| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
| No map location | No map location |  |
Predicted Genes from contig_87097
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_79820 |
11 |
3111 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_79820
Contig Sequence (6253 bp)
>contig_87097 6253 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGGAAAATGAATTTTTCATACAAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNCCTTGTGCATAATATTAGATCATTAATGAAACTATGCCATGAATGTG
GCCATAAGATTGATAATTTGCTTTGAAATACATGAATCTTCACACATGATAGCTCATTTA
TAAGAACACTTTTTTAAAATAATTACCGTNNNACAAGTTTATTATTTTTCCTCGTAACCT
GGTCACATATAATGACACAACGCGAAGGTTTTGCACATTTTTTATTTTTTTTAATTTGTT
ATGCCCGTTTCAAAATGCGGTCGAAACGTCGGGCATGACCGTTCATAGCTAGGGGTTGAA
TCTTGCCAAATTTTTATTGAATCTCTGATTAAATAGATACTTCTTTCCCTAAAAATGATT
TTTAGAAAAAATCATGAGAAAACTATGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGACCCGCTTCCT
ACTAAATCGGCGACAATTTGTCTTTTTCATGAGAGGTGGATAAGATCTTTTGACACACAA
ACATTTGATCAATTGTGCATTAAAAATGTCCTAGTATTTTTGAGAAATGATTTGGTTCAA
TTTTGTAACAAATATATGGTAGGCCCTTCACAAAAAGAACTCATTTTGGGCACTCGAAAA
ATGAAAAATGATTTTTCCATCCAAAGAAAATGAAAACTTCCTTCTGCAACATTGTTTGAC
ATTCTAAGATGCACCCTTGTGCATAATATTATATCATTTTAACAAACTATGCCATGCATG
TGGCCATAAGATTGATCATTTGGCTCGAAAGCCATGAATCTTCACACATGATAGTTCACT
TTTGAGAACATTTTTTTAAATGTAGTATTACAAGTTTATTATTTTTCCCGGTAACTTGGT
CACATTTAATGACATAATGTCAAGGTTTATCAATTTTTTGATTTTTTTTTTGAAATTTTC
ATGATCATATCGAAATGCGGTCAAAACGACGAGCATGCCCGTTTTTAGCTAGTTGTTGGG
TCTTGGAAATTTTTTGGTGTTTCTATGATTAAATAGATACTTTTATACCTAGAAAGGATT
TTTGTTAAAAATAGAAAGCAATCTATGAGGTAGGTGCAGTTCAAATTTGACCCGGTTCCT
ACTGAATCGGGGGAAATTTGTCTTTTCCGCGAGAGGTGTCTCACAACTATTTACACCCAA
CCATTTAGTCGATTGTACATTAAATATGACCTAATATTTTAGAAAAATGATTCGGTCCAA
TTTTGAAACAAATATATTGTAGGTCCTCCACAAAACAACTCGTTTTAGGCACTCGAAAAA
TGGAAAATGAATTTTCCGTTCAAAGAATATGAAAAATTCCTTAGGCAACATTGTTTGACA
TACCAAGATGCACCCTTGTGCGTAATATGAGGTCATCTGAACAAACTAAGCCATCAATGT
GGCCATAAAATTGATAATTTGGTTGAAAGCCATGAATCTTCTCACTTATGAAAACACTTT
TTTTAAACTAATTGTCGTATTACAAGTTTATTATTTTCCTGATAACTTGGTCACATATAA
TGACAAAATGCGGAGGTTTTCTAATTTTTTGAATTATTTTTAAATTTTTCACCCATTTCA
AAATGCGGAAGAGAGGGCATGGCTGTTCCTAGCTAGTGGTTGAATCTTGGAAAACTTTTT
ATGTTTCTCTGATTAAATAGGTACTTATGTACATAGAAATGACTTCTAGAAAAAATAAAG
AGCAATCTATAAGGCATCCACGGTTGAAATTTGACCCGCTTCCAAGTGAATCAGCGAAAA
ATTGTCTTTTTCACTAGAGGTGGATCAAAAACTTTTGACACCCAACCATTTGATCACGGT
GAATGGAGCTTCGCTGGGCGTCGTGGTGCTCCGTTGGAGCTCTTGGCGTGCCGTCGAGAG
CTGCAACGGAGGTTCATGGGGATGTCATCGGTGTTGCGTTGAAGCTTTTTCATGCTCAGT
GCCGTCGTGACATTTTCGCAGATCGGGTGGCTACTAGGTGGATGATTTCTAGACAAAATC
ATCTTGCTGACTAGTAGCACGTATTTTTAATCGATTACGACCAATTTAGATGGTCATAAC
ATCATCATAGCCTCTACTTCGTTCTGATTGCTCTACGGGCATGTCACGCGGATCAAGCAT
CAGAGACCGTCGGATACTTCCAGATCCAACGGCCCACACCCCCTCACCCTCTCCCCCACC
CACCGTGAGCTCCTCTCTATCCCCCGCGCATCAAACCCTAGCCCATCTCTGCCCCACACA
CGCCTCCTCCTCCCTTCCAGATCGCAACCGCCACCTCCTCCCTTCCAGATCGTCACCGCC
ACCTCCCTCTAGCGGAGCTCCCCGCCATACATGGTCTGTCGGCCTCATGCGTCGCCAGTC
CCCAGTTCCCCACCACGACACCCAGCCTACCCTATTCCTACGTGCGCTCGCGTCTCCCCT
CGTGTCCTCCTCCCCACCCCTCCCCTCCACCGCCCGCGACGGGAACTCCTCGGCGAGTCG
GGCCAGATCCACTGGAGCAGCAGGCTCGCGTCCGTCACCCGCATCGCCCCCCATATCGCA
TCGGGCTACCCGCCGCCGGATGGAGAGAGGCAGGGCGTGAGATCAACCGATCGGCGCCCT
CGACCGGAGCGGACCCCGTCGAGGAGCCGCGAGCAAGTGAGCGAGCTCGATCCGACCGCG
GGAGCGCCGCGCCCACCAGATCGGGGATGGGATCCGGGCCAAGGGAGGAGGCCGGTGGTG
ATTGTTCGGATTCCATTTCTTCTTCCCGCGCGCGTGCGGATCCTCGATGGAATCGGCGCG
GGCCGATTCGGAGAGGGCCGGTGAGTGCTCCGCCTTCGCTGGAATTGTTGTTCTCGTATC
CTGTGCTCCATGTCCAGTGTGATTTGGGTTGGATCCTCCAGTTCAAGGCTCGACCCGCTG
ATCTAGGCTGCTGCGGCGTCGTTGCAGGCGCCGGTGGTTGCTGCGGCTGCTTGGTTTAGG
ATGGTTATCATTAAACCTCTGGGATCGAAGTGTGGATGGAGTGGTTACTGATGGAAGCTC
CTGTTCTATTGGTGTGTCTTGTGTTTCTGGCATGCAGGACAATTTTTTGGCACTATGCTA
TTCAATTCTGAACTTCCTAGGTATATGATACTTCATCTTGAATTTTTTACGGTATCAACA
TGCATACAGATTGGTATATATAATGTTAAATAACCTACCTTAGATATTTTGGGAATTAGA
ATGGCCATTGCAAAAATTGGTTCCCTGTTTACTGAATTTTAAAATTCAGATAACTTGATT
ATGCTTTGCCTGATGGGTTGGGTAATACAACACGCAGCTATGTGTAGTGTCTACAAGTGC
ATGCATCTGTGAGACCACACGCCCAGTGTTGTGATTAGGTTCACCCCTGCCAGTATAAAA
ACTAGTCGCTGCATCTGTGAGCAGCAACGTGAGTTACTGGCAAACGCCCCCGCATGGTGA
GGCTGGCTCACTCACCATTTTTTGAATTTCGTTTTACTAGTTTTGACGATGGGTAATGTG
TGCTTTGATGAAGTTTCATGCCTTTTTAGTTCTTAATCCGTGTGTGGGGTCTCCTAATCA
CAAAACTGTGATGCATCTGTGCTACTCTGTATTTGCCCCACTGATAATCAGAGTGGCGAG
GTGGTTGCTGTTGGAGAGGGAAGAACCATTGGGGATAGCAAAGTACAAGTTGGCATTAAG
GTATGGCCTGTGCAGTCACTTTGTTCCAGTCTTATGAGTAGAATTTTTGTTATAACGAAT
GCAGTCTGAAGCATGCTAAAATGCTGATATGATGAAGCTTGCAATGTGCTTGTCTTACCT
GTTTGGATTCTAGGATTTTACGCATGTTGTGCCAGTTTTGTTGTATCTGGTTCGGTCCTT
TTATATATTTTGCCGTGATAATTAGTTTTCAGTAACTCAATATGCTCAAATATTATGAGT
AGGGTTTTAGTTATAACAAATCCAGTCAGAAGCATGCTAAAGTGCTCGTGGATCCGGTTT
AGTATGTGCCATGAACTGCTAGATGCGTACGCGTTGATGGGTCTGTACGCGATTTGCTCT
GGGTTCTCTAGCTCTTACACCTTTTTTTGAATTGTTCACAAATATATGATCTTGCTAGAG
GCCGGACTTGCTATCTCTTGACAGTCGGTCGCTTGTTTGCTGCACGGCAGCAGCAACATG
CAGCACAAGCCAGTATATAGCATGTTGACGATGTATCTAGCACTCAGTATCATTCTTAAG
CAAAGCTACAGTTTTTTGCTTTACTTTCAGTGTTTCTTTGACCTATGTACAGTGTCAACA
AAGATCTGAATTACAGTGCGGTGTCCTTAAAATTCCAGTCCAAATTGTAGTGTAATTTCC
ATTTTGTAATATATCATATGTAAATTACAGTGTAATGTGAGTGTACTTGCAGTTCTTTTT
ACAATGTATGTACACTGTAAACTCACTCCAATTGCAGTACATTTGGTCTCTGTAGATTGG
ACATGGAAGGGGTTTTTTTAACTGAAATATCACTCTAGTGTATTTTGAAAATTCCAATCA
AACTTTTAGTGTATTTTTCATTCTGGAATTTATTCCATGTAAGTTTCACTGCCATTGTAC
TTACACTGTAACTCACACTAATTGCCCTATTTTACAGTGCAATTTTAAGTGGTTTTCACT
GGAACTTATTGTTTGTTTTACTATCAACATAATTACGGTAAATCTTCTGGTAATCCTCTT
CATTGTAAATCTATTGCTAATGAATTGTAAATCTACTGCAAAATCACTGTAAATCTGTTT
TACAGTGTAATTTTAAGTGGGTTTCACTGAAATTTATTGTTTATTTTACTGTGAACATAA
TTACTGTAAACCTTATAATAATTCACTGTAAATCTACTGCAAAATCACTGTAAATCTACT
GCAAATCTGTTTTACAGTGTAATTTTAAGTGGTTTCCATTGGAATTTATAGTTTGTTTTA
CTATATGAACATAATTACTGTAAATCTTCTACTAATTCACTGTAAATCTATTGCTAATGA
ATTGTAAATCTACTGGAAAATCAAGTCTGTTCATCCAACGACCCCATGCTCCTTTCTTAT
TCTGGTTTCTTATTGTTCTTGCAAAGGGGGGAGGGCTAGTGAAAGGGATGCATAAGTTTT
CTTGCCCTGCAAGTCCAACTCTCCTTGGTATACTATTTCTGGAGATTGTTGTGAAATTGT
TGTTATATTGTTTAGCCCTGCCCCCATCCTCCAAGATCTAATATGCATGTTTCCATGCTG
TATATTTTCTTTGCTAAACTGTTTGTTGTGGTTAATAGTGAGGCCGTGATATTTGGTATT
CTGAACATTCGTTTGATATGTATGCCGCACTTTTCAACTCATGTCATGTTTAATTATTGA
TGATATATATTTGCAGATATTTTGCCTAACTTCAAGATGAGTGTTCTCCCTTTTATACAA
GTGAAGTCAGGCTGAAGATATTCAAAGAAGGGATAACATATTTTTGTATAAAAAGTTATG
TATTGATAGTTGGGTTATGTGCATGATGTAAACTCTCGAATTTCATATATCTTCTCTCTG
TTTCTAAATGAAATATTTTCTAAATGAAATATTGTATATTTCTGAATTACAATTGTTCCG
TTTTGTTTATAATAGTGATTATGTATGTGATTTGAAAATAAAATAGGCTGGAATTGTTTG
ACAAAATACAAAATTTATGGTGTGGATTCGAATTTTGAGGTCAGAATGACATGTGGGACC
AATCTGACTAGTGGGACCAGTACAAAAATAAAATGGCCAAAAAACAAAATCAATAGAAAG
TAAAAGGCCACAACCCAATATAAAAAAGGCTAAAATGTTAGGAATTATTGAGCCAGGCCC
ATGCAGCTAAGCAAAATAAAGAGAAAAAACATCAAATGAGTTGGATTAATGGGCTCGGCC
TATTTAAAACGCCGAATTGGACCGGGCTGATTCTATGCCACGTCAGCTTGCCATGTCAGA
TCCGACGCGGCGTGGGATTATTGCTAGTGACCAAAATAATTTCAATGCTTTCGTTTGGTC
GTAAAATCCTACGACCAATCCAGTAAAAAGGTCGGTATAGTTCATTAGAGACCCTCAACT
TTTGACCGTTTGTTTTTGGTCGTAAAAAGGTCGCAAATAAAAATCATTGACCATTCGGTG
ACCAATATTGAANNNNNNNNNNTGACATATTTCTTGTAGTGATCTTTCAGATGAGATAGT
AATGGTTCTCCAA
