Map Locations of contig_90524 (9645 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_90524

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_80438 1 1524 bp AK364730 Available Available None





CDS Structure of MLOC_80438






Contig Sequence (9645 bp)

>contig_90524 9645 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGGCCCGTTTTCTACTAGTGTCAGCGTCATCTTGTTCTACACCGAGTACCGGTGCCTTC
TTTCCCAAAGTCTCCTATTCCCTAATGCTTTTAATTTTGCACCCCCCTCTTCGCTACTAC
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TGTTTGTTTGTGTTGATTGCTTGTGTTGTGTGGTTAGAGAGGTGCAGGGTCAACTTTATA
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TCTATTTTCATTCCACCAGATAAGTAGAGCGCACCAGCCGGCAAGACTTGTTAGCTATCA
TAAAACCAAAAATGAATAACAGATAAGTAGAGCGCGGTTCCGATGACCTTTTTGATGCCA
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AGAGCTCTTGCAGATGCCATCTAGCTACTGAACACTGATGTACTGTAACACTCTTCTACT
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GGTCGACTTTATATATTGCTTCCGCTAGTTCAGGTATCAACACAAACTTGTTACACGTTC
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CAGATTTTCTTTTTGCACAGCCCTCCTTTCAACATATTTAGTCCTAAATATTTACACACA
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ATAGTATGCACCTATGTAAAATCTCATATATGTCACTTCACGTCATCACCTTTTTGGGGG
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ATTTGACGGTATACTTTAGTATGTTGCTTTATGCATAAAGTGGGATGAAAGCATGTTTTG
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AATCCTATCCATTTCAGAAAAGAAACAAAAAACTTTAGAATCCTGCATATCATACTACAC
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CGAGTTTGAAGTCCTCCAGCATCTTGTTAAAATCAAGGTATAACCAAGCATTTTCCACTG
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CTGCACAAATGTATAGAACATTTTTTACACCCGCAACCTCAATCTCCAAAAGAAACAAGG
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TGACACTAGTATCATATTCAGAAATTCCATAATGACATTATCATAGTACTATTTTACCTG
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AATCAACAGTTTACCTTGACCTCTCCCAACCATAAGTTCTTCAATTCTGGATCATTAAGG
ATAATAGAAACAACCAGCGCACCATGAACAGGTGGGTTGCTGTACATTGGTCTCGCAATC
TGTTGCAATTGGCTCTTAACAGCAACTGCTTGCATCTCATCCTCGCAGAGAATACTGCAA
TGGCAGCAAATCAAACGGTACCAACGATCATGATATGGCTACCATTTAAACAAAACATAA
CAGATTTTCTTTGAGAGTCATAGACTTTGCTACAGACAATACACAGGGAGCATTCCCTGA
AGTGAATCCTTTCATAGTCTTTTGTTTTATTTTAAAACGCGTCTTGAGGAATCTAACAAG
CTCCGACAAGCCATGCTTATTTACTTTTTACTGGAAAGCCACACTTAATTTTACAGGATC
ATGCGTGTAGTTGGTTGGAACATACACTATTGCTTCATGATAAATGTTTCAAGGACAACT
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GGGGTATTTCTCATGCAGGCCACAATGGTGTTTACTTAAGATCTTTCTTTCTTTTTTTCC
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CTTGGACCACGTTGGTGTAGGTATGTAGATCTGCGAATCCGGCAGGAAACGCTTCTGGAA
ATCAGCGAAGAGCCGGCATGCGCCAGTTCCTGAAAGTGCCTGCACCGCTGCAATTCTTTT
ATCTTTGATGAACTCGGAGTCCTCACCATACGCCAGCTTTAGCGACTCTTCAATCATGTG
GATACTCCCTCCCATGGGAAGGTACTCCCTGTTTTGCAAATTTAACCAAGATACGGATCA
TTAGTCTGGAAGCCAAAACTCATGGCAAACTGGCAGTCTCCACTCTCCAGCAGTCAAGTG
TTTAACACTGATATGGTCAAGTATCAAACAAAATATACAAAACTTGTCTAGGATGAATGA
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CCAGAACCGGTGTCCTGCTAATAAGCTGAGGATTCCAAATGTTATCATTCCAAAATCTCA
TTTCGCCCAACATCTAGCATGATACTTCTCGCACAAAAGTGAATAAGGGGGGTTCTTGCA
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GCTAGGCGGAAAAAACACTAGTAGCATCAACTCAAGCCCGCCGTCACCTGGCCGGTGGGG
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AAGAAAGAAAGAAGCAAGCGAAGGTGTAGGAGAGGAGGGGGGGCGGGAGAGGGAGCACGC
ACGACGCCGACGTTGACTTTGTCGGGGGAGGGGTCGGCGAGGAAGGCCTCGGTGACGCCG
AGGATGGGGTCCTTGGGCGCCGGCTCGACGTGGCCGAGGAGCGAC