| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
No map location | No map location |
Predicted Genes from contig_82614
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_78942 |
1 |
673 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_78942
Contig Sequence (5025 bp)
>contig_82614 5025 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTATAGATACATTGGAGACTTATCACACCCCCCTGGGCGCGCCCTGTTGACTTTGTCGGT
CCCCTCGCCTTCTCCTGAAGCTTTCAGATCTTCTTTTGGTACAGAAAAATTATCAAGAAG
TTTTGTGGTATTTGGAATTCATTTGGTACTGTAAACATGAAAAGCCAAAAACATATAAAA
AACAACAACTGGCGTTTGGCACTCGGTTAATAGATTAGTGCTAAAAAATAATATGAATCA
TCAAATAAATGCCCAAAAAGTATCCTCGAATAATAATATTATAGCATGGAGGAATAAAAA
GTTATAGATACGTTGGAGATTTATAAGAATCCCCAAGCTTAATTCTTACTCCTCCTTGAG
TAGGTAAATGATAGAAACCGAATTTTGGATGTGACATGCTACCCAACTTGTAATCTTGTG
CAGGTATGATCATTGACAGACGATGAATTAGAAAACATTGGCATAGTAGTATTCGTGAAC
ATAAGTAACATAATCATCAATGTTCAAAATATATGTTCCTTAAAGAATGTTTACGCACCC
ATTCATTTTCTCATATTAGCATGGCATGGCTCCGTCTTCACCACATGATTACAAGGGTCT
CTTACATTTGTGTCCCTCACTCGAACCCACTACTCAGATTTGTACCTAATTTTGAAGCAT
GCTCAAATTTTCCCCTATCGATGTCGGCTGTCCCCACTCGCCTAACCACATCCATTCAAC
ACAGAGAGAGATGAGGAGCGTGTATGAAAAATCACTGACAACTTTGGTCGCTGGAACAGG
GCTCCCAAGCCCTTTGTCGTGGCGTATGCTCACCCGTGACTTAACGTTCATGGTTTGATT
AGGAACTGTGGGTTCCTACGACATGTAGGGCTACCTAATTAGTTTAGTCTAAGTGAGAGA
TAAGGTTTTTTTCATTGGATTCCATTGTAAGTGAGTAAGAGAGAGGGATGAGAGATGAGT
TTTTTTCTGACTCGGTCCCATATGTAAGAGACACATGGAGGTAGGGGCAAATTGTCCAAA
AAATGTTAGGTAGATGGTCAAACCCCTTTGACCGGACGGAAACGAAACAGATGGGCATTT
CTGTAAGGTCACTTAACACAGAGGGGCAAATTTTAGCATGCTTCGAAATAAGGGGTAAAT
TTGAGTAGTGGGTTCGAGTTAGGGAAACAAATGTAAAAGGCCCTAAATACAAATGTCAAC
CACCACAATGTTAAGCTAGATAATTGGATTGTACTTTTTAATGTTCTTCATCTTTTTACT
ACTCACTCAATACATGAGCGTGAACCATGGAATAGAACATGGTGGTAGGTTTCAAAGCCC
ACCCCTCCATCATAAGTTGGTGGCTGCTCAGAGTCAGATACGGTTGTTGTTGTTTCGGAG
CAACCCACCTTGAATACATTGACAGAGAGAACTAACCTAGGGTCGGAATGTTTGAGCATT
ACCGAAGTCATTCTGTTATGAGAGAACTGAAGACTTGTTACATGTGAAGACTGTGATCTT
CTAGAGGGTTAGGCGTCGTGGTCTAGTGCATCCAAGATTCACTCTAGATTGCCGGGTGAC
CATGGTCTAGAACAATCCAAGAGCGAGTGTGGATTGTCGGGTGACCAAGTTTGTATGGAT
TTCAGAAGTCTCCCTTGAAGACTTACCTCAGTGATTGGGCATGGCCTGAGAGACCTTGAC
TCAAGGGGAATAAGGTGAAGATGAGGCGTAAGCCTGCCCAACCCGACATACAGTTGTCAC
AATAACTAGATCTGGTCCAACAAATCTTGTGTCTTCGTCAAGCTACTGGATCTATCTTTC
ATTCTCTTTACGGTATTGTACTGTGAAGCCATTGCTTGATCATATCAGCTTGAAGACATT
CTACGAAGACATTCCTAACTGTCATTTATCTTCATACTATCTAAGTTTATCCTTGATAAA
TCCTAGTGTGCATGATGACTATGTTCTATGTGTGTGAATGTCTTCGTAGTATTGCCTGCT
ATGCTAAGATCCTTGATAGTTATCCCTACCTCATCCTGTATCATTTTCACATACTTTGAA
TAAATTTACTGTTTCGAAGCTTTTCACAAAAATCACATATTCACCCCCTCCATTTAGTCA
AGAACTAGCACTTTCAGCCCTTAAAAAAGGCAAGTATATCTTCAGAGATTGCAGGCATCT
CTTCTTGTAAATAGAAAAAGGGAAATATGTTGCTCCTGATTGCGTGTATCTTTTATTTTT
CTAGCCTAGTTGATTTAGTTGCCGCTAATCAATTATTTAGCCAAGGTTAATTTTGTCATA
ACATGTGTATAATTAGATGCATTGGTCACCGTGTCAAAAATAATACATCTTACATAATGG
AATGAAGGAAGTACAGATTAATTGCATTAATGAATCGATTTTCTAATTGATTTAAAGCGA
ACAAATCTCCATTTAAACATGCATAATTAATTGCACACGTGATCTTCTGATTAATTAATT
TACATTAATAGTTGATTTCCAAATTGATCGGTGCTTGGTTTTTATGTTATTTTTTGCATT
AAGGACTATGTGCAAAATAATAACGTACCAACTCGTCTTTAATAGTATACATTAGTTGCA
TTAGTGACCTTGTTTCCAAATTGATTTGGCGTATAAAAATCCTCCCTCCATTCTGGTTTG
TTAGCTCACAAGCAATTTCTAGTAGTATGTTCTGAAATTCTTTAGGAATAAAAACCATTA
GCATTCTATTGGCCTAATTAATCAGTAGAGTTGGCCCTCTCTCTCCCTAAATTAACTCCT
AGCCGTGCCAATGCATGGTCTAATTAATAGAAAGTTAGAGGGATAAGGAAACTAACCATT
TTTATATTATTAATATCCATTAATAAGATATTAAGTTAGAGTAGTAACATATTCATGTTA
CTATTCTATGTTATTTTCCATCGTGAATACACAGTGGAGGAAGTATTTAAGTATACCTAA
TTAATTGCATCCATAATTAAGGGTTTGATATCCAAATTGATTCGGTGCTAGGTACATCCA
AATTAGATTTTGTATTAATGACTACTCCCTCCGTTCCTAAANNNNNNNNNTTTTAGAGAT
TGTACTATAAATTACATATGGATGTATATAGACATATTTTAGAGTATAGATCCACTCATT
TTGCTCCGTATGTAGTCTCCTAGTGAAATACCTAAAAGGTCTTNNNTTTTGGAACGGAGG
GAGTACATGTGAAATCAGGACGTATCAACTCCACTTTAAGAGTACAGATAGATTGAGTGA
TTATATTCCGCTACTATATATCGATGTCATACACCATCTCATCGGTGCCACTACCTACAC
CGCCACAACCCACAAATCAAAAAGACTGCAAACACCAAGCACCACAGTCATACCATCGCC
GACAATGGCGCTCCAACAACTCTACCTCTGCTTCCTGTGCATGCTCCTCCTCCACCTCCA
CGTCCTCCCTCTCGTCGGCGGCCGAAGCCTCCCGCCGCAGATGGACGCCATCTTGGCTAG
CGATAACTGCTACAATACAGTGAAGGGTGTGCCGAGTTGGTGCTCCGGACAGTTCATTCG
AGCCCTCTTCAACGGTGCCAAGAGCTTCCCCATCGACGAGTCCTGCTGCGTGTTGCTCGC
CTGCTTCGCGGAGCTGACATGCGGCCCCGCGATCCTTAGTGTCTGCTCGCCCCCGAAGAA
GTTCACAGATTGCCCACCGAAAAAGGCCGGCGGTGTGGTCTAACTGATAGGTGTAGCCTA
GATGCATGTGTGGTTGTGTGATTTGCAATTCGAACTTAATTTGGCCGTAGGTGGTGTGAT
CTGCAATTCGAACTTAATTTGGCCTTACGTGGACGATGTCTGCTTGACTGTAATAATCAA
TCTCAAGGCGTGCGGTCATTTTTATTCCTCAATTTTGGTTCTTGTTCTATTCTCGTTGTA
TAATAGGACACAAATGTGACCTGTTCGTTTGCTCAGGGAGTCTCTTGCATGCACGATGGT
ATGCGTTTAAAGGATCAACACAACGAACGCTCGCACAACCAGCATGTCATGGTCGAAAGC
ACATGAGCGCGAGCTGTCGCGAATTAGGATTGGAGACTCGGCCCTATTAAATCATCTATA
AACGGACCCCTGGTATCGCCTCAAACTTTCGAACAAGATGCTCGGTCAATGATCAGTCAT
AAAATTTTGATCTAGTCAGATCTCTTAAATCGGTCTCAAACGCTCGGACTCACCGACACA
CCTCATATCCAGCCCGAATATAGAACGGATATGAAGAAGCCCGGGCGCCATGCTAGCGTG
GATCGACCCTACAGATCCAGCCCACTTCACTTCACCTCCCTCCGCTCTCATCCGCCACCC
AAACTCACTTTCGACATCCGGACGCCGTGGCGGACGTGCAACCCCTTCGTTGGCACCTCG
AATGCTAACATGACGCGTCATGCCCGTCATGCGAGGCAGCGGACGCGGGAGGTAGCAGAT
GCTAGAATTTATCTATGTGGGCCAACCCAATAACCATATTTAGAATTCCTCATAAATCCT
TAAGGCGCACGTAACCATTTATACAAGACAAGAGGCGGAACTAAAGTTTAGTGTCCCTTT
GCTAGTTTGATAGGAGTTGAACCTCCCTATAAAGGAGGATGTTCCCAAAAATTGCAAATG
GTGCACGTGCACCATGGTGCCCGTTTTCAAAAATCATATTTCTACAACGTAAAAAAAACT
AAAACATTTTGTAGACACACACAAACATGTACGTTATGTATCTTAAAATTTCAAATCATT
TTACTTTCACACATGGCATACAAAAAAATGACAAATATGTATTTATTAGTGGGCTTTTTT
GTTATTGGGCCAAATTTTTGTTATTTCATACATCTTACAAATTACATTTTTCAAAACAAA
ATTTCACCGATTCATAGTGAATACATAGAAGTTTCCACATAATTAATTTTGAATTTTTTT
GAAACATTTAAATATGTTTTTTGATTTTTTTCAAAAACGGGCACCAAGGTGCCCGAGCAC
ACAAATTTCGCTCACATGCATGAGCATGAGAACAAGAGAGACATA
