| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location | No map location |
Predicted Genes from contig_78944
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
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| MLOC_78158 |
1 |
383 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_78158
Contig Sequence (3520 bp)
>contig_78944 3520 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGAGTAAGTTGGTATTCGGTAACAGCAAGTACTTCAAGTACCTAGTGAGATTATTGCCA
TGATATGTAGATTACAAGCTTGATCCATGTTATGCTATGCTTGATCCATGTTTTCCTGTT
AATTCCATGCCATGCTTAGAATAGTTACAAGCATAGGGCTAGCTTTGTCATCTGCTTGTT
TCGATACTATGTATTTGGTTGTCTTGCGAGTACATTCAAAGTACTCATGTGGCCTTGCTC
GTGGCCAGTTGCAGGAGAAGGTCCGTCGTGCTAGATCATAACCCAACCAGTCCTATGAGT
TATGAAGCCCAACCAAAGTCGTCGCTGCCGCTGAACCAAGACCTCCGTTGCCATTTAGTC
AGCCTTGGAGCTATGTAATATTGTTGTAATCAACAGTATTGTAATACTCCAATATGATCA
ATAAAGCCATTTTGTGTCTGGAATTGCGGTATCATGTCTTTGACGTGTGTGAGGTCTTAT
CCTGGGGCTGGCGTGCGTCGGCCCTCTATCGGGGTGCCACACAAGCCTAATGTTTTGTTG
TCTTTTAGTTTTGCCAGGTTTCTATGTAGCTTGTACTATGTTTTTTAGGATATAAAAATG
TGGTAAGTATTAAAGTCACATACATATGACGTGATAAACTGAAAAATAACAGAAGACTGG
CCTTTGCACAAACAAATACAAAGAAAATTGATAGAGTAACAACAAGTATTTTGCAAACCA
ACCTCTGTTCGGATGTTTAGAGGGACATTGGTATCTCTAACCCATCAGGATTCAGAACTT
GGTGCTTGCATTATTTCTGGATTTATTTCAGGATTTTCGGTGACATGCTTTCAGTGGGAG
GAGACGTTCCCGTCGACGATGAGGCACCTACAATGACTTCTTATATCTCAAGATGATATG
TCGGTTTGGTCTATGAGAGGTGCTCGTAGAGGTAGGGTATGTGTGTATGCATTCATAAGA
GTGAGTATATGCGCGTGTATATGAGCGCTTACGTGTGTATTGTGTTAAACCTTGAATTTG
TATTGGTCAGACGGAATGAACCCCTAAGTCAAAATCCCGATCAATTGTACCCTGAACTAT
GCAATCCCGATCTAAATCAAACCCTCTTATCGTGTCAACTCGGATTTATGTGGTAAGCCG
GCCCGTTTTATTTTTTTAGTTCAAAAAATATTCCAACAAGCACACACCCTAATCCTTGGT
GAGTTAATTTTTGGAAAAAGTCCATTTTAAACCCTGAACTGGTAGCTGTCTGGCGGAATG
AACCCCGAAGTGTAAATCCCTGTCGATTGCACCCTGAAGTAAGAAATCCCAGTTTAAATC
TAACCTTAAAGTGGTTTGCTGGTAAAAATTGATGATGTGGCGGCAGTTAACCAGGATTAT
GATGGGTGGGGCATATCGTCTTAACAACACCCGTAGCCTCCTCCAACGGATACATCCAGT
CGATTGGGGAACGAAGCTAGGGTTCATCGAGCGACGATGGAGGAGAAATCAGAGTGCGAC
GACGGAGGCTGGCGCCGGCGCATGAGAGGGATATGTCGTGGTTGTCGACTGCTGGTGTGT
CTGCTCCAGGACTCCGTCGCGCTATAGGAAGGCGAGCGGCGGATGCGCGTTCGCCAGTGC
GCTACCGCGAGGATGCCATGACGTACGAGCCTGCGAAGTTGTGCTGGTGCGATCCTCGGA
GGAAGGCGTCGCGCTGGATCTCGTGGAGCCGTCAAAATCCAGGAAGGAGACACTACGCCT
GCGTGGATGCGTTGGTGAGTTCCCTATTTCTTTTCCTCCCTGTTTTATTTGTTCTCCTCT
CTGTTCTGATTGTTTCTCCTGTGTGCACTTGAAAAACATGGTGGCTGCGGCTATGTTGAG
TGGCATGACGATGAGCTGCCCAAATTTTTAAGTGACCTCATTGGCGATCTTAGTGATGAG
GTGTGGAGGCTAAAAGGGCAGATGAGTGTGTGTGAAGTGGCATATCACATTGATGATGAA
ACAACAATGATGCTTGTGTCTGTGCAAGATGAACTAAGGAAGAAGAATGAAGAATTGGCT
GCTGTGAAGGCCAAATATGAGAATGTGCAAGATGAATTGAGGAAGAAGAATGAAGAATTT
GCTGCTGTGAAGGTCAAATATGAGAATGTTGTGTTTGTGTTGGGTTTAGTTGCAGGCAAG
ATGTTAATGCAGTGATGGCTTTGTAAGCAATGTAGTTGCACTGCAGTTGCAATTTAGTTT
GCTATGGACAAGTTTGTGTTAAATTGTCTAAATATTTTATGTTAAATTGTGCTCTGTGCA
ATGCAACAAGTTTGTGTTAAATTGTCTGAATATTTAGATCCTAATTGTACTCCAGTACAG
AGCATATAACATCCATAGCATATAGGTCATATAGCATCCATTGCGTCCAAAGCAAGATGT
CAATAACATCCATTACAGGGCATATAGCATCCATAACCTGATACATGTTTGTTCTCAGGC
TATCACAAAAGTAGATGTTTGCAATATTACATTTCAAATGTTTTCAACACTGCAACATCA
TCAAAAGTACTAGAACATGCAAACTGGTGGCATAGCTAGTAGTTTCCACTACAAGTGAGG
TACCGATAGCTTGGAACTGAGGATGCAACCCTTCTTCTTCCTCTGTTCGCTCCAGTTCCT
CTCACTGTAGAAGTAGATGCTCCAGGTGCTGTGACTGAAGATGATCCAGCTGCAGTAGTT
GCAGCTCTCTTCCTTGGAGGCTTGAACTTGTTGGCATTAGTACCAGGTGCAGAGGCTTGT
TGAGCATGAGGTGCACTGGTTCTAGTAGTAGCAGTAGCAGGTGCACTGGTTCTAGCAGTA
GCAGGTGCACTGGTTCTAGCAGTAGCGGGTGCACTGGTTCTTGCTGGTTGTGGTTGTGGT
TGAGATGCAGAGCCAGAACCAGATGCTTGTTGGTATTTGATAAAGACAGAAAATAGTCAC
GCATTTAAAATCATGTAAAAGCATCTGCAAGCATATAATTGACTGAAAGCATTTAAATTC
ATGTAAAAGCATGTGCAAGCATTTAAATTCATATATACCTCAATTGTGCTCTTTTTCTTG
GTAGTTTTGGTGAGACGTGCATTCTTCTTCTTGCCTCTCTTAGGATTCTTTTTGCAGCCT
GACTTGTTGTGTCCAGCATCTCCACACATAGAACATTTAATTATGGTTCCATGTTTGCTC
ATTTTCTTGCCCTTAGGAGCTTTTGTTTCCTCTCTTCTCCTGTCAATTTTTTAGGCCTTC
CAAGCATTCTGACATAACCAGGAGCTTGAGGCCTAGGATTTTGAGACACATGCCACATCT
CCTCCCCTTCCACTGGTGCAAGCAAGGACCATATATTTCCTTGAAAACCTGAACTGAGTA
GCAAGGATGAATATACTCATCAATTGTCTTCTTACACTTGTAGATAACACTAATGGCATG
GTGGCAGGGAGACCAGACAACTGGAAGTAGCCACAAGAGCATGTCCTTGCTTGAAGATCA
ATAGTGTACTGCCCTCCCCTTCCATTGATATGCTTCACTT
