| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_79930
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_78372 |
2 |
1505 bp |
AK370602 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_78372
Contig Sequence (10296 bp)
>contig_79930 10296 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACCCCGTCACACACAAAAACCCCGCACCCCACACCCACCCCACCAAACAACCCCGCCCCC
CCCCCCCCCCCCCAACACACACACACACCCGTTCAATGGCTGATGTTATCTTTTCTTTGT
AGGTACCAGAGGAGGAGAAAAACCTTGGTCCTTTTGATCGCTTGATTCATGTATACCATT
TTACCAAAGACACTCAAAACCAAACGGTAATGCAGTTCGGCTAATGCTTTCCCTCAGTTA
CTCAATCTATGCATTTATTTGTGTTCTGTAGAACACAAAAAATACAGCCTGGTTGTGAGT
AGTTCCTCAATGCAGTTGGACAAACTTTTAGTCATTGTACCACATTTGGTTTTAAGTCGC
TTTGTCATTCACTGAAAGAAATGCTTTAACTATGTCTCTAATACTCAAATATTTGACATT
GTCATGTTCCGCCCACTGTCCAGCATAAATGATGGAATTGGGCAAGGCAATTATTACTAA
GCAGGATTTCCTTGTTCTGCTTCTGATAGCATATTTGGATCTCTAGTTAACCACATGCTT
GATATTTATCCTGATTTCCACAGCAAGTTCAGAATTTTGGAGAACCTTTCTTTATGGTTA
TTCGTGAGGATGAGACCTTATCTTCTATCAAAGAACGTTTACAGAAAAAGCTTAAGGTCT
CAGAAGAGGATTTCTCCAAGGTAATGAGGATTTTCCCATGGTTTCTATATTTATATATAA
ATATGTAATTTTTTTTGTTTTGTTGCTATAGCGGCATAGCGCATCCGTGTCAGATGTGAT
GTTATTGAGATATGTGTATGCTTTTGCTACTTGTCAGAATATTTAAGAAACAGTAAGCTT
TTATAGCCCAAGGCCTCACTTGGGGTATAAGAAACAACACAGTTAGCTATTCAAATTTTG
GTTTATAAAATGATTATCAAAATGGTAAGCTTTTTGATTTATCTGATACATTTTTCGTTG
TCGGCTTATCGCCTATATATTTCGATGTGGAAATTTAAATATTCCGATTCCGACACATAC
CGTCACAAACCTTGGTTCATGAATGCTCAGGTGTTGGGGGATATGGTGAAGGTTATTAAT
TTCATCAAAGCGGTCCTTTGTGTTTCGAGGCCTAACAATCCAAAATAAGTACTCCCTCCG
TCCCAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CTAATTGGAAAGATATTAATACTTATTGGAAGTAGTTGTAACAGTCTTAATATTTCTACG
AGGTGTGTTGATCTTGCTTTTTGTATGTGGAGCTGACACCTAGTGTAAACATTGGTTAAA
TTGTACTTACCCGAACAAATGTTCTCTTTGGACAGTGGAAATTTGCATACATATCCCTTG
GCCGGCCAGACTATTTTGAAGATTCTGATAGTGTAGCTACGAGATTTCAGGTACTATCAT
GCTAGTTATCTACTTGTTGAAGTAGCTTTTGTAGCGCTTAATTTGATTTCAATTGTATAC
ACTTGTTTAGAGAAACATGTATGGAGCTTGGGAGCAGTATCTTGGACTGGAGCACCCAGA
CACAGCGCCAAGAAAGGCACATAGTGCTAACCAGGTACTGGCGGCACATTGTTGCAACTT
GTGCTAATGATGTCAGCGTGCTCTATATTCTTGTTGGTTGGAAATTTGCTAATTTCATGT
TTTTTGTGCAGAACCGCCATTCGTTTGAGAGGCCTGTAAAGATCTACAACTAGACAGTTG
TGAGAAGCAGGAGTGATATCCTGCCACGCAATACCACCAAGCAAGTGGCTGAAACTGAAA
