Map Locations of contig_82045 (9061 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_82045

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_78827 1 1469 bp MLOC_78827.1 Available Available LOC_Os02g54160.2, FRAME:-1, EVALUE:9e-103, 13102.m12340 protein AP2 domain containing protein, expressed
MLOC_78826 1 2065 bp MLOC_78826.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_78827






CDS Structure of MLOC_78826






Contig Sequence (9061 bp)

>contig_82045 9061 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CACACCAATTGAAGCAAACGTGACACCAAATTCAATATAAGTCGAGTAATAAAAATATAT
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TGTGTATTGCAACTTGTTTATAATACACTCATGATTTACCATGTATATAGACATTATTAA
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TTTTATACTCAAATATCATAAAAATTGTGCAAACCGTAAATAGAAAATTTTGTAAATATC
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ACCCCATCATGCCCGAGCTCCAAGTCGGAGTCCGTGGAGTTGACCTGAAACTCCTCCCAT
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AAAGCTCGTGGTACATCAAGATCATGCAAAATTAAGAACATGAGATAGAGAGAGATCAAA
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AGGGGGCACACCCCGAGGCTCATGGCTCCCCTGACAACCCTTTGGTCCATCTCTAAGTCT
TCTTGGGTCTCTTCTAGTCCATAAAAAATCACCATCAATTTTTGGGACATTCGGACTTTC
TTTGGTATGGAGTTTCCGTGAAACAAAAAATAGACAAAAGCAGGAACTGTAACTCGGCAC
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TGTGAATGCTATGATAGTATATAAGTTTGGTCAATGATAATTTCAATCACTTTTCCTAGC
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TCATATAGTCTTCTATGATTGATGGTACTCAAAGAATATTTTTATAACAAACAACATCCA
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GTGTCTTTCATGTCAACGTCACGATAAATGATTTTCTACATCTTCCATGTAAAATAAATT
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ACCCAATATGAAACTACTACCCAGCATAAGGCACATGTATACTTTTATATTTATGAAATT
AAATTCATTCACATTTTACTCTCAGGATATAAGTGAAGCACAAGAGTAAACATCAAACTA
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ACTCTCTCAATCAAGGATTTCAGATTTAAGAATGATTTGAAACCACAAACAAAACAAAAG
GACACTACAATAATAGAAGATACCATTTGAATAAATACAAACTTAGGATCAACATAGAAT
AACTGATAATTCTTGATGAAGAGAGGTTAGATGCCTAACATGGCATCCCCAAGCTTAGAT
GTTTGAGACTCCTTGTAACATTGACTTGGGGAGCCTTGGGTATCCCCAATCTTGAGTTTT
CATGTCTCGTTAATTTCTCTCATAGCACGGTTTCCCCTAAGTCTCAAAACGTCATCCACA
CAAGACCTAACAGGAACTCGTGAGATACATTAGTACACATAAGAATATATCAACAATTCA
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TCCATAATTCGTATCTACCAATATAAGTCATGGAATCTATAGTATAAGTGGATAACAAAA
CTATGATAATAATCTGTCTAGTCCTCTTTTCTCGGACATAAAATCACAGCAAATGACCCT
TGTGTCTTAAACAGCCCCAAGATTACCGTTCGTTGGTGGACACTTCCTTGATACATAATT
CAAAGTAGTGACAAAAATTTGGGTATGAGACCATTGTCGGGACCCCGATCCTAAGCCATA
TAATTCCAGCTTGTAACACATCATATCACTTTGTGACCTCACGCACAGTAATCACCACGG
CTGCCACCTTNNNNNNGCCGGGACCGTTTGCGCCTTTTGCCCACGGATATGACTATGTCG
G