Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_8750 (2156 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_8750

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_79902 2 1221 bp MLOC_79902.1 Available Available LOC_Os04g49990.2, FRAME:+2, EVALUE:2e-40, 13104.m05113 protein AT hook motif domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_79902






Contig Sequence (2156 bp)

>contig_8750 2156 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCGCGTTGGTTCACATCTGAATTCAGGATCGGTCTTCACTCAGCAGCAGCTACTGCTGAA
TAAAAGCATGTACTACTGTATGTCTTTCTATATATATGTTTATAAAGGGCATGCCACCAT
TAACTTTGTAAGGATTTCTCCACATTCTTCTAAAGGAATTAAATTAGGACGCAACACTGC
AGGCATTTAAATAATGTGGGAAGTACACCTCTGCTTTCTGTTAGTTATATATGCGCCGAG
CAGCGTATAATATAGAAGTGAGCTCAGGTCTTCTGAATATTAGAAAATTTACTGGTTGCC
TTATTTTCTTAGGAATATTCTTCTATGTGTTATTATTATTATTTTGCTCATTTTCCTATC
ATGTCTCAAACTGTACTTACTTTTTAGTTTTGCAAGATAAAAAGGGTGGTAAATATTCCA
GCAATTCAATTAATTAAAAATTTCCTTCCAGGCAACATATTATCTTAATCGCGGTTTATA
ACGTTTGATTATAATTCGGTGGCCTTCTTTCAACATTTTTTTGTGCTGACTATGATATTT
CGTTTACTGAACTGTAGGTTCAGCTGGGACATCATTTACTCCTCACATAATAACTGTGAA
GCCTAATGAGGTATACTTGAAAAATGTTCCCTCCTCTCTGGTGTTTATTTGCGTGGTCTG
GTTGTTCCTAAGTTGCTTTTGGGCATTTTGTGTGGTCAGGATCCAGTAGATTGCCCTGCT
GGCTACCACTCTTGGTTGAGAACAGAACCTGTCAGCTTGATATTATTCATGAGCATACTG
CTTTACGTTGAAATTAATCACTTCTCATGGAAGAGCTAAGAACAGAGTGTATATTATGTG
GCTCCTAGTATGTAGTCATAAATATGCAGTAAAGCATAGCACTGCGTGTACCCTTGAGCA
TCTTTTGAATATTTTATCCTCTTGACTTCTGTTTTCTTGCTGCAACTGTTTTCGGTCTTC
CCATGGATTCCATGCCATTACTGCATATTTATGACTACATACTAGCCGTATCCAACTTGA
ACTTGCTGCTTATCCACAGGATGCATGGCACAATTCTTAAAGGATGGCATTACAAAACTA
GGAGAGTATGAGTAATAAATAACTGTCGGTTCTATTTAGGCTGTTTGCTTCCATTCTCCT
GGAATTACTTGATACCTGTCATTATTCTTCAGTACCAATCTACATCCTCCCTTAATAGAT
ATTTGTTGAACCTATTCCTTGCTTGTCCCTGGAGTTCAGACTATCTACCTCACCGTGGGT
GTTTATGCTTTAAATCATCTTGTTTGTAGGATGTTGCCTCGAAAATAATGTCTTTTTCAC
AACAAGGCCCACGTACTACATGTATAATCTCAGCAAACGGTGCGCTGTGCACAGCAACAC
TCCGTCAACCAGCAACCTCTGGTGGCATAGTGACATATGAGGTACGTCAAGGCCCAACTT
GCTAAGATCTCAGAGGCATTGTTTGATTTTCGCTTCTTGTTATTTTTGTGAATTGGTAAT
GATCAGGTTTTCAAAGACCTACATAGCATCACAGCTATCAACGGACCTATGATTTGGTCG
TGTTCTAGCATATAATCCTGTAGCCTGCACTCTGCTGGCCTATGGTTGACTGAATGTTTG
CTTATTATTTAGGAGTAACAAATTGGGCCTATGTGGTCGATTTACTTAATGTTCATATTT
CTTCTACATTCTGTTTCCGTTACTTCCTTAGTATTGCTTCCTTGTTTTGCTAGTACTGTC
TGCTAACAGTCTCTGTGAGCCAAATATGGAGTTTGTTTATCTTCTTGTCTGTTCTTGTGA
ACGTAGTCTCTGATGATAGAACTGAAATGTCTAATATGCAGTTTAAGTTTACATCTCAGC
TTGTCAAGTTACATGAAAACATGTCGGAAAATTTAATCTGTTCACTAACTAGCACTAACT
ATTCATGTTAAAGGCACCAGGTTTTTCTAGCCTGTGATAGTTTATTGGTTCCTTCATTGT
CACACCACATTACCAGGTTTTCTAGTACAGAGTCACACCACGTTACTTAATATTGTTGTA
ATGCAATGACAGTTTTGTATCATGCAAAGTCATCAGGATGTAAAAATAAACTGAATACCT
ATACTGTTATGTGTCACAGGGCCACTTTGATATTCTCTCTCTGTCGGGCTCCTTTC