TTGCTGGCTTGAATAAATCGTGTACCATATGATGGCAGGACTGGTTGCTCAAGTTAATGA
CGGAGCCTGTAAGCTAGCGTTTCCCCGCACTCTGCCCTGGATATATAAAGTTTTTGCAGA
GATGACCCAACGAACCATCACCTTCTAGTAGATGAGGAGGCTGTTTTTCTTTTCTTCCAC
TAGGTGCTCTATACAGTCAACTAGCTAGTGGATTGCTTGGTTCTGCAGTTGTTGCTAGGT
GCAGAGTTGTTGATGATGCTTTTTTTCTGTATATTATTGTTGTGAGCTGTACAAGTGCAG
TCGTTGTTGATGGTCATACGGTATCTGTAACTCCAGTGATGATATAGTGGCTGCGTCTTT
TCACAAATTTGTATCTGATTCTCCTAAGCTGTCCTAGAGGGCTGTTACCGCACCTGACTC
GAAGTTTGGGCTTCCTTACCCTCTGCTCTTCAAAAGTATGCTAATATGTTTTAAATTCCA
TGATTCGATGGTCCGTGTGGGTTGTTTCTCATGCAGCAAAGTGTCGTCTCATGGGAAGTT
CTGAGCTTAACAACACAAAGAAAGGACACAACTTTGGTGGTAGTGAAGTTTTTGTTTTGA
AAGGGTAGTGGTAATGAAGTTGGTTTATGCTGATTGAAGATTACAGCGGATCCAAATTCA
GCCTGTTAAGCATGACCCATGGGTTGTTTGCTATACTAGTGGACCTGTTGTGCCAAATAG
CGCCACGTCTGCAAATATGAATATAAACAACTTAACTTAATACTCCCTTTGTTTTAAAAT
AAGTGTCTCAAGCCTAGTATGACCTTATACTATACTAGTATAAAGTTAAGATATTTATTT
TGGGACGGAGGGAGTAACATAGTTTAGATTAAACCAAAATTCATGCCTTGGTATGAAAAA
TTAAGATTGAATTGTCTTTTAAAACGTTATAGGTGGATGTTGTAGCCCACTTCCCTCTTT
GAGGCGCGACCATAGGAGATCTCTAAAGGACGCGATTGTTCCGAAAGGTTGCCTCCAAAG
GATGCAACGCTTCAGGGTGAAAACCGCCTCACGGTTGTAACCATCCATGCGGGAAGAGTG
GAGATTATCCCATAATTAATGATGGGTTAATTATTCTTAACACCCCCTAATCATATATTG
AGTGCATATGGATTCATCATCTTGATTAAGTCTCCTCCAAAAATCCTCATTAAAAACTGT
ATGATAACCTATTCCGTGAGCATATTTTTGGAATGTAAAAGTTGGTAGAGACTTCGTGTA
CAAATTAGTTACATGATTTGATTGGCTAGATATGCAATATAGCGATATTGCTTATTGCGT
AACCTGCTTGCATCCTCGCAACACAACAAACTTTATCTTTGCGATAATGTTTGATGGATG
TAGACATGTGGTCTGTTTTAAAGACTTTCATGAGATGGCTACCACACTTAGTAGGAACGT
TAAACTTGTCTATGATCTTAAGTAGCAGGGATCTCATAAATGTATCCAATGATATTGCTG
TTTAGATTTCTCTCAAACTGAAAAACTAGGACAAGATTTTTGATGCCTTTGGAGATATCG
ATAGATATTCTTGAGTCCCAACCAATTTTGTTTGGTGGATCCAATGGCATTATGGAACGT
TGAGTCGCAATATCTCATTTCCATCATCTCTTGGTCTAAATAGATCTTTCTCTAAGTCTA
GAGAATGAACTACCATGAGAGTTATGGATGGATAATATTTGTCCATAATGAATTTTTCCA
ATATATTTTCGGATATAGACAACATAGTATACCATAATGTATGAATGAAGGTGCTCAAGT
TGTAGTAACGAGCGATATTTTGGTTTACCCAAATCCCTCATTTTAAACTCCGTCATTTAG
ATGATTACATGTGTCGTCATTGCACACATACAAACATGGATAGTCATAATTGTAGGAGTA
ATCCTTGTGCATAAGGAATTCACTACGTCAGTTGTACCAATTGTACCAACGATAATAATA
AGTCATATGTTGACTTATTGATTTTATACAATGTATGTTGCGTTTTGATTTTCGATTCAG
AAGCGAGATTTCAACGCGAACCATCTATGTGTGAATCTAGTGATCCACATGGATATGTAA
TCACTACATCTATCAACTCGAGAGATAAATGATTTTGTAATGCGAACGATATAAGGTATC
AGAAAGAGATTCCACGTGTGGAGAATAGCTGAGTATCTGCGTGAACCCTTGTGCTATAAT
ACTTACTATATAATTCACCACCTTGTTGTTCTCAATTCCGTTTCCAGAAGAAAACCGGTG
TAGGTTTTGCTTATGAATACCTTCCCATTATCGAGCAAGATTATTTCTACATAGATTATA
ACCTTTGCAATCTAGTTGAGAAATATGTGTTGACAGTTGTAGACTTCCAGTTGTATGTTT
GTCCAGAATCTATATATCAATATAGAGTTGATGGAAATATTGTTACCCATGCCGACTGCT
CATGGTTTCCCAATGCGATTGAGTCACGTATTTCGATGTCCCGGTCATTCTGTGCACTAT
GACCTGGGTTGGTGGAGGTTTCCCGTCCACTGGGTGTATAATACACATTAGGTGTGTGTC
AACGTAAATTTGACTTGCCTTTACTGATTCCGAGGCCTTGATATCCTTGCTTGCGAGAAG
CTAAGTCCCGATGCATTTTTGCCATATACCTCCCCTGTTTCTTTGAACGGGGAGTGGAGT
GGAGTTTGTTGGTACTTCCACTCTTTCAGGCGTACTTTTGCAGGATTGTAAGATTGTGAC
ACCTTTATAGTGAGTAAATGAATCCGGGAGGTTATTTGCAATGTGTTGCAAATCTGTTGA
ACGCATGGTTCAGATCTTTGAGTACGCGGATTTCAGGAAGAAATGTGTTGAACATTCCAC
TAATTTCCTGACATTCTTTATGATATTTGAACTCTCCCCCTAATGCGTGGAAATGGTCCT
CATTGAATCAACATTCTGGCCTTGAATAACTCCCCATGTGAGGGGCTTGAGGTATTGACA
GAAATACATCTATTCCTCACATAGATCCCAACTATATGTTGAGGGGCTAATGATGTATGC
CGGGTGGTGATATCGGTATGCAACCGAATTATCTTAGATGGGAAATACTTGGTAGACTTC
CGCGTATCGAAGATAGAGGGGAATAATATCATGCAGTTTGGTCATGAGCGTCTAAAACTG
CATGACTCCAACATAAAGTTGGTAAGTTGCAATTCCAAAGTAAAGACAATGCAATGAGCT
TAACTCTTTGAATAAAGGATTCTACCAAACCATTTTGAGGCTAGACATTAGTACAAATTG
CTAAACTTCAATCCGAGTACCATAGAGAAGGCACTCAAGGTGAATTCTGCAATGTTATCC
ATTTGATTTACTTGAAATCGGTGTGAGGATAATGAGCCAATGGTTTTGTGTGAATAAAGC
ATACACTTAAGACCATCATGTAGATATGTATTTTAGAACCATGGAATACGTGAATAGACT
ACTAAAATGGTTGGGAAGAGCCACTTACCTTGACTTGATGCATTCAAGGAGTCTGAGTGG
TTCATCATAGACTTTAAGGTGCACGGACCTTAAAATTAGCTTCTGTGTGTCACATGTAGG
GCACACAAAATCCAAATATTGTTAGAATTTAGCATCATAATAATCATAAACCAATGGAAT
TGTTGATAGTTTCGGTTTCAACCCAATGTGTGGATGACCAAGGTGAGTATGCCAAGTTTG
TCATATACAAGACATTTTGGAAAACTATCTTGGATGCAACATGGGCTACGAGTTTTGTAG
TATGTGCCGTACAATCCAGATGATACATAGAGTATGTGCTTTCCATATCCGTTGTATATG
CTAAAGATAATTAGTCCTCTTTGTTGTCATCATAAGTTTTTGCTATGGAAACTCTTTTGA
CGGATACCTCTATAGTTTGGTAGGGTACGAGTTAAACTCAGAAGCAATAATGTACCCTCA
CGTTACTCGAGTACCCACAGGGATATTAAATATGACTCGAGTTGAGCCAACAAATACCTC
ATCGCATCTAGCCATTTTAAAATATCCATCTTCTCTCAAAGAGAGTGGAAACATTTTAAT
TCCCTGAGTATAGAGTTCGTGGTGCATATGCCCACAAGACACAAATCATCTTTTATCATA
TTGACCCCCGTAGAAATCTAGATATAGACACGAAGATTCTCAAGAAAATCATTGTTATAT
ATAGAATACGTACAAATGTATTTGTACGAAAGCACTGATATAGTATATTATAATATACAA
TATATGATGACAACAATACTTATGTTGTTGTTATAAATGGACATAAGTTATGTTGACCAC
TCAGGAGATTGAGAGACTAGTCGAAGTCTTCAAACATGTTAGTTGAGTCATATTCAATCT
TCATTTTCTCCATGCTCATAGGGTCCCGTGACAACTGGATAGTCATTTTATTGCTCGGTT
CTAGAAGAACATCATGCAAAACAACTGACTTCCATTATGGTGTTAGATTGAGGGTTTGAC
GTGAGTTTCAAACCTTTTATCTGTGAGGTCCTTTGCGTCCCAGTGGAGTGGCTTGGACTG
CACGCGTTATCTTATGGGATGCAAGACTCGTCTTGATGTCCATGGCCTCCTTAAGTAAGT
TGTGGCCATTGAGGGCAAGAGCCTCAAATTACTTAGCCATCGATTACTTATAGGGGAAAA
CGAGAGATAATTAATTTAGCATAGGTAAATTAAAAAACAATCATGGTTAACATTATAATG
CATTTTGCAAAGTTAATGGGTACTTCAAGAAGTTAGTTTGAAACCATTTGTGTGAATCTC
AAATTGCTAAGTATGACATCTTGAAGATAATCTCCAAAATGGATAAGATCTCACAACACT
AGGGAGTATAATTTGATGAAATTAGTAGATACTCACTCGTAATGTCTTATGTCATGACTT
AGTAAAATGTGTGGGATAGCACTTTGTAAAGCAATCATAATGTTTTAACAGTAGTGGTGA
TAATCTACAAAGCAGTAGATCTACACACTACCTTGTGATCCCAAACATAAATTTGAAGAA
ATCACTTTGAATTTTGCATATGTATTTGCAAGAAATTGAAAATCTCAATTGCAGATAGAC
GTATTAATCTCGACATGTGTCTAACATGGAAATATATACATCATAGAAATATTCTGGAAT
ACATCATACTCAACGGAAAAATAGTACTGCAAAGGTACTGGATTTATCTTTGCAAGAGAT
TAAAAATCTCAATTGCAAATAGATGTAATTAATCTCGACACATGAAAAACGTGGAAATAT
ATTACACCAAATTAGGATGAATACATCGATACTCAACAGAAAACAGTACTGAAATATATG
TACTGAATTCAACAGGTCTAACACATGAATGAAATTAGTGCTAGAACTATTGCTAGATGA
CTTATCTGCTGAAAATGCTAAAGTATAGCAGTCGCTATGGTGCAAATCAGCAAAGAGCTA
CTGATAGCCCAATACGCATGTAGATGGGACAAATTAGGCAGCCACGTCACGCAATCGGAT
AAGGGAGAGGCGGAGGGCAAACCAAGGATATAATTCCCCACAGTAGCTTTGATCTCCAAT
CCACATGCTCGAGACCAACACAGGAGGAGGCCCCCATGGCCGTCAACCGCATTACTAGCG
ACGAGAGGAGCTCCAACCGCACCCTTCCCCGTCGGGGAAGCGGATGCCAGGCGCGGAGTC
AATGGAGAGGCTGTGAGCCCGAGCACGGTCGGTTCCAAGTTCTCTTGCGGGAAGTGCGGC
TGCTCAACGCTGTGAAGTTAGAGGCCATGAGGCGCCTGCTACTGCGGCAAAGGGGGCCGA
GTGTCGGGCATCAAGGACGAAGGCGCTATGGCGCAACAACATCGACAACTACGTGCGGGG
TCGGGTGGAGCGCCGTGAGCGCGGCCACGGCCAGGTGCCGACGGGCACGACCCGAGCCTG
GCCCGAGCAGCAACGGTCCCGCGCAACCAAGAGCTGGCACGATCATGTCCAGGAGCGGGT
GAGGGCGGCGAGGCCACGGCGCCAGCGGGCGCGACGCACAACCGGGCGTGGTGTGCAGCG
TGGGGCGCACTACGGCGCGGTGGCAGCGTGGTGGCCGTGTCCAACGACAAAGTGGTCGGG
GATGGAAATCGTCGTCGTCATCATCTATTTCGTCCTCTGGAGACGCAATCGCTGCCTCGA
CAGGGCCGACGGGGTCGACAACGACGGCCGCAAGCAAACCACGGGGACATGGTCCCCACC
CGTGGACCACGCACCATCCCAGCGGTGGCGGTGTCGCTAGTTCACATGGTGACGAGCGTC
AACCGAAGGAAGCGCTCAATGATGAGCGTGCTGATAACGTGTAAGAAATCAAAAATGATT
CAAGTCCCTTTATTGATAGATGATACTATCTCCGTCCTAAAATTCTTGTCTTAGATTTGT
CAAGATACAAATGTATCTAACACTAAAATGTGACTAGGTACGTCCGTATTTTGGTAAATC
TAAGATAATAATTTTGGGACAGAGGGAGTATGAGTTTATATACAATGCCAACAGGTGTCT
TGAAAGGAGGCGACTATTCCAAAAAGTTGCCTTCAAAGGATGCAATGTTCGAGGGTAAAA
TCGCCTCACGGTTGTAATCACCCATGCGGGAAGAGTGGGGATTATCCCATAATTAATGAT
GGGTTAATTATTCTAAACACATATTAGCCGAGGTCATCCTAATCCATGTCGATGGCCTCG
TCAGATATGTAGTCGAGCGCATCGGTTATATCTTCAACCGTGGTGACTAGGTGGGTGGTG
GGTCGGATGAAAATTTCCCGATCGTTGGCTTTACATCCGATCTGATCATAAAGTGCACAT
GAGATCACCAGGTTCTGGATCCGGTCCAGCAACTCATTTATCTGTGAGAGCTTCTCCGCA
TCTAGGGCCTGGCGATATGCCGTGCTGATATGAAAGGAATTGTTCGGACCGCCCAAGGCG
GTCCATCTCGTCTGGCCTTGTAGGCGAGTTCTAGTTCGAAGACCGGAGCAACCTCCTTCG
GGACAACCATCAAATCCAAAGAAGAATTCGGCTTCAGGCAGTCATCCAGGTGACATTAAT
AGGGTCGAATGTGATTACCTCTAGATCCATCTCTAGGCTGCTTTCGCTAGGGGATCAAAT
CCGAGTGTTAGATCGGAAGCCAGTTCCATAGCGTTTATGCCCGATGGTTTTCTCAGGTTG
GATCATGATTTATGCCAACAGGACTTGATCGCCACATGCATCATTAAAATATTCCAAACT
TTCGAACATGATGACCTCGTTCAGAGCGAGGGTGTCGACGCGGCCAAGATAGTCGTCGAG
ATCTGCGTGTTGTACACCACTACCAAAGGCGAAAAGCTGGGTCGGGATGAAGGTGCAATC
GTAGCCAATGCTGCCATTGAATTGCAAATGAGCAATCAATCCTGAAGATTACACAACGAG
CTCTCAATGAAAGCACCAATGTCAGTGTCAAAACCACTGATCTTGGGTAGGGGGGCCGAG
CTGTGAGATCGGATCGAGGGCAACATGAGACAAAGAACACAAGGCTTTTACCCAAGATCG
TACCCTCTCGATGAAAATTCTATGTCTTGCTCTTGTTGTATTGATGATGTAGCGATTATA
GCATTTATGTACCTCGATATCGTGAGTTTGTGGGATAAATCCTAGGGGTTATGATGTTGT
GTATCTCTCTCTTCTACGGGCTAAACCCCACGGTTTATATAGGCACCAAGGGATCTAGGG
CTTCATTAATGTCGGTTACCATCTATGGATTACATGCCGAAGGAATCATCCTCGCCCTTG
AGTGCACGCCAATGAAAGCACAACTTCTCCCTAAGCGGTTTTGGTAATTAATAACATATA
TGTCATTGTACTAATGATTCTATCTAGTATATTTCACGAAAAGTTTAATGATGAATTGGC
TAAGAATTGTGAGGAGAACCACTAGATGCAAGTAATAGGATTGTTCAAGCTTCAAGCTTC
AAGACTCTACATTTTACATTTTTTGAGAAATCACATTTGANNNNNNNNNNNNNCCAATAC
TATTAAAAGGGATGAGGTTACTATGTTGATCTGGTTGCTCAAGTGCTTAGANNNTAGCCA
CCAAAAATACTCATGAAGTTCCACCACAAATATTCTGTCCAAACCTCAAAGTCAAATTCG
GTGCCACCAATATTTCCAAACCGGTCCTACTGAGTTTTACCCTAGACAAAACCTATGCGA
AACCCTAACATTTCGGTACCACCAAGTTTGGTTTCGGTCTGACTGAGAAACATTGACCTA
CTTTTTGGTTAGCCATTTGCTATAATCAGAATTTCCGAGTTTTGTAAATCGGTGCCACTG
AGTCTGGTAACTGCCTACGCCAGCCAAATCGGACCCTCCGAGATTCATATATCGGTCTCA
CCAAAAAGCCTAAAGTTGCCACATTTTGTACTAGTC
