Map Locations of contig_81648 (12141 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_81648

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_78724 4 2066 bp MLOC_78724.3 Available Available None
MLOC_78723 8 2535 bp AK249511.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_78724






CDS Structure of MLOC_78723






Contig Sequence (12141 bp)

>contig_81648 12141 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGCCGCAAGACCGTCACCGCCATGGACGTCGTCTACGCGCTCAAGCGCCAGGGCCGCA
CCCTCTACGGTTTCGGCGGTTAGGCCCGCCAGATCCGTCGCCCGCGGAAACCAGATTAGG
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CCCGGTTCTGTCGCTCTGTATTATCTTTGTCCTCAAATTAATTGATGTGTGCTACAGTGT
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GTGGCACAAATTGCAGGTAACCATAGGCGCCATGGAGTGGGGGAAAGTCTACTTGGTGGA
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CTCCGTGGTACTGTATATCATCACCTTATGCTACTTCGACTGATCTTTTGAAGTGGATGG
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TGCTCCTAGTTCGGCTTGCACCTCAATCTACTATTAGACTTCTTTATGCAACCAGGGAAT
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TGCCTGCATGCGTTACTCGCTCCAGTCACAGATATAAGGCATTTGGACATTGTTTTCTAA
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TCACATCCTTTTTACTGCATTTCCTTAGAGATTCTTCTTCAAACAAACATGCAGACTTCC
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TTGCACAGTGTTTTCATATGTTTTCTTTTAGATCTTCAGTATACTGCACTTATTGAGGTG
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TGTTGAAGTGTATGTGTGGATTGACTAGCCTTTTCCATCAATTTGGACTTCTAGTTGTGT
GGCTTGTGAATGAAACTTGACAACTTTTTCTGTCAAGTCATATTAATCCTTTTGCCTTTC
TGAAGAATTCATTTTATTGTGTTTGAGCGCCAGTTCAACAGGTTTTGCTTAAATTTATGT
TCTGATGGGAAGACATATTAGAGGCAGAGCTCAACCAAGAGCAATGTTATTCTGTATAAA
TATATTACAGTACATATATACAACAGTTATGATCCAGTACTACTCATTAGTGACATGGTA
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TTTACTCATGAAGTTAGAAGGCATATTAGAATCCTTTTGCTGTTGGCTTTTATTCATAAA
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TTTTTTGCTCTCTAAATTGTGCGTCTTTATTTTGTTTGCTCCTGTGTAGAATTAGTAAAT
GTGCAGAATTGTTAAACTATCCTAAGCTAGGAGATAGAGCCAACACCTTCATGGAGTAGA
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TCCTAAATCAACATCAAGTTTAGGAACAAGTGTGTTCCTAAATAATCTTCAGTTTAGGAA
CAAGTGTGTTCCTAAATAATCTTCAGGAAAAAACAGAAATTGATCACCACATATTTCCAG
TTCCAAGTTTCTAACAGTTTCAGTATTTTCAGTTCCAAGTTTCTAACAGTTTCAGTTTCC
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NNNNNNNNGGCTAGAGGTGAAACCCATAAGATCAAGCGATCAACTCATGGTCCCGGATAG
CAAGCTTCCACTCACCCTTGTCCATGGCTAGTTCTTTGGTCTGTACGGACTCTTCCCATG
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GTTTGTTTTATTCTAGACTACTTCTGTTGTTTTTTAGCTGACTGGTGCAACACAACATCG
AGCGAGCTCGCTCGTTATTGGGCCGTGGCCACGCTATGTTGTCAGGATGAGTGGCCGCCG
TCCATCGGGGGGAATGACTCATTGTCGTCTCTTCAAGGCTCACGCCCTCTCACTCACAGC
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AGGACAAGTTCATATGAAGAATGTTCTTGACATGTGCCGAAATCCCGGGTGCTTGTGAAC
CCCAACACTTTTGATCACATTGGTGTACCTTTCCATTTCGCTTCCACTGCATTGCTTGCT
TTCTTCGTCAACTACACGTATAACTCTCTCAGTTTCTTTGGTATGCGGGCGGACAATCTT
AATCCACTAGAAGAGAAAGCTTCTCCCTCCACCGTTTCCTTGACTGCTCCTCTCATTTTT
TGGCGAGTACTTACATGATCCAATCTAGTTTTCTTCGGTGTCAGCTTTGCACCCGTTAGT
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CAAAAAATTTGAGATCTTACTTTTTTTCTACCGCCGGGGTCCATAACAGAAGGATATAAT
AACCTACCGTCGAGGTCTCTGGCGGTAGGGTTGCATGCCCTACCACACAAAAAATTGCTA
AGTTCCACACACAATGCGTATATGCATCTATCGTCGGACACCTTGACGGTAAGGTTGCAC
ATGCTACCATCAGACCTTGTGGCGGTAGGGAGCATTGCGCTGACGTGGTCAATTTGCCTA
CCGTCAGGGACCTTGATGGTAAGCTGTTATACCCTGCCGTCATAGACGCCGGCGGTAGGA
AAAGGGTCGAATCCCATTTTTATTTACAAATGAGGGTTAATTCTCGAACAACTTTTGTAA
AAGGGTCGAAACATGCAATTTTTCCTCCTTACACTGGTATGATTGTTGTGGGCGACACTG
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ATTCTTTTGGACTCGTATGACCATGAATCTAGTGGTTAAATAACCTCCAACTTAGCCAAA
CCGCGCTCGCGGTCACCTACTCTCACCTTATTGGTTAGGTGACTCTCTAAGAGCATCTAC
AACCAGATTAACCAATATGATCCCCTAAACGTGTGCGAACGCGACCGGTAGACCGGGCGT
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TGTACGTAGTTGATGGAGATGAAGAGAGATAAAAGAAAAGAATGGATAACGAAAAAGAAA
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ACGGTCGCGATCGGCATCGGCATCGGCGTCCATCAGCGCCCGTGTTTTTCTCCGGGTCTG
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GCGCGACACCTGTGCCGCCGGTGGTGGTTCCGTCGCCGGCTCGTCCCGATCAGGCAAATG
CGGTCCAAGGGAACATGTGAGGCCATGTGAGGGCGCGTCTGTGCCGGTGACTCGGTGTCG
GGGCCAAAAGCGTTCGTTTGGCCGTGTCCGGCGCCTCTGCCGGCCCCGACGGCGACCGCA
GGCGACGATCGCTTCGCTGTTCGCGGCGAGAAGCTTAGGGTCGATCGTCCTGTATGTATG
TATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGCTTGCTCTCGCAGCCCAAACGGCCACAA
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GTACCGGCAAGTTGGCGACGTGGGTGGCATCCGGCTTACCAAACGGGGCGCACGGACAAG
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AGCCTAAACCAAGAGGAGCAGTAGTAACTCAACTCTGCCGATCGAGCGCAAAGTCATAGA
ATTCCCGATATGATCGCCGCGTCGCACAGCGATGTCCGAACATCACAAGGGACCACTCTC
TCTCGGACTCGGTCGCCGCATCGATCACATATTCACATGAGGTGAGTCATCAATGGAGGG
AGTGAAGGAACATCGCGTAGCCCGTGAACGATGGCCTTCGCCTTCGCCTTCGCCTTCATT
TGACTCTCCTCTCGCGGTTGCTGTAGCGGGCTACCTTTTGCGTTTCAATGCTGCTCCATT
CACTCTGACTCTGGGGGGTCTGGATGCTGATTACAACGAGAGAGAACATCACGAGCATGG
CGTTCGATTTAAAGTCTGAGCGCCTTCTTGCCTCAGCTCGTTGTCTAGCCGTCTTAGTGA
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ATCTATACTTCCGATGGGCGATGGATCACCATGCATGCGTGCGTGCTCTCTTGACCGATC
ATGAGTCCTGTTCCCAGATCAGATGGTTCACGAGTGGACCATATGTGGAGCCAGACGTTC
CTCGCAACATGACACGGGAGGTAGGTTGTGGTCTGTGGCAGACAACAGGGGTGTCAGCTC
ATGTGTTCTTTGGCCATGGCCCTCGAACCGGGCCGGACCGGGCCTCTGTGTAAAATGGTA
ATTTATGCAAACATGAACCTGGCTCGAACTGCTACCCGGACATGAAAACTCGGCCCGAAC
CTGACCCAAACTGCAAGCCCGGACTGGTCCGGCCCGGGTTTCTTGGACGGGGTTACCGGG
CCGGGCTGCCTATCCCAGATTTAGGCGCAAGGCCACCATTGGTCCTGGCCTGGCCATGCA
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TGATTTGTGACACTAATATAAAAGATGCATAATTGGTGTTAGGAATCAAATTAAATAGCG
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TCTTCCACTCTTACTTGAAAATGCGATGTCATTTTCCCGAGGAATTAATTTCCATAAACA
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GCTGGATCACAAACTTGTTGCGGATAGTCCATAGAGTTCACGTGAGCACCCCCGATGTCT
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TGTCGCGGAAGCAACTCCAGAGGAATTGAGCAGTGATGCAAGTGAAGAAGATGTGATTGG
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CCTCCACCCTAGAGGGTACCCGGCCCCGAATTCATTGCCACAGGAAGATTCTGATTTTTA
GTGGTAACCTAATGTCACACACATCGGTGAGGGCCTCTGGGGCAGACGACGGGGCGATGG
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CCGCAACGGTGTCGATGTCGGGCGAGTGGTGGGCGATGCACTCCAGCATCTCATCCTAGG
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CGACCTCGACCGAGGTCCTAGGCTCCACCGCGATGGAGAATAATACCGGGAATCGAACGG
CAAACAACGATTCACTGGCCGAGCGATCAAACCAAAATAGTGTAGCGGACCCAGATCCAA
TCGAGATGGAAGAACCAATGTGAAGGACAGGGAGCAACTGGATGACCGATTGCCAGAATT
GGGGGCCTCCGGAACGTTGGCAGAATGTGAGCGGCTGGCCCCAAAGGTACTTGCTCCTAA
TGATGTCGAGCCAGAGGCCACCGTCACCATTGGGAATCCTCCACAGCCACTTAGTCAGCA
AGGCGATGTTCATGCACTTCGACGACATGATCCCCAGACCGCCCTGGTCGCGGGGCTTGT
AGATGCCGGGCCAGCTGACCATGTGGTATTTCTGCTTATCGCCCTCGCCAGCCCAGTAAA
ATCTAGACTGGTACTTGGGAATTTCGTGATGCAAAGTCTCAAGGAGACTGTAGAAGCTCA
TCACGAATAAGAGAAGGCTGGATAAGGAGGAGTTGATGAGCACGGTCCTGGCCACCTTGA
CAACCACCGACCTTGCCACGGTTCGACCCGGTGTTGGAGCTTAGACACCGTAGGCCGCGG
GTTAGCGACAGAGAGGCGCGAGTCAGTAAGGTGTACCCCCTAGGTAGGAGGAGGGGAAGT
ACCCAAGCTGGCAGTTTAGGCTGTCGGCGATGAGTTGGGCCTCGTCGGGAGAGTAGCCAA
AGATCATGACTTAGCTTTTGTCGAAGTTGATCTTGAGCCCCGATATCTGCTGAAAGCAAA
GGAGGAGAAATTTAAGGTTGATAATATCATCCTCAGATCCCTCCTCCGTGATAATGGTGT
CATCAGCATATTGCAGGAGGGAGACCCCTCCCCCTCCTACGAGATGAGTAACAACACCAT
GAATATGGCTGACTGCCTTGGCCTTATCGAGGATGGTGGCAAGGGCGTCTACCACCATGT
TAAACATGAAGTGGAGAAGGGATCCCCTTGCCTAACCCCACAGTGGGTGCGGAAGTACGG
TCCAGCTTCCCCGTTGATGTTAAACGCGGTCTAGCCAGACGAAACCATCTGCAAAACTCG
GGTCACCCACCGATCATCAAAGTTGTTTCCTTTTCTCTTTTACATCGTGTGCATGAAAAG
GGAATAGATTAAGGACATCTCCAACGCCGTTCTTTAAAACGTCGGTAAAAGTCCACACAA
CACGGTTTGAATGTTTTGTGCCAGTCAATGCTATGTATCAAACGACCGTGGACTGGTGGA
CATTTCCGAACTCCTATAAACTGGAAGCACGGTCGTGGAAGGTTTGTGAACGTCCGGATC
CTCACAACATAAGTGTCCGACATCCTGCACCCATCCAAAACCGAGGTGGAGTCTCCGCAT
TTGGACAAACACATTTTTCACACGAAAGCCCATCCTTTTCCCACTATCTCCCCTCTGATC
GCTTACCCTTGAGCCGCAATATTATTTTAACGTCACGTCTATTAGCTCATTCCTCTTTCC
TACTGTGACACAACGTTTGCCGCCTCTGTCCCCGACCGACTAAGGGCAGCGGCAGCATGC
GCATCACAGACAAACTTAATTGTGGCCCCTCCCCCTTTCAAGGAACTTGTAATTGCGACC
AAAGTCTATCGACGGGATAATGGTAGATCGATCGAGCAACCTCCGATGTGGCACACCTTA
ATTATCGGATGTAGAATGCATTATATGAGACGTGTCCGGTCAGTGTGTGCCGATGCGATT
GACACCACGAGGGCATCTTTTATTTTCTTTTATTTTCTCTCCATTTTTATGCAAATCCCT
ATCGATTATATTATAACGTCTTAATAATTGCTAAATCTTCAAGCCATCCATCCAGCCACT
AGTATAGTTGTTAACTAGTGTAGTCCTTTCCAAGGCGTACTTGACCCGTAAAGTTGCATC
ACCAAACCACAAACCCTTGCCTACTCACTTCTTCTTTTTCAACACACTACACTACGTACG
CAAGCCCCTCATATACATACACACATGTTATAATCATCCCTACAAACATCCACCTTATTC
ATTCATGCCAACACCTCCAACACACTAAATCGACATATCATGTTACGATTTACCAAGGAC
TTAAACCCCGGTGGCCTAGGGATGACATTGTTTCTCTAACCATCCAACCACACATTGATT
TGCACTCAATTTTTTCTTGAGATTATATATAAAAAAATGATAGTACCCGTAGATGGTTGT
ATATTAGGGGTAAGCCTACGGACCTGCTTCCCTAGGTTCACCTAGGACCCCTTACGGACA
TCACTGTCCTTAAAGTCATCCGTGTAGCCTCAACCTCACTCGATACTGCATACCATAACT
CGGCCTCACTGGAGTCACTCGGATGCTTCCTCGCACTCGGACCACAACAAGGCGAAGGGG
CTGCAACGGCTAAGGACTTAA