Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_87358 (5111 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_87358

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_79875 1 1497 bp AK248520.1 Not available Available None
MLOC_79874 1 1447 bp MLOC_79874.1 Available Available LOC_Os01g51130.1, FRAME:+3, EVALUE:1e-77, 13101.m05327 protein transposon protein, putative, unclassified
MLOC_79873 1 1176 bp MLOC_79873.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_79875






CDS Structure of MLOC_79874






CDS Structure of MLOC_79873






Contig Sequence (5111 bp)

>contig_87358 5111 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGTTGGTTGATGATGTGGATACTTATACCAACGATTGAACATACGGACTGTTGGAGATGC
TCTAAGACACTTATTTTGGGACGGAGGGAGTATGTAGTATCATGCATGTCAACTAGCCAA
TTTCGATGATGTGGCATAAAATTAAATGAAGAAAGAGAGGATTAAGTGTCATGTCATGAT
ACCGTATCATATTAAATGTTGTGGTACTATGTGTCTTGCATGACAATAAATAAACCACTC
TATGATACTAACATATGATAAATACTATGCATTACGGTTATGGTATCATACACTAGTATC
ATATGCATGATAGTAGTATATGATATTACCCATTACACCAGCCTTATATAAAACCAAAAA
ACTAAAATTTCGAGATAAACTTTATAAACAAAAAGGGCGATTATTAGAGGATTGCTAATC
TAGTGCCATAGTTGGTGACACAAGAAAGATCGATGTGCTTATTTATTCCATCCGCATATG
ATCTGAAGTGAACGACATGCATGCATGCATACGGGGGCCGGCCAAGAGGACCAGCCATTG
GCGATGCATGCACCACCAATGCACTCGCTATACGCATTCATACCTATACCTAATTAAGAC
AGGCGGTGTCGGTGAGTCAGTGAGCGTGCATGTGCTCGCGCACGTACACCACCGTATGTA
CGTACCTGGAGCAGTCGCTTGGCGAGGTCGATGGCGATGATGCCGGCGCTGCACCCCATG
CCGCTGAGGTTGTGCGTCACCACGTCGTCGCGGAACCTGTAGCGGTTGACGATGAGCGAC
GTGAAGGACGGCGTCGGGCTGAGCAGGCTGGAGTTGAAGATGAGCACCCCCACGTCGCCG
GCCGCCACGCCGGACTTGCGGAGGACCTCGTCGACGACCCCGAAGATGACGGCGTGGGAC
TCCTCCATGGCCGTCCGGTCGCACATGTCCACGGGCAGCCGGATGAGCGACATGGGGAAG
TGCGTGGCCTCGCCGAGGCCGGACCGCTCCAGCATCCGCTTCTGGAACGCCATGCTCTGC
TCGCTGAACCGCCCGCACCGCTGGAAGTGGACGATGGTCTTGGCGCGCGACGCCTCCAGC
TCCGCCGGCGGCTTGTACCCGGCCAGGTCCACCAGGTAGACCGGCTGCGGCCGCGACGAC
GCGTACGTGTACGCCGCCAGCGCCGCCGCCCAGCACGCCATGGCCAGCGCCGGCGCGTTC
ACGGTGGCCCACAGCCACAGGGCGCGCGCCTTGTCCGGCGTGAGCGTCGACAGCTGCGGC
GCCACCACGGCGAGCAGCGTGACCGCGAGGAGGTGCGGGATGTGGCCCACGAGACGGTGG
TACATGAGGCCGGCGTGGTCCATCGTCGCCTGCTTCACCGTCCTCAGCAGCTGCCGATCC
ATGGTAGTGATGGCGCGCGGCCTCTATCTCTAGCTCTCTCCCCACTCACTCTTGTTGACC
TTGGAGAACCGTGAATGGAGTGCGAGCAGTAGGCGTGGATTTATAGGGTTGGGGGAGGCC
TTAATTAATGGAGAGCAATGGCAGGTGGCTGATGAGGAGGCCAGCTACACATGCATCAAG
TAATAAGTGATTCTTTCTCCGTTTTCCCACGGTTTCTTTCAAGTGTGTTCTTCTCCGCTA
GTACTAGTATGTTTATCTCAGCAGCACTGCCCACTGTATTGTATGTGCAGGCAGCACATG
GACTTGATCTTTGTAGTATCACGGAGCAGTGAGCAGTGGTCAAAAGTAAGCTGCCGTAGG
ATTAAATTCTGCAACGTGCTTGCCTGAACCTCAATAGAGTATTTAAGATTGGCACGGAGG
CTGTTCCCTTGCAGAAACACGGAGGAGGTCCTACTCAGTGAAGCACTTGTGTAGACTAGA
GCAATTTCATTGTATGTGGCGGACAATTTTTTGGTTTTGATCTAAAAACCTAACAAAATC
CAGATCTGACCTAAGTTTAAAAAATAAAATCCAATCTAACTTGTTTAGGTGACGCCAACA
TCCCTGACGTCTGGGTTGCACGGGAGACATCAGGGACAATGACGTTTGGCTCGGGCCCGC
TCGATCCTCCCTCCCTCCGTTGGCCGGTTGACGTGCCAAAGGACCAGACGCCAGAGAGAC
CCTGGCGCCTGATCACCAGACCCAGACGCCGCACACCCTGGCGTATGGCTCGGGTAACTT
CCGCAGCGCTCGGGCCCGCCCCACCCGACCATATTCTCCCTCCTTCTCCACCAGAACTCA
TCTCTCCCCCCCCCCCCTCTTCCCCTCACCCCTCCCCCCTGATCTACTCCCTCCTCCACC
AAAATTCATATATCCGATCTCCCAAGCTTTCTTGAGGTAATCTCCCCCAATCCTTTCAAA
AAAATTAACATCTTATTTTGAGAGTATTTTGAATATTAGGTTATGTTAGATTAGATGATT
TTGTCTTAGTATTAGGGTTTGTTTTGTAGTTGTTAGATGATATAGTTGTGTAGTTGATAG
ATGATAAAAAAATTTTTGTGGTTCAATATGTTAGGCAGATTTTATTTTGGCCTTTNNNTC
ATTTTATTTTTTGTGTAGTTCAATATTTTAGATGATATGGTTGTGTAGTTGTTAGATGAT
AGTTTTTCGTGTAGTTCAGTATTTTAGGCAGATTTTATTTTGGCCTTTGAGTCATTTTAT
TTTTTGTGTAGTTCGATATGTTAGATGATATAGTTGTGTAATTGTAGATTTTGACAGATA
TAGATAGACATATTGTTGGATTTTTTTTAATATGTTGGATGATGATATAGATGGACGTAT
TGTTGACATTTTTTTAATATGTTGGATGATGATATAGATGAACATATTGTTGGCATTTTA
TTTTTTTGCAAAAGAGATGATGAAATTTGATGTATNNNNNNTTTTGGTAGGATGGTGGAT
GATGATAGCCCTTGGTATGACGGGTTAATCAAGAGTTCGATAGAGAGCACCGTGCTCGTG
TCATTGAGAATCGTAAGATAAGAAGACTTAATCAAAGACTTTCAATTATTCGTGTTTTGT
GTGTTTCTCGTACTGATATGAAGCTCACATTCTTTGCAGCATGTAGTAGCTATGCGCANN
AGGGGTCATGGTGCGAATGACTTTCCGTACGACGTGCGATACGAGCCGTACATTGCAAGA
TTGGGTCTTCTCCCCTTTGTATTGCAATTCAGGCGAGCCCCACCACCGATGAACCATGCA
GCGCTCACCGCACTTACGGATCGTTGGAGGCCCGAGACACACTCTTTCCACCTTGCTTGT
GGGGAGATGACGATGACCCTAGAGGACATGGCCATGATAAGCGACCTTCCTATCAACGGC
TTAGCTGTTACGGGTCATGTTAGTGCCGTTAACTGTCGAGCTCGGTTTGGTGATTTAATT
GGTGTTCAGCCCCCTCTTCCTTTGTCAGGCAAGGCTGGTAGCTCTAAAGTGAAGCATTCC
CGGCTAAAAGAAGTCACATGAGCAAACAACCTGTGCCCTGCGGATGCCGATGAGATGGTT
GTGCAGCAGTATGCTCGGGTCTATCTTTGGTACGTACTAACCAAAGTGCTCTTCACAGAC
GCAACTGGGAACTCATCCCTCTGGATGTATTTGGAGCTACTCACGGAGTGGATACTCAGT
ATAGCTGGGGTTCAGCAGCACTAGCATACTTGTATCGTCAGGTAAGAACTATTTCGAGAC
ATTTATCTTTCATTTGCCATGCTTCACATATTGCTAACATGTATGTTTAATTGCAGTTGG
ATCGGGCGTCAACGAGGACAGAAGACACATCTTCATTGTGCAGGTTTGTGTGAAGCCTCT
CTGTATGGATGTCGGAGCGGTTGTCGGTTGGACGGCCCGTGATAAAAAAAACGATAATCC
AAACCCCCAAACCTCATGAAGGGCTTCATGATCAAGATCCATATCGCCGCCCCACAATTG
TCTATTGTTGGGATCAGGTGTCTATTTACACCGGAAGCTCTCATGTGCGATACAAGNNNN
NTGTGAACGAGCTGGACACCTTAACTACTGAGGAGGTACAAACATTTCAACTCCTCCTAT
TGTAGGTTTTCTGGCGGCCTTATGAGAATGTGTACCTAATATCTCAGCTCACCCTAGTGT
AGGTTTTTTGATGGCCTTATGAGAATGATTATGATTTCAACCTCAACGAGATGTGCACGC
GTGATAATCTTCTTTGGCGGGCGAGGTGTCCAATGATATTCTTTTACACTGTCGAGTGGC
ACTTTGTAGACCGTGTTGCGAGGCAATTTGGAAAACTACAAGGTATTCCAATTGAGGAGA
GCAAGGAGACAATCACAAAGCTACATAGGTGAGCAAAAATGCCTATGAGNNTTGTACTCT
AGCATTGTGAAAGTCTACGTTTGCTAATACTTTAAAACGTCGAACGTTTGTAGGTTCAGT
CGAAGGAACAATTAGGATATATCGGATTGGGCGAACAAACACAATCAATAGATAGCAATG
TGGAATCAGGGAGAGACGTTAGTGGAGTTAGAGAATAGACCCCGCAATGACTCAACATAC
CAAAAATAGCTTGTGTGGTATGGGCACCGTTACCGGTTGAAGCTTAAGCCCGGTTGGACT
CAAGTGGAGTGGTCCGAGTTGGTGTCGGAAGACCCATCAGCTGCAGAAGGTTATCATTCC
TTCAACATGGATGTGCGAGAGACCGTAGGGAGTCAAGTTGACTACGCACCCATGCATGAC
GAATTGGTAATTGAATTAACCTGAACTAACTTGCATTACCTTGTCTTTTTAAAATATTAA
TGTTTGTTGTGTAAATGAATTGCACGAGAGAGAGTTCCTTTTGTGTGTGAACAATGTCAA
TGTAGCACTAAGTCATCCCCAGGAGGTGCATTATCTAAGAGAGCTCTCCGGACCACGGTG
GAGATATAACCATGTTTACAAATGCTTGTCTTAATGGATTAGTTATTTGCGTCTAACACA
GTGTGTTGTGTTGTCGCAAAAGTTTAATACAAGGTTCCACAAGTGTGCAGCTATGCTTTC
TTGCCACGGTGCTCAGTCCGTGGACGTGTTTACATCTCATACTAGTCGCTCCTCCAGAGC
TAGTGTGACAGCCCGAGACCGACGTTTCACAAGATTCCCCTTTATTTTCGTTTCCGTCGT
GTGATTATTTT