| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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 |
No map location |  |
Predicted Genes from contig_79418
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_78725 |
2 |
2754 bp |
MLOC_78725.2 |
Available |
Available |
LOC_Os02g14160.1, FRAME:-1, EVALUE:3e-158, 13102.m01578 protein peroxidase precursor, putative, expressed |
| MLOC_78538 |
8 |
2837 bp |
None |
Available |
Available |
None |
| MLOC_78265 |
2 |
3693 bp |
MLOC_78265.1 |
Available |
Available |
LOC_Os02g30210.2, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13102.m03296 protein OsFBK7 - F-box domain and kelch repeat containing protein, expressed |
| MLOC_78264 |
1 |
1377 bp |
None |
Available |
Available |
LOC_Os05g38260.1, FRAME:+1, EVALUE:7e-16, 13105.m04004 protein retrotransposon protein, putative, unclassified |
CDS Structure of MLOC_78725
CDS Structure of MLOC_78538
CDS Structure of MLOC_78265
CDS Structure of MLOC_78264
Contig Sequence (10668 bp)
>contig_79418 10668 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCTAGGGCATATTTCCAACAGGGAATGGCTCGCAACCCTAGATGCGCAGGGGATGCATAT
AGCCTCGGGGCTAGGGCCAGGGCCGTATGATGGAGGGTGGAAGCGGATCGGCAGCTCTCC
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AGAAAATATAGTTGGGCTAGTAAAATGATGCACCAATTTGTAAAAATAAATTGGGCGTTA
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GAAGTTGGAGAGGGGACCCGAAGTCAAGGCTTCGGGATTTCCGGGCTCATTAGGCGAAGC
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GATGTTACTGCTGGTGAAAAAGCGAGCCATCGATCATTATGGCGATCCTACAGTGGAACT
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GCGCACAACAAGTCTTCGAAAGAGTCCATCTTGGATACAACGTCGTCTTGTACTTCGGGC
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GGACCCCTTAATCCCGGACCCCCTCAGGTGCCAAATGCATGATACATTCCATTTGAGCCA
GCTTAAACAACACTTGGGCCCGAGGTAGTTCCTTTGAAACACCTACCTCTAGTGGGTCCT
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CTGTCATGCAATGGTTACAAGCATCCAAAACGGTTCACCACTAGTGTTTGTTGTGCGTTG
TTGATCATCCATACGACTGACCATGTGTATCGTCCCGTCGTTGTGTACCTTCCGGCAAGA
GCATGTGCGCTCCTCTGCTTTTCATTTTGCCTTAGCTTGTAATGGCTATAAAGCCAGGCT
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GAGCTACTCCTAGTCTCCTACTTTCCCCTTTTGAGATAATAGAAACCCTAGCTCAATTCC
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TCTTAACAGGCGTACAATTATGCATGCATTTGGATGATCGGCTCCCCTATCGATGTTCAT
GGACGAACATGAAGCGTCCACAAACATTCGAAGTGTCCAATTTGACGTGTATGGAGTTGG
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TTGAACGTATATGGTTGACTCAAAGCGAAAAATGCCCTGACTTATAATTTTTCATCTTTT
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TGGAAGAATTACTACTAGTGAAAGAATTACTAGAACCTTATACCCTGTATTGCAGTCTGC
ATATGAGTAGAACCTTGCGTTGTACACCCTCCGTTCACAAATTTAATACTCTCTCTGTTT
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GTAGGAGCCACGTTTTAACGGGGCATCTGAACTACTGAATATTTATCCACAGATAGCTGA
CGCCGAGAGTGATGGGACCAAAAGCTAGCGAGGAACAGCCAGCGGTAGAATCGTATCTTT
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ACACCCCATATAAAGAAACCATCTTTTATACCAATCCCTAGTCTCACACGGTTCCACCCA
CCGCCTCCCCAATCATCCCCTCCGATTTCCTCCAGTTCCCAATCTGTAGCTGCTGCTGCT
GCTGCTCCTTCTGTGGGATTCGTGGATCGGCCCCCTCTTTTCCATTTCAGGTACCTGCCT
TTTGCTCGAATCTACTAGTACTGCTATGTTTGCGCTGCCTGCCCGTCTCCCGCTCCGGCG
CAGAATTGATGGCTTCGTCCTGGATTCGGGAAACCTCGTGATGTTGTTTCCCCTGCAAAA
AATCGATTTTTCTCAGCCTTCTTGCCTTTTGCGCCGGCAATTTCTTCTAATCCGATTGCC
TTCGGCATTAATTCCTAGGCTGAGATTTCAGTTTGCTTTCATAGTCGAGTCTCAGATCCA
CATGCCCATGTATATGTTCTCAGTGGTTGATTACTTCTATGCTGTCGTCTAAATTTGAAG
TAGATCTGAAGTCTGCTGCTCCAGTTTTCCTGGAGGCCACGATCCTTATTTTAATGGTCA
ACTTGTTCAGAATAGAGTCGGATACTGGGGTTCGCTGGGCATCGACCTGTGGTGTCCTCT
GGCTGTTGATTCTTGAGAATTCACATATGATTTATTCATCAGTGATTCAGACTGGTTCCA
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GTCTATGTTTAAAAGGTTGTCTTCTTTGAGAGGAGTTGATTGAGTTTCAGTTCATTATAT
CAAACAGCACATGGATCAGTTCTGCTCTATCATTTTATTATTTGTATAAGGTGAATTGGT
TCGTCACAATAACTTTCAGCTGCTCCCTAAAAGATGTCTTTTCTTGATTGTTATACAAAG
TAATTGGCTCCAGCAATAATCATTTCGAGATTATTTCTGCTACAGAGCCTTATGAGTTAT
AACTGATCCGTAGTTCCTCTTGTGCTAGAAACAGCTACTTGTTTGTCTCATGGCAGAGAG
ATTGATTTTTTCTTATCGTACACGACGATGGCTTAGTCTATATTTGCCCTGTCTGTTGGT
AGTGTCGAACCTCAGGAATTTCTTGTGTCTCCAATAATTAGATGTCCATTTCACCTGCAG
AGCATATGTGTTTTAAGAAATTGCTTATATGAAGATCATGACAGCATTGACATGTTCACG
TCAATTTTAAAATCGGAGATCCTCCTCACACTGTGGATGTCATAGAAAAACTGCTTCTGT
TGTTAAAAGGCAGAGTTTGACAGTTTGTGTTCCTTTCCATTCTCTAGTGACTAATATTAA
AGGAAACTGCTGTAATGAATATTCTGTTATGTTGTTTTAGTGGTGTTACTTTGGAGTTGC
CCAAACAGTATCACTGGATTGCTTCGACAGTCCCTACTTGGTGCTAAATCGTTTTGCCTG
CTGACTGCAGGCAATTAGACTCGCAGAGATGGACACTACTGCTGGCTAATAGTAAAACGA
TTATATGGCCAAAGGTATATATATATTACACCTATTTGTTCCTAACAACTTTGACTGCAA
ATTTAGCTGATATTTTAATATTTATGTTCTGTGGATATAGATATTAGGGCAATGTGCAAG
GGAGGAAACGATTTCTACTTCATCAATAAGGAGACAAGTGCGGATTCAATCAGGCAAAAC
AATTCCAAAAATTCTCATCGGATGGCATTTGATACAGCAAGAATAACTAAAACAGAGACA
TCAAAGTTGAAGAACGTCATTTCAGCATCATTCAAACCCTTGTCTCTGACAATTCCCATA
GGAGACGGATTCCACGAATCGTTCCATTCGAGCCATTGCTATTTATAGTATCTACTAAGG
TTCATAAGTAAGCCAAAGGTTTTCAGTACTATTGGCTAAGAAGGGGAGGCAAACATTGAG
CTGCTTGCTGCCACATTTTGCAATGGTTACAATCGTTGGTACACGGGAACAGTTTGTTCA
ACCACAGTCGTGTCTCCGTGCTACAATGCAGCTCAAGTCCCCAACAAGGCCAAAACTTTC
CTTCTGCTTTACGCCACAAGGGGATTGCGATCAATACTGTGCTTTAATCCCTGGCTTGCC
AGAAGACCTGGCAAAGATATGCCTTGCCCTTGTTCCTCGAACTCATTTTCCTGTCATGGG
TGGAGTATCCAAGAGGTGGATGTCATTCCTAGAGAGCAAAGAATTAATTGCTGTAAGGAA
AGAGGTTCGGAAGCTTGACGAGTGTGTGTACGTCTTGACCACTGATGCTGGAGCAAAGGG
TTCTCATTGGGAGGTTTTGGGATGTCAGGGGCAAAAGAACACCCCTCTTCCGCCTATGCC
TGGACCAACCAAAGCTGGGTTTGGTGTGGTTGTCCTTGATGGGAAGCTCGTGGTCATTGC
TGGCTATGCTGCTGACCATGGCAAGGAATGTGTTTCTGATGAGGTTTACCAGTATGATTG
TTTCCTCAACAGGTATGTTTCTTGTGGATCCTGATGAATCAGAAAAATAATGTACACCTT
ATTAGTCTGACAAACTTTGAAGCTTCACCTTGTGTTTTCAAATAATGTGAATGAATTAAC
AATGGTAACTTGGTGATATGTACAGTGCTCAAATACACAACAATACTTAAGTCATCAACA
TTTTATTGAATGTTGGACCAACTCATTTGTCCTCTGATTCCGCAGGTGGACTGCCATTTC
TAAGATGAATGTTGCTCGTTGTGACTTCGCGTGTGCAGAGGTCAATGGTGTGATATATGT
TGCTGGTGGATTTGGTCCTGATGGTGATAGTTTATCAAGTATCGAAGTTTATGACCCAGA
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TAGCTTTGAAGACAAGATGTACGTCATGGGTGGCCGTTCAAGCTTCACCATTGGTAACTC
CCGTTTCATTGACGTGTACGATACAAATAGCGGTGCCTGGGGTGAGTTTAGGAATGGCTG
TGTAATGGTCACGGCTCATGCTGTTCTTGGTGAGAAGCTCTTCTGCATCGAGTGGAAGAA
CCAGAGGTCTCTGGCGATTTTCAACCCAGCAGACAATTCCTGGCAGAAGGTTCCTGTGCC
GCTTACTGGTAGTTCTAGCACGCGGTTTTCTCTCGGGACACATGACGGGAAATTGCTGCT
CTTCTCACTGGAGGAAGAACCCGGCTATCAGACACTGATGTATGATCCTGCTGCGCCAAC
AGGCTCTGAATGGTGCAAGTCTACGCTCAGGCCATCAGGATCATGCTTGTGCAGCGTGAC
CATCAAAGCCTGATGCTTCAGCTCGGGGTCGCTGAAGGATGATACCCAAGTTACTTCCTG
CCTTGTCTTCCGTGGTTAAGATCAGGCTTTGTTTGGTTTATCATTGGGTCCTACTTGCTA
GAATTTACATCCGCTTGTTGCTCCACCCAATAATAGTATGTTCTTGCTTCAGTTCATTCG
GTTGCTTGCTGACAATGGACTGCCATAATGTACTCTGTTCTCAGTTGTATTGAAAAACTA
TTTGATCATAGAACCTTCAATTTACGTACTCCCTCCGTCTCAAAATAANNNNNNNNNNNN
NNTACTAGCTCTAGTACAAAGTTGTCTTAAGTTTAAGACAGTTATTTTGAGACGGATGGA
GTAGTTTTTTAAGTACTTTTTTTTTACTTTGATATACTCCCTCTGTTCCTAAATATAAGT
CTTTTTAGATATTTCATTACAAACTACATACGGATGTATATAGACATAATTTAATGTGTA
GATTCCTTTATTTTGCTCCATATGTAGTTTGTAGTGAAATATGTAAACGGGCTTATATTT
AAGAACGGAGGGAGTAGTATCAGAGGCTCCTACCATGCTATATTAATTTTTTAATAGAGT
ATTTACATGAGTGTGGGATATGTATCCTCGCATTGGTTCAGATACTTGTAAACAAAACAG
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AGTGCAGTTGAATATCAAATGCTCAATAGCCTCTTCAGCTCCCGAATAGCATAGGATACA
TCTGAACTCATTGCCAATCTGATAGTGTACTAGGAGGCGGAGGTGCGGCGTGCCGCTGCG
CCCGTCGTGAAGCTTGTGCGCGTGGCTGCGTTGTTTTTCTTATAGAAGAAAAGAAGGCAG
CAAGAAAGCGAGTTGGCACTCGGTAATGAGCCAAAAATATGTTCACCCATGATTACAAAC
ACTTGCCATTCCGGAGTACGCAACCGCCACCGCTCATAGTCTTCGCCTTCGTTACTCCCT
CCGTCGTCGTCATCGGAGGCCTACGGGATAAGCCCCGTGGCGGATTGTGGTGGCGAGGAC
GTATGCTGCTTCACCTAGGTGCCTCCAACCCGTTCCTCTTATCCATGGTCCCGGAGCCGC
CAACTCCTCTCCGGTGGGTGTGTGTTGACTCTTCAACTGCCTCTCATACTCGTCACTACC
ATGGGGAGGCCCCGGATGGATCCGGCGGTGATGTTGCGGCTAGGCGGGCGGTGGTACCAC
AGACTGATCTACCTTGGTCATGATCCGGTCGTGTCAGCCCCTTGGCCGACGGGTCTGGTT
TGAGCTATCTCTAGCGAGATGGCAATCGGTGGTGATGTGCTCCAGCGTCGACATTGGTCC
ATGTGGTGACCACTCCGGTTTCTGGCGGCAGCCTCGTCGCGGATTGTGGGGGCATCAAAA
GATCGTTGCGAGGGTTCCTCTATCCAGATCGGGTGGTCGCCTCAGAGTGAGATGGATGAC
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TACCAGTTCTTCAGGGTGGAAACCTAGATTCTAGCCTTTGGTGGTTGGATCCGGTGAAAG
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GTGCTGTCATAAGATGATTGATGTGGATATGGTGATTGTTGTATTTTATCACTTGTGGAT
TTGATCACTTTTATTTTTCCTCTCGCTTAGGCATATCTTTGGTCTTGTATGACTTTGCTA
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GTGTTTGTATCCATCTGATGCTTCATTTTGACTAAACAAAATTCACCATTGAAAAACAAA
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TTGAAAATCTTCTGGTGTAATAAAAGTTGTACAACATGAAGCTTCCTTGGAACTAAAGAA
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GATGAAAAACTGCATCAGTGAACAAAGCAAACTACATAAGGAAGAAACCTGCAGAAAAAA
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GTTGGCAGCTCTGTCAAAAACCCAACAATGCCACTTGTAACGCATACAAGTTTTAGTTCA
CAAAACAACAAAATTTGAATGAAAATACTCTAATTAAAATATAGAACCTTTGACATTATA
GTGCAATGATGATTTCTTTATACACAATATTAAGTAATATATGTTGCATCATGTCACCCT
TAGTTGTGAAAAACAGCACGCGTGAGCAACAAAATTAGAGATGCATTATCAATTAAAATC
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TTCATTTGCTTATCCGTGGGTGCCCTACAAACAAAGTGAAGGTAGAATGAGCAAATAAAT
GCTACACTTTGTACTATTTACAATGTTTCATATGGGTGAGTGTAACTCAACATTTGTGTT
TCACTGTGTTGGCGCTGATTGTCACATTTTCCTAGATTTATTTCAGGCCTCTAGATAGCG
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TGTACTGTGTTCACACTAATGCTCAAATTTTTCTAAGTTTATTTCACGCTCTTTGGTGAT
ATTTGTTTAGTGGGGAAAGACGTTTTCATCGACTACTAAGGTGTGTGCTATGACTTCGTC
AATTTCAAGATATTGTGTCGGTTTAGTATCTGAAAGGTTCTCGGATAGGATGTGAGTGTG
TGCTTCTGTATGGATGAGTGTATGTGCGTATATATAAGCATCTACGTTAGTGTGGGGACC
CCGACTTATAAGTCATGGTCACCGAATGTACGTGCACAGTGAATCCAGAGATCAATGCCC
ATTGGACACACAGAAACTGAATAACAAAAGTCTTACATCCATTACATACCGTTTTATTCA
AATATGGCCTCCATGGCCATGTCTTCATATATTTCAGCGGAAAAGCTTCATCGATAGCGT
GAACCCATGTCATCTAGCTTAACCCTACAGGCATTCTGACTAGGAAGCGTCCTAGCTCGT
ACGAGCTTCACCAAGGTACTCTTCATCATACCATGTTCTCTCATGCCTGGTCAATGAAAT
AATCAGTGGCAAGCCAGTGATTACTTTGAATGTANNNNCAAGCAACCCATGTTTGGAACA
AGACAATAACAATGCATGATGCAGCACTAAGTAGGTATGTTGCAGAAA
