Map Locations of contig_79300 (4094 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_79300

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_78238 1 1029 bp AK358746 Available Available None





CDS Structure of MLOC_78238






Contig Sequence (4094 bp)

>contig_79300 4094 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGTGGTGATCCTGGACACCACCACCCGCCCCACCACGGCAAGCCGCCCAAGCACCACCCC
GGCCCGCCGTCGGGGCCCAAATGCCCGCCGTGCCACCCGCCTCCCACGCCGCGCCCACCG
CCGACTCCGCCGTACGGGCCTCCCACGCCACTGCCACCGCCTTACGTGCCGCCCACGCCG
CCCTACACCCCGCCGTCGCCACCGTACATTCCGCCAAGCCCGCCGTACGTGCCACCAACG
CCACTGCCTCCGCCGTACGTGCCACCATACGTCCCACCGACACCTCCATACACTCCTCCC
TACGTGCCGCCAACCCCGCCATACGTCCCACCGTCGCCGCCCTACGTGCCACCGACACCG
CCATACACGCCGCCGTACGTGCCGCCGTACACGCCGCCGTACGTGCCGCCGCCGTCGCCG
GGGAGGAAGACGTGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGAACGCGTGCGTGGACGTGCTGAGC
GGGCTGGTGCACCTGGTGATCGGGCGGGAGGCGCGGAGCAAGTGCTGCCCGCTGGTGCAG
GGGGTGGCGGACCTGGACGCGGCGCTGTGCCTCTGCACCACCATCCGGGCGCGGGTCCTC
AACATCAACATCTACCTCCCGGTGGCGCTCCGGCTGCTCATCACCTGCGGCAAGCACCCG
CCCAACGGCTTCCAGTGCCCCACCGTCCTCGACGCCTAGCCTAGCCTAGCCTGCATGGCC
GCTCTGGCTCGGCTCTCGCCATAGCTTTACTACCATACTAGCGTGTGGCGTGGGGTGCTA
CAGTGCTTGCTCGCTCCAGTGCTGTGCGTGCCTGCGATTTGTGTGCGTCTCGATCGACCT
CGACCGATTTTCTTGTTCCGTGTTAGTAGTGTGTAGGAGTGTGGCAACTCCATGTGGTTT
CCGGCCAAGTGATGTTGAATAATTAATTAATTAACATGTGCTATTTAGTACCGTACTAGC
AAAAAGGTCCGTCTATTGTAACGGAAGAAAAAAAATATAATTTTCAATTGTGATAATCAC
ATTATGCTCTTAAAATTTTAAGACATTTTTTGAAATGCATGAACATTATTTGAATTATGA
TGAAATGGTAAAATATGTTTTATTAATTAATGATAGCATATGCATAAGAACATTATTTTT
ATCTTGCTGATATACTCCGTATGTGTTTGCATTTGTAATCTAAGTGAAATCTTAATTTGG
TTGCAAACATATTAGACGGTTTCATCGAAAACAATCAATTTATAAGTACATGCATACCAG
ATGTTCAAGTTGCGTATCAATATCGATATTCTTAAAAAATAATTAGCAAAACAGTTTATA
TATATGAAAAATCAAAGCTAAGCCGTTTGTTTACGTAAAGCTTGTATAAACAACATTGTA
TATTTTTTATACATTAGAAACATTTTTTTGCGTGTGACATCAGAAACATTATTGAGTTTT
GATGTCTAATTTTTTTAATACACATTTTACATATTTTGTATGAATCATGAATATTTTTTA
ATTTTTATATACATGTTTTACACTATTCAAATATACGATTAACATTTTTGAAAAGTTATA
TTTTTTATGTTTAATTTGTTCCATACATATTATATATTTTTGTATATGTTTTCTTATACA
CCGGAAACATTTTTCTATGCACATTTAAAGTTTTTTAAATACACGATCACTATTTTTCAA
AATAAAAGAAAATATATTATTTGTTGTTCATACGCACTGTGTATTTTTTTATATATGAAA
ACTTATTTGTCTATAGATTTGACATTTCTTTAATCCATAATTAACATTTGTGCAAATTTT
ATCGAAATAAAGACGAAAGAGAAAAAAAAGTAGAAAAAGTGTGAAATAGAAAAACAAAAA
AGGGGTTGTAGGCCGCGATCGGGATCGAACCTGGGTCTCCAGGATGGACAGCACGCACCC
AAGCGTTTGGCTAGCCTTGTGCTTGTTATAAAATATGGGAACCACATCCTTTAAAATTAA
AAAGAAAGAGCCGAATCGAAGTTCAAAAAACGAATCGTTTTTGTCACTTACGGGTGGCAT
TGGTGGGTAATTTTGGTGAACTTTAGGGCAAATTTAATGACATACCACAGAACCAATAGG
TGCTTTATTAGTAGGTATATATATAGATTTATTGCCCGCTGGGTTTTTTAATACCACTCC
CCTACTGCCCGCTGGTTTTTATTCATGCATTTTATCTTCTTACTTTTTTTCTGAGCGACA
GCGTAATTTTGTGTGTGAAAGAGGTATATGGGCTTGTTGGGCTTTCTGGAATTGTGTGGC
CTGGTACGATGGCGGCAGGTCCGAGTTGTTGGTTTGCCGTCGGGAGCAACGGCAAACCTG
TTTAGCCTCACAGGCGTCGGTTTTGGGAGCTCCTATGCGTCGCTGGCTGCGGCGAACAGC
CGAGCGAGGATGGACCAAGGGTGTTGCTTTCGCGCAAGCCTAGCCACTGATTCCAAACGC
AAGCATTATTTTCAAAAGATTGTTTTTTAAACAAACACTTCTCAAATTTGAGTAGAAACA
AATAAAAAGATCCAACATTTTTTGGATATGTGAACAATTGTTTGATAAATTGAACACTTT
TTGAAAATCACTAACATTTATCAATATGTGAACGCATTTTTATTAAAGCGATTTCCTTTA
AACTCTGAAGAAAAAATTGGAAATGAAATTATGTTTGGAATCCACGGACAATTTTTGAAA
CATGAACAAATTTCAAATTAGTGAACAAAATTATAAAATTGTGAATTTTTTTTGAAATTA
TAAAAAAATTGAAACATGCACAAATTTTAAATTCATGATAGTATAAAATTGTGACCATTT
TCGGAATTGTGAACAAGTTTTGACACAGTGAAATTTTTCAAATTGTAAACAAATTTTGAA
ACATGAACGAATTTCGAATTAGTGAACAAAATTATAAAATTGTGAAACATCTTTCAAATT
GTGAACAAATTTGGAAACTATGAACATTTTTCGAATTGTAAACTAATTTTGAAACATTAT
CAAATTCATGAACAAAATAATAAAATTGTGAACATTTTTTGAATTGTGAACAAACTTTGA
AACCATGAACATTTTTTAAATTGTGAACAAATTTTGAAACATGAATGAATTTTAAGTTAG
TGAACAAAATTATAAAATTATGAACAAAATTGGAAACCATGAACATTTATTGAATTGTGA
ACAAATTTCAAATTCATAAACAAAATTATAAAATTGTGAACATTTTTTGAGTTGTGATAA
TTTTTGAAACCGCGAACATCTTTCGAGTTGTGATAAGTTTTCGAGTTGCCATCGACGCCC
TCGACTTCCTTTGCTTCGGCTAGATGGAAGCCAGCGGCAGCGGGGCGAGGGGCGGAATAC
TTCTTCGATGGCATGGCGGCCGGATGGCGGGAGCGGGAGAAGAATGACGGGAATGACGGG
GAGAAGGGGAAGCAATGAGGAAACGGGAGAAAACGGTGGGAATAGGCCCGTCTATCACCG
ACAGCGCGGGTCCGCATGCATTTTCGCTTCGGCACGCGCCCGAGACGCCCTCGGGGGCTT
GGTTTGGCTTGGGTTCGCCGGTTATTATTTTGACCCAAATCAACGATAAACAAAGAGTTG
GGTAAATTTTTCTGTTTTAACCTTTTGGACAAAGAAAATCCAGTTTTGACCTTCGTTTGA
AAAAAAAAACAAATCTGACCTCTTTACGTGACGCCAACGTCCCTCGCGTCTGGGTTGCAC
GGGAGATGCCACGGACCATGGCGTGTGGTAGGGGCCCGCTCAATCCGCCCCGTCGTTGAC
GAGATGACGTGGCAAAGGGCGAGACGCCACGGGCCATGGCGTTTGGTCCCCAGACCCAAA
CGCCATGCAACCTGGCGTCTCGCTTGGGTAACTTACACAACCCACGGGAGAGTGGGTGGG
ACCCACCCCACTCACTCTTCCCAATCCAGCCCGAGCTTTCTCCTCCTACTATCATTTTCT
CCTCTCTCCAAACCTCACCCCCCCCCTCAAATCCTCTCCAAAAGGTTGTTTCCTTTCGTG
GATCTTTCCATCACCTTGTTGCTTGTGGTAATCTCCTTTTATTCATCCAATTTGTTTTTT
CTTAAATCTTGTTA