Map Locations of contig_84439 (8323 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_84439

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_79317 1 642 bp MLOC_79317.1 Available Available LOC_Os06g46030.1, FRAME:+2, EVALUE:2e-48, 13106.m04861 protein DUF640 domain containing protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_79317






Contig Sequence (8323 bp)

>contig_84439 8323 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCATTGGGAGCAAAGTTATTTCTTGTGNNNNNNNGTCCACGTCTTCTGCTAGCACCAGA
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CATAAATCGCATGCAGAAATACAAACACGGGCGGCCTGGTTGGTGCGTACGTACAGTACG
TAGATGCATCAGCAACACTGTTGCACCTGCCGAGGGCTTAAATGATTGGGGTCACTCACC
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AAAGTTTGCTAGCTCCGCTCCCCCAGCTCAATTCCGTCCCCTCACCCACACAGCAGCTTT
CCCACGGCCCCCCTCCCCTCTCCGCCCGTGCCGCGGCTATCTGCCCGCCTATATACACAC
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ACCCACGCACCCGCTGCTCGCTCCCTCGGCTCGGCATCGATCTCTCTCTCCCTCCACGGC
AGGCCGGCGTCGTCGATCGCGTGCTTGCCAGGTAAGATTTGTGGTCGATCTTCGTCCTAC
TGTAGCTCCGGGCGGGCCCTCCGGCGGCCAGCGGCTAACTGCTGGTTGTGCGGCTGAGAT
GACCGCGGGCCAGCGCGTGCGCGCGCGCGTGTGTGTCAGTTTCTTGGCTGATGCTGCTCT
GCCGCAGCGGCCGAGGTGAGATTCAGGCCGACTTGGATGCCACGCTCTGGTCCGGGCCTG
CACCGTACTTCAAGATAGCTCAGGACCAGCTTCTGCTGATCCTTCGATTCTCCCTTTAGG
AAACCCTAGAGTCAAAATTTCTTGTGCCCTCGAGAAGGATATCGTGTACACCTACAGACT
CTCGCCGGTGCTTAGCTTGATTTTTTAGTTGCCCGTGAGCTGAGCTGAAGAACCATGCCG
CGAGCTGATGAGCAGCTAGCTCACTGGCTGGCTGCAGTGTGAAAATCCAGATTCTTTTGG
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GCAGGAGGACAGGACGGACATGCAGGGAGCGCTGGTGGACAGCCCGGGGGCGGCTGAGGC
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