATTC
TTCTGATATTTGCCATTGTTTAGTGAATAAAGAAATAATTTGACAATGATATCAAATTTA
AGGCCCGTTTCTTGAAACATTCACCCTTGTCTAAAGGGCTTTTGTTGCTAATTTGTTTCT
TGGATGTCTGAACCTTGTAATTTCCCCTATAATATCTTGTTCCCCTTGTAGGACCTTTTG
ATTCATAATAGTATGAAACATATAGAATTGTTTTAACCATAATCATAGCTTTCAGCTTAC
ATTTGCATATGTTTTAACCTAACTTTGATTATTCTATGTGAATTGAACACATTCACCATT
TGAAATCTTGGTATTCTATGTGTATCAAGGATCTGCACATATGTCGGTGAATGTTATGCG
GCAGTCAGTGTCACAGACCTTGCTGGCGTTCAGCAAGTGCTGCATTTACTAGAAGGGCAA
TCAATGCTTGGAAGTTCCATTCAGAAATTCAAGGAACCAGAATTAATTCAGGAACACAGA
AAATCTGACTTGGCTTCAGATTGCGTTCCCTACTAAGCCAACAACAAATATCAGAATGGA
CTGTTGATACAAATCCACCACTTGATTAGAAACCCTCAGTTGATCAACTGTGTAGATAAT
CCTCCTGGTTCAGTATTGCTCTGAAGTTCTTGGAACGTCAGTTGTTTTTTGAATGTTGCA
TTTTGTACTATCTATGTTTGAAGCATTTTGAATGTTCTATATGTATATATATATGTATGT
ATGTATATGCAAAAGTATGTATGTACGATTTATGCATATGTATGTATGTAGATGTAGATG
TATGTATATGCAAAAGTATGTATTTTGAGGAGCAAACTATCTATATAGGTATATATGTAT
GTAGATGTATGTATATGCAAAAGTATGTATGTACGATTTATGCATTTATGAATGTATCTA
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TGACATGCGGGGCCATGCCCCTAAAACTGAAAATGAAAATAAGTAAATAATAATAATAAT
AATATGATTTTATAAATATTTAATAATTAATTAATTAATTATATTAGTTATTTAGTTTAA
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TTAGTTATGTTTAAAGATTAGGTGAATTAATTAAATAAACTGTTACCTAAATTTGTTCAC
TAAGCTAAATAAAATACTTCAGTTGGGTCCCACCCCCATTAATTAACCTGATTAAAAATT
TATTAAACCGTAAAATAAATGTGCCTATGAAACATGGGACCCATTGGTCATATTTGACTA
GTCAAAAATACTCTTGACTGCTGATGTGTATGACATCATTGCCGATATCAGAATTGAAAT
ATATGAATTATTTAAATCTGTTTAATTTCTAATGTTGAATAAAACTTTAAAAATTAATAT
AAAATAAACCAAAGTGAGATGAAAATATTTTGAACATGAAAATTAATCTGCAAAACAGGA
CGAGCTCGGATACGCCGTCAATCTCTCCGGTCTTGTAGTTTGCAAAGGATCATAACACAA
GCGGGAATAGCCACAGTGATTGCAACAGAAAAGTAAATAAAAATGGTAAATGGTGAAGGT
GTAAACAAGGGTCAAAATATGGACCAGAGTCCCATGATGNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTC
CCAAAAGACGATAAACAATAATGCTAGGGTAAACAAATTACAGCTCGGCAANNNNNNNAA
TTATAAATGCACCGCAATGCTAACCATGCTAC